67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_2416 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_2416  hypothetical protein  100 
 
 		 409 aa  829    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.039677  normal  0.33337 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0226  hypothetical protein  43.88 
 
 		 417 aa  300  3e-80  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.567411  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3986  hypothetical protein  43.15 
 
 		 417 aa  288  2e-76  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.74759  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0800  hypothetical protein  40.37 
 
 		 394 aa  243  6e-63  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.523609  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0848  hypothetical protein  40.65 
 
 		 394 aa  242  7e-63  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0845  hypothetical protein  40.38 
 
 		 394 aa  241  2e-62  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.609913  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0852  hypothetical protein  40.38 
 
 		 394 aa  240  2.9999999999999997e-62  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1591  hypothetical protein  36.78 
 
 		 413 aa  236  5.0000000000000005e-61  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1467  hypothetical protein  34.55 
 
 		 414 aa  223  7e-57  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.800329 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4144  hypothetical protein  34.56 
 
 		 414 aa  219  7e-56  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3382  hypothetical protein  33.01 
 
 		 411 aa  204  2e-51  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.725263  normal  0.261187 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5669  hypothetical protein  34.46 
 
 		 436 aa  196  5.000000000000001e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2999  hypothetical protein  32.92 
 
 		 398 aa  190  4e-47  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00101465 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1242  hypothetical protein  31.11 
 
 		 392 aa  189  9e-47  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01290  hypothetical protein  32.77 
 
 		 458 aa  186  9e-46  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0293  hypothetical protein  31.65 
 
 		 404 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0247634  hitchhiker  0.00128473 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2709  hypothetical protein  35.15 
 
 		 400 aa  176  7e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.227296 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1639  hypothetical protein  32.69 
 
 		 464 aa  175  1.9999999999999998e-42  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.347688  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0524  hypothetical protein  33.25 
 
 		 402 aa  171  1e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.140722  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3930  hypothetical protein  32.08 
 
 		 422 aa  164  3e-39  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0681798  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3472  hypothetical protein  32.68 
 
 		 455 aa  159  8e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0090694  normal  0.166385 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2208  hypothetical protein  32.23 
 
 		 470 aa  156  5.0000000000000005e-37  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0167503  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4432  signal peptide and transmembrane prediction  31.51 
 
 		 304 aa  111  2.0000000000000002e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.181697  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1421  conserved hypothetical protein, membrane  33.49 
 
 		 253 aa  99  1e-19  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.000100005  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2554  hypothetical protein  29.55 
 
 		 346 aa  96.3  8e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.990789  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0831  hypothetical protein  28 
 
 		 344 aa  93.6  5e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.136835 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0104  hypothetical protein  28.57 
 
 		 358 aa  87.4  4e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00147272 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5951  hypothetical protein  26.89 
 
 		 345 aa  84.3  0.000000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1040  hypothetical protein  28.7 
 
 		 353 aa  75.9  0.000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.279399  normal  0.0353846 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1812  polysulphide reductase, NrfD  23.4 
 
 		 456 aa  76.3  0.000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0123  hypothetical protein  30.29 
 
 		 358 aa  75.5  0.000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2775  polysulphide reductase, NrfD  26.09 
 
 		 472 aa  72  0.00000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0295745  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1239  polysulphide reductase, NrfD  23.88 
 
 		 454 aa  67.8  0.0000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.39739  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1955  hypothetical protein  24.92 
 
 		 352 aa  63.9  0.000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.359636  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0220  hypothetