75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_3984 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_3984  Polysulphide reductase NrfD  100 
 
 		 478 aa  974    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.545328  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2414  Polysulphide reductase NrfD  67.18 
 
 		 451 aa  615  1e-175  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.0075882  normal  0.349671 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3933  polysulphide reductase NrfD  64.33 
 
 		 493 aa  571  1e-161  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.053608  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0223  Polysulphide reductase NrfD  64.47 
 
 		 484 aa  560  1e-158  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0527  Polysulphide reductase NrfD  58.07 
 
 		 494 aa  525  1e-148  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2211  molybdopterin oxidoreductase  57.59 
 
 		 451 aa  523  1e-147  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.554905  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0290  Polysulphide reductase NrfD  57.77 
 
 		 490 aa  522  1e-147  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0581587  hitchhiker  0.000681201 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01305  molybdopterin oxidoredutase membrane subunit  57.11 
 
 		 593 aa  519  1e-146  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1636  polysulphide reductase, NrfD  56.99 
 
 		 466 aa  515  1.0000000000000001e-145  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.513529  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3475  Polysulphide reductase NrfD  59.41 
 
 		 477 aa  503  1e-141  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.198201  normal  0.251286 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5666  Polysulphide reductase NrfD  58 
 
 		 476 aa  495  1e-139  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.544636  normal  0.989219 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3002  polysulphide reductase, NrfD  54.23 
 
 		 468 aa  496  1e-139  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00130542 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0845  Polysulphide reductase NrfD  61.54 
 
 		 478 aa  493  9.999999999999999e-139  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.207631  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0849  Polysulphide reductase NrfD  61.54 
 
 		 478 aa  493  9.999999999999999e-139  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0842  polysulphide reductase NrfD  61.54 
 
 		 482 aa  493  9.999999999999999e-139  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.363179  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4141  polysulphide reductase, NrfD  56.21 
 
 		 476 aa  489  1e-137  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1464  polysulphide reductase NrfD  55.8 
 
 		 471 aa  490  1e-137  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.920048  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0797  polysulphide reductase, NrfD  55.79 
 
 		 478 aa  490  1e-137  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1594  Polysulphide reductase NrfD  54.35 
 
 		 463 aa  488  1e-136  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3385  Polysulphide reductase NrfD  51.67 
 
 		 486 aa  483  1e-135  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.253171 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1423  Polysulphide reductase NrfD  54.11 
 
 		 603 aa  466  9.999999999999999e-131  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.15148  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4429  polysulphide reductase, NrfD  51.09 
 
 		 466 aa  467  9.999999999999999e-131  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.217558  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2712  Polysulphide reductase NrfD  54.15 
 
 		 472 aa  464  1e-129  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.544038  normal  0.344395 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1239  polysulphide reductase, NrfD  51.45 
 
 		 454 aa  459  9.999999999999999e-129  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.39739  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0105  Polysulphide reductase NrfD  52.61 
 
 		 624 aa  427  1e-118  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00267927 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0124  Polysulphide reductase NrfD  51.25 
 
 		 624 aa  420  1e-116  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5954  Polysulphide reductase NrfD  47.09 
 
 		 445 aa  399  9.999999999999999e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.604828  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6892  Polysulphide reductase NrfD  44.96 
 
 		 454 aa  398  1e-109  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2552  molybdopterin oxidoreductase  53.23 
 
 		 430 aa  394  1e-108  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5823  polysulphide reductase NrfD  47.32 
 
 		 451 aa  387  1e-106  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.110878  normal  0.0226017 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0834  Polysulphide reductase NrfD  43.31 
 
 		 448 aa  388  1e-106  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.352451 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0161  Polysulphide reductase NrfD  44.98 
 
 		 456 aa  379  1e-104  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.116185  normal  0.0186835 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0217  polysulphide reductase NrfD  44.75 
 
 		 456 aa  378  1e-103  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0019  Polysulphide reductase NrfD  44.27 
 
 		 461 aa  374  1e-102  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0465805  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1812  polysulphide reductase, NrfD  44.27 
 
 		 456 aa  359  5e-98  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6224  polysulphide reductase NrfD  43.81 
 
