83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_3475 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_1636  polysulphide reductase, NrfD  65.13 
 
 		 466 aa  644    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.513529  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01305  molybdopterin oxidoredutase membrane subunit  66.18 
 
 		 593 aa  656    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5666  Polysulphide reductase NrfD  83.19 
 
 		 476 aa  790    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.544636  normal  0.989219 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3475  Polysulphide reductase NrfD  100 
 
 		 477 aa  971    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.198201  normal  0.251286 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2211  molybdopterin oxidoreductase  74.72 
 
 		 451 aa  712    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.554905  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0290  Polysulphide reductase NrfD  70.07 
 
 		 490 aa  629  1e-179  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0581587  hitchhiker  0.000681201 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0527  Polysulphide reductase NrfD  63.77 
 
 		 494 aa  620  1e-176  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1423  Polysulphide reductase NrfD  60.97 
 
 		 603 aa  542  1e-153  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.15148  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0223  Polysulphide reductase NrfD  61.61 
 
 		 484 aa  534  1e-150  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3984  Polysulphide reductase NrfD  59.41 
 
 		 478 aa  505  9.999999999999999e-143  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.545328  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3933  polysulphide reductase NrfD  58.64 
 
 		 493 aa  502  1e-141  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.053608  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2414  Polysulphide reductase NrfD  56.08 
 
 		 451 aa  502  1e-141  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.0075882  normal  0.349671 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1594  Polysulphide reductase NrfD  53.83 
 
 		 463 aa  480  1e-134  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4141  polysulphide reductase, NrfD  53.68 
 
 		 476 aa  465  9.999999999999999e-131  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3002  polysulphide reductase, NrfD  50.44 
 
 		 468 aa  458  9.999999999999999e-129  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00130542 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1464  polysulphide reductase NrfD  54.93 
 
 		 471 aa  457  1e-127  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.920048  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0797  polysulphide reductase, NrfD  51.62 
 
 		 478 aa  444  1e-123  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4429  polysulphide reductase, NrfD  49.34 
 
 		 466 aa  442  1e-123  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.217558  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0849  Polysulphide reductase NrfD  51.4 
 
 		 478 aa  445  1e-123  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3385  Polysulphide reductase NrfD  50.99 
 
 		 486 aa  442  1e-123  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.253171 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0845  Polysulphide reductase NrfD  51.4 
 
 		 478 aa  445  1e-123  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.207631  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0842  polysulphide reductase NrfD  50.53 
 
 		 482 aa  432  1e-120  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.363179  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2712  Polysulphide reductase NrfD  48.53 
 
 		 472 aa  418  1e-116  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.544038  normal  0.344395 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6892  Polysulphide reductase NrfD  47.91 
 
 		 454 aa  399  9.999999999999999e-111  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1239  polysulphide reductase, NrfD  47.92 
 
 		 454 aa  399  9.999999999999999e-111  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.39739  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5823  polysulphide reductase NrfD  46.29 
 
 		 451 aa  385  1e-106  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.110878  normal  0.0226017 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2552  molybdopterin oxidoreductase  48.78 
 
 		 430 aa  370  1e-101  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0834  Polysulphide reductase NrfD  42.57 
 
 		 448 aa  366  1e-100  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.352451 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5954  Polysulphide reductase NrfD  41.42 
 
 		 445 aa  357  2.9999999999999997e-97  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.604828  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0161  Polysulphide reductase NrfD  43.54 
 
 		 456 aa  352  5.9999999999999994e-96  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.116185  normal  0.0186835 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0217  polysulphide reductase NrfD  43.31 
 
 		 456 aa  352  1e-95  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0019  Polysulphide reductase NrfD  41.83 
 
 		 461 aa  349  5e-95  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0465805  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0105  Polysulphide reductase NrfD  45.12 
 
 		 624 aa  343  5e-93  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00267927 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6224  polysulphide reductase NrfD  41.72 
 
 		 452 aa  342  7e-93  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.468999  normal  0.0125183 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0124  Polysulphide reductase NrfD  42.83 
 
 		 624 aa  340  2.9999999999999998e-92  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4186  polysulphide reductase, NrfD  44.04 
 
 		 456 aa  335  1e-90  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.317108  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2775  polysulphide reductase, NrfD  39.91 
 
 		 472 aa  309  6.999999999999999e-83  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0295745  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1812  polysulphide reductase, NrfD  38.76 
 
 		 456 aa  305  9.000000000000001e-82  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1872  Polysulphide reductase NrfD  40.28 
 
 		 448 aa  287  2.9999999999999996e-76  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0540714  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1042  polysulphide reductase NrfD  34.26 
 
