83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_3002 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_3002  polysulphide reductase, NrfD  100 
 
 
468 aa  936    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00130542 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1594  Polysulphide reductase NrfD  60.91 
 
 
463 aa  558  1e-158  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4429  polysulphide reductase, NrfD  61.57 
 
 
466 aa  556  1e-157  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.217558  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3385  Polysulphide reductase NrfD  58.5 
 
 
486 aa  534  1e-150  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.253171 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1464  polysulphide reductase NrfD  57.58 
 
 
471 aa  518  1e-146  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.920048  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4141  polysulphide reductase, NrfD  57.51 
 
 
476 aa  517  1.0000000000000001e-145  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2414  Polysulphide reductase NrfD  53.27 
 
 
451 aa  493  9.999999999999999e-139  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.0075882  normal  0.349671 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1239  polysulphide reductase, NrfD  53.83 
 
 
454 aa  489  1e-137  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.39739  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0842  polysulphide reductase NrfD  55.77 
 
 
482 aa  486  1e-136  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.363179  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3984  Polysulphide reductase NrfD  54.23 
 
 
478 aa  472  1e-132  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.545328  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3933  polysulphide reductase NrfD  54.25 
 
 
493 aa  466  9.999999999999999e-131  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.053608  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0849  Polysulphide reductase NrfD  53.29 
 
 
478 aa  459  9.999999999999999e-129  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0845  Polysulphide reductase NrfD  53.29 
 
 
478 aa  459  9.999999999999999e-129  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.207631  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0797  polysulphide reductase, NrfD  53.01 
 
 
478 aa  456  1e-127  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0223  Polysulphide reductase NrfD  51.84 
 
 
484 aa  455  1e-127  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0527  Polysulphide reductase NrfD  50.11 
 
 
494 aa  447  1.0000000000000001e-124  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3475  Polysulphide reductase NrfD  50.44 
 
 
477 aa  445  1.0000000000000001e-124  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.198201  normal  0.251286 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5666  Polysulphide reductase NrfD  50.99 
 
 
476 aa  446  1.0000000000000001e-124  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.544636  normal  0.989219 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01305  molybdopterin oxidoredutase membrane subunit  53.54 
 
 
593 aa  447  1.0000000000000001e-124  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2712  Polysulphide reductase NrfD  55.91 
 
 
472 aa  442  1e-123  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.544038  normal  0.344395 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5954  Polysulphide reductase NrfD  48.83 
 
 
445 aa  442  1e-123  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.604828  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1636  polysulphide reductase, NrfD  53.03 
 
 
466 aa  436  1e-121  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.513529  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0290  Polysulphide reductase NrfD  50 
 
 
490 aa  435  1e-120  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0581587  hitchhiker  0.000681201 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2211  molybdopterin oxidoreductase  49.01 
 
 
451 aa  434  1e-120  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.554905  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6892  Polysulphide reductase NrfD  52.07 
 
 
454 aa  432  1e-120  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0834  Polysulphide reductase NrfD  47.85 
 
 
448 aa  429  1e-119  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.352451 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5823  polysulphide reductase NrfD  50.91 
 
 
451 aa  425  1e-118  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.110878  normal  0.0226017 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1423  Polysulphide reductase NrfD  52.96 
 
 
603 aa  414  1e-114  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.15148  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0217  polysulphide reductase NrfD  46.3 
 
 
456 aa  390  1e-107  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0161  Polysulphide reductase NrfD  46.53 
 
 
456 aa  391  1e-107  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.116185  normal  0.0186835 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0019  Polysulphide reductase NrfD  45.43 
 
 
461 aa  388  1e-106  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0465805  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6224  polysulphide reductase NrfD  44.77 
 
 
452 aa  384  1e-105  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.468999  normal  0.0125183 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4186  polysulphide reductase, NrfD  44.49 
 
 
456 aa  378  1e-103  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.317108  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2552  molybdopterin oxidoreductase  51.32 
 
 
430 aa  372  1e-102  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0105  Polysulphide reductase NrfD  46.22 
 
 
624 aa  345  1e-93  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00267927 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0124  Polysulphide reductase NrfD  46.28 
 
 
624 aa  342  1e-92  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1812  polysulphide reductase, NrfD  38.83 
 
 
456 aa  310  4e-83  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2775  polysulphide reductase, NrfD  38.88 
 
 
472 aa  305  9.000000000000001e-82  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0295745  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1872  Polysulphide reductase NrfD  43.12 
 
 
448 aa  297  2e-79  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0540714  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1042  polysulphide reductase NrfD  38.69 
 
 
674 aa  241  2e-62  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0482955  normal  0.0753031 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4973  hypothetical protein  29.37 
 
 
666 aa  111  3e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.492562  normal  0.0494168 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1258  Polysulphide reductase NrfD  25.59 
 
 
483 aa  93.6  7e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1759  Polysulphide reductase NrfD  25.69 
 
 
453 aa  90.9  5e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3083  Polysulphide reductase NrfD  23.28 
 
 
448 aa  89.7  9e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4459  hypothetical protein  29.87 
 
 
642 aa  83.6  0.000000000000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1562  Polysulphide reductase NrfD  23.51 
 
 
435 aa  83.2  0.00000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.382538  normal  0.988263 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4923  hypothetical protein  31.1 
 
 
642 aa  79.7  0.00000000000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.116245  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1906  polysulphide reductase, NrfD  29.82 
 
 
413 aa  80.1  0.00000000000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.105136  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1631  Polysulphide reductase NrfD  22.51 
 
 
393 aa  77  0.0000000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13670  polysulphide reductase  25.4 
 
 
414 aa  73.9  0.000000000006  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0454  polysulphide reductase NrfD  24.15 
 
 
389 aa  72  0.00000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2523  Polysulphide reductase NrfD  23.87 
 
 
416 aa  71.6  0.00000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3543  Polysulphide reductase NrfD  28.9 
 
 
469 aa  70.5  0.00000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.400001  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1424  polysulphide reductase, NrfD  22.93 
 
 
416 aa  69.3  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2436  Polysulphide reductase NrfD  22.93 
 
 
416 aa  67.4  0.0000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.136872  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0481  Polysulphide reductase NrfD  21.45 
 
 
413 aa  65.9  0.000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1867  Polysulphide reductase NrfD  23.24 
 
 
411 aa  64.7  0.000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0715566 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2383  Polysulphide reductase NrfD  24.5 
 
 
408 aa  63.2  0.000000009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.290901 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2406  polysulphide reductase NrfD  23.34 
 
 
417 aa  61.2  0.00000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.148885  normal 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3262  Polysulphide reductase NrfD  23.97 
 
 
442 aa  60.1  0.00000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0389204 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27750  polysulphide reductase  22.19 
 
 
388 aa  59.7  0.0000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.273464  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0041  Polysulphide reductase NrfD  21.56 
 
 
383 aa  58.9  0.0000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02130  polysulphide reductase  22.89 
 
 
389 aa  58.9  0.0000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2403  Polysulphide reductase NrfD  23.68 
 
 
406 aa  57.8  0.0000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.418724  normal  0.657025 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2372  Polysulphide reductase NrfD  22.42 
 
 
408 aa  57.4  0.0000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.103022  normal  0.75303 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1845  Polysulphide reductase NrfD  23.51 
 
 
384 aa  55.5  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0829523  normal  0.148655 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0140  polysulphide reductase, NrfD  22.01 
 
 
383 aa  54.7  0.000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1150  polysulphide reductase, NrfD  24.11 
 
 
385 aa  54.7  0.000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0596071  normal  0.937608 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1603  polysulphide reductase, NrfD  23.28 
 
 
385 aa  55.1  0.000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00601969  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0260  Polysulphide reductase NrfD  22.7 
 
 
383 aa  53.5  0.000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1798  Polysulphide reductase NrfD  24.47 
 
 
391 aa  51.6  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2275  reductase, transmembrane subunit, putative  25.09 
 
 
387 aa  51.6  0.00003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27690  polysulphide reductase  22.71 
 
 
384 aa  50.4  0.00006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0146  putative hydrogenase 2 b cytochrome subunit  20.92 
 
 
421 aa  50.4  0.00007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1125  putative hydrogenase 2 b cytochrome subunit  22.11 
 
 
435 aa  49.3  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0066  Polysulphide reductase NrfD  24.07 
 
 
387 aa  48.1  0.0003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.411771 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0707  Polysulphide reductase NrfD  22.66 
 
 
385 aa  47.8  0.0004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4225  Polysulphide reductase NrfD  22.74 
 
 
389 aa  47.4  0.0006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000782128  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2416  hypothetical protein  28.32 
 
 
409 aa  45.4  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.039677  normal  0.33337 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3137  putative hydrogenase 2 b cytochrome subunit  21.48 
 
 
446 aa  44.7  0.004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0274  Polysulphide reductase NrfD  22.67 
 
 
384 aa  44.3  0.005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00211929  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01290  hypothetical protein  20.77 
 
 
458 aa  43.5  0.007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4782  Polysulphide reductase NrfD  22.73 
 
 
400 aa  43.5  0.008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>