 		 452 aa  359  7e-98  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.468999  normal  0.0125183 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2775  polysulphide reductase, NrfD  42.64 
 
 		 472 aa  346  5e-94  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0295745  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4186  polysulphide reductase, NrfD  44.02 
 
 		 456 aa  338  9.999999999999999e-92  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.317108  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1872  Polysulphide reductase NrfD  42.59 
 
 		 448 aa  317  4e-85  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0540714  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1042  polysulphide reductase NrfD  37.91 
 
 		 674 aa  243  5e-63  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0482955  normal  0.0753031 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4973  hypothetical protein  26.58 
 
 		 666 aa  114  3e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.492562  normal  0.0494168 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13670  polysulphide reductase  27.13 
 
 		 414 aa  97.1  6e-19  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1906  polysulphide reductase, NrfD  28.97 
 
 		 413 aa  92  2e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.105136  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3083  Polysulphide reductase NrfD  23.06 
 
 		 448 aa  87.8  4e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4923  hypothetical protein  30.82 
 
 		 642 aa  84.3  0.000000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.116245  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4459  hypothetical protein  30.55 
 
 		 642 aa  84.3  0.000000000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1631  Polysulphide reductase NrfD  24.38 
 
 		 393 aa  82.8  0.00000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1759  Polysulphide reductase NrfD  25.31 
 
 		 453 aa  78.2  0.0000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1867  Polysulphide reductase NrfD  23.63 
 
 		 411 aa  75.9  0.000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0715566 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1258  Polysulphide reductase NrfD  21.57 
 
 		 483 aa  73.6  0.000000000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2523  Polysulphide reductase NrfD  21.64 
 
 		 416 aa  72  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3543  Polysulphide reductase NrfD  21.03 
 
 		 469 aa  69.3  0.0000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.400001  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1424  polysulphide reductase, NrfD  22.25 
 
 		 416 aa  64.7  0.000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2436  Polysulphide reductase NrfD  21.39 
 
 		 416 aa  62  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.136872  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0481  Polysulphide reductase NrfD  23.26 
 
 		 413 aa  61.6  0.00000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02130  polysulphide reductase  25 
 
 		 389 aa  59.7  0.0000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2403  Polysulphide reductase NrfD  23.83 
 
 		 406 aa  57.8  0.0000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.418724  normal  0.657025 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27750  polysulphide reductase  22.26 
 
 		 388 aa  55.5  0.000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.273464  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0226  hypothetical protein  21.67 
 
 		 417 aa  54.7  0.000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.567411  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3262  Polysulphide reductase NrfD  26.19 
 
 		 442 aa  55.1  0.000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0389204 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27690  polysulphide reductase  23.7 
 
 		 384 aa  53.9  0.000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2383  Polysulphide reductase NrfD  24.14 
 
 		 408 aa  53.9  0.000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.290901 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2372  Polysulphide reductase NrfD  22.36 
 
 		 408 aa  52.4  0.00002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.103022  normal  0.75303 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2406  polysulphide reductase NrfD  21.96 
 
 		 417 aa  50.8  0.00006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.148885  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1562  Polysulphide reductase NrfD  21.99 
 
 		 435 aa  50.1  0.00009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.382538  normal  0.988263 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0454  polysulphide reductase NrfD  20.91 
 
 		 389 aa  50.1  0.00009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0140  polysulphide reductase, NrfD  20.44 
 
 		 383 aa  48.5  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4782  Polysulphide reductase NrfD  23.3 
 
 		 400 aa  47.4  0.0005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2416  hypothetical protein  28.93 
 
 		 409 aa  47  0.0008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.039677  normal  0.33337 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1591  hypothetical protein  21.57 
 
 		 413 aa  47  0.0008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1798  Polysulphide reductase NrfD  25.57 
 
 		 391 aa  45.8  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3986  hypothetical protein  23.2 
 
 		 417 aa  45.4  0.002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.74759  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0260  Polysulphide reductase NrfD  22.65 
 
 		 383 aa  44.7  0.003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0066  Polysulphide reductase NrfD  21.28 
 
 		 387 aa  43.9  0.007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.411771 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0041  Polysulphide reductase NrfD  21.2 
 
 		 383 aa  43.1  0.01  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>