 		 674 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0482955  normal  0.0753031 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3083  Polysulphide reductase NrfD  23.16 
 
 		 448 aa  87.8  4e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4973  hypothetical protein  21.81 
 
 		 666 aa  86.3  0.000000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.492562  normal  0.0494168 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13670  polysulphide reductase  24.54 
 
 		 414 aa  84.7  0.000000000000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1631  Polysulphide reductase NrfD  23.78 
 
 		 393 aa  79  0.0000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3543  Polysulphide reductase NrfD  31.67 
 
 		 469 aa  78.2  0.0000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.400001  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1759  Polysulphide reductase NrfD  25.72 
 
 		 453 aa  75.1  0.000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1906  polysulphide reductase, NrfD  28.81 
 
 		 413 aa  73.2  0.000000000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.105136  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0481  Polysulphide reductase NrfD  23.26 
 
 		 413 aa  72  0.00000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1867  Polysulphide reductase NrfD  22.56 
 
 		 411 aa  70.1  0.00000000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0715566 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1258  Polysulphide reductase NrfD  31.06 
 
 		 483 aa  68.6  0.0000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4459  hypothetical protein  25.12 
 
 		 642 aa  68.9  0.0000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4923  hypothetical protein  26 
 
 		 642 aa  68.6  0.0000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.116245  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02130  polysulphide reductase  22.71 
 
 		 389 aa  65.5  0.000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1562  Polysulphide reductase NrfD  23.6 
 
 		 435 aa  65.5  0.000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.382538  normal  0.988263 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27690  polysulphide reductase  23.6 
 
 		 384 aa  64.3  0.000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0454  polysulphide reductase NrfD  22.47 
 
 		 389 aa  63.5  0.000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0260  Polysulphide reductase NrfD  24.23 
 
 		 383 aa  62.8  0.00000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1424  polysulphide reductase, NrfD  23.19 
 
 		 416 aa  61.2  0.00000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2523  Polysulphide reductase NrfD  22.46 
 
 		 416 aa  60.8  0.00000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0707  Polysulphide reductase NrfD  24.07 
 
 		 385 aa  60.1  0.00000009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2406  polysulphide reductase NrfD  23.69 
 
 		 417 aa  58.9  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.148885  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2372  Polysulphide reductase NrfD  23.34 
 
 		 408 aa  58.5  0.0000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.103022  normal  0.75303 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2436  Polysulphide reductase NrfD  22.69 
 
 		 416 aa  58.2  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.136872  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3262  Polysulphide reductase NrfD  27.49 
 
 		 442 aa  58.2  0.0000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0389204 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2403  Polysulphide reductase NrfD  21.73 
 
 		 406 aa  57.4  0.0000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.418724  normal  0.657025 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1603  polysulphide reductase, NrfD  23.2 
 
 		 385 aa  56.6  0.0000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00601969  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0041  Polysulphide reductase NrfD  24 
 
 		 383 aa  55.8  0.000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27750  polysulphide reductase  21.69 
 
 		 388 aa  55.8  0.000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.273464  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0140  polysulphide reductase, NrfD  21.76 
 
 		 383 aa  56.2  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2383  Polysulphide reductase NrfD  26.53 
 
 		 408 aa  54.3  0.000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.290901 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1150  polysulphide reductase, NrfD  21.59 
 
 		 385 aa  52.8  0.00001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0596071  normal  0.937608 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0239  Polysulphide reductase NrfD  22.5 
 
 		 386 aa  52  0.00002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2275  reductase, transmembrane subunit, putative  20.97 
 
 		 387 aa  52.4  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0447  Polysulphide reductase NrfD  20.64 
 
 		 389 aa  50.1  0.00008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.542742  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0066  Polysulphide reductase NrfD  22.58 
 
 		 387 aa  48.9  0.0002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.411771 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1779  polysulphide reductase, NrfD  23 
 
 		 387 aa  48.5  0.0003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.263014 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4225  Polysulphide reductase NrfD  20.96 
 
 		 389 aa  47.8  0.0004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000782128  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1337  Polysulphide reductase NrfD  22.7 
 
 		 304 aa  46.2  0.001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.794344  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0274  Polysulphide reductase NrfD  19.7 
 
 		 384 aa  45.1  0.003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00211929  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2416  hypothetical protein  33.67 
 
 		 409 aa  45.1  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.039677  normal  0.33337 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3986  hypothetical protein  27.78 
 
 		 417 aa  45.1  0.003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.74759  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4229  Polysulphide reductase NrfD  22.7 
 
 		 386 aa  44.7  0.004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4239  nickel-dependent hydrogenase, membrane protein  23.81 
 
 		 443 aa  43.9  0.007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.442151  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>