44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_4459 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_4459  hypothetical protein  100 
 
 		 642 aa  1183    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4923  hypothetical protein  97.35 
 
 		 642 aa  978    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.116245  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4973  hypothetical protein  70.81 
 
 		 666 aa  667    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.492562  normal  0.0494168 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1042  polysulphide reductase NrfD  35.15 
 
 		 674 aa  197  6e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0482955  normal  0.0753031 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0019  Polysulphide reductase NrfD  29.64 
 
 		 461 aa  152  2e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0465805  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6224  polysulphide reductase NrfD  28.64 
 
 		 452 aa  150  6e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.468999  normal  0.0125183 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0217  polysulphide reductase NrfD  29.35 
 
 		 456 aa  149  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0161  Polysulphide reductase NrfD  29.35 
 
 		 456 aa  149  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.116185  normal  0.0186835 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0849  Polysulphide reductase NrfD  29.04 
 
 		 478 aa  145  3e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0845  Polysulphide reductase NrfD  29.04 
 
 		 478 aa  145  3e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.207631  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0797  polysulphide reductase, NrfD  29.04 
 
 		 478 aa  143  9.999999999999999e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4429  polysulphide reductase, NrfD  27.9 
 
 		 466 aa  142  1.9999999999999998e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.217558  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6892  Polysulphide reductase NrfD  28.64 
 
 		 454 aa  142  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0842  polysulphide reductase NrfD  29.41 
 
 		 482 aa  141  3e-32  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.363179  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3002  polysulphide reductase, NrfD  28.08 
 
 		 468 aa  139  1e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00130542 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5823  polysulphide reductase NrfD  30.63 
 
 		 451 aa  139  2e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.110878  normal  0.0226017 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3984  Polysulphide reductase NrfD  27.62 
 
 		 478 aa  137  6.0000000000000005e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.545328  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1594  Polysulphide reductase NrfD  25.9 
 
 		 463 aa  135  1.9999999999999998e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1239  polysulphide reductase, NrfD  26.45 
 
 		 454 aa  135  3e-30  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.39739  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5954  Polysulphide reductase NrfD  26.97 
 
 		 445 aa  132  3e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.604828  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01305  molybdopterin oxidoredutase membrane subunit  23.75 
 
 		 593 aa  130  9.000000000000001e-29  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1636  polysulphide reductase, NrfD  24.66 
 
 		 466 aa  128  4.0000000000000003e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.513529  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3385  Polysulphide reductase NrfD  26.41 
 
 		 486 aa  127  8.000000000000001e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.253171 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0834  Polysulphide reductase NrfD  30.49 
 
 		 448 aa  127  9e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.352451 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2712  Polysulphide reductase NrfD  28.6 
 
 		 472 aa  126  1e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.544038  normal  0.344395 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1423  Polysulphide reductase NrfD  25.85 
 
 		 603 aa  126  1e-27  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.15148  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4186  polysulphide reductase, NrfD  29.12 
 
 		 456 aa  124  4e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.317108  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0223  Polysulphide reductase NrfD  26.93 
 
 		 484 aa  121  3.9999999999999996e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3933  polysulphide reductase NrfD  25.93 
 
 		 493 aa  119  3e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.053608  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0290  Polysulphide reductase NrfD  27.25 
 
 		 490 aa  117  6e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0581587  hitchhiker  0.000681201 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1464  polysulphide reductase NrfD  28.68 
 
 		 471 aa  116  1.0000000000000001e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.920048  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4141  polysulphide reductase, NrfD  27.63 
 
 		 476 aa  115  2.0000000000000002e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5666  Polysulphide reductase NrfD  25.07 
 
 		 476 aa  113  1.0000000000000001e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.544636  normal  0.989219 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3475  Polysulphide reductase NrfD  24.87 
 
 		 477 aa  110  7.000000000000001e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.198201  normal  0.251286 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2211  molybdopterin oxidoreductase  25.13 
 
 		 451 aa  108  3e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.554905  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0527  Polysulphide reductase NrfD  23.45 
 
 		 494 aa  105  3e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2414  Polysulphide reductase NrfD  24.48 
 
 		 451 aa  105  4e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.0075882  normal  0.349671 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0105  Polysulphide reductase NrfD  24.68 
 
 		 624 aa  100  6e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00267927 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0124  Polysulphide reductase NrfD  25.21 
 
 		 624 aa  97.4  7e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2775  polysulphide reductase, NrfD  24.76 
 
 		 472 aa  89.4  2e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0295745  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1872  Polysulphide reductase NrfD  27.21 
 
 		 448 aa  85.5  0.000000000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0540714  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2552  molybdopterin oxidoreductase  24.86 
 
 		 430 aa  86.3  0.000000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1812  polysulphide reductase, NrfD  24.44 
 
 		 456 aa  79.7  0.0000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5132  cell wall anchor domain-containing protein  63.33 
 
 		 761 aa  52  0.00004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.137427 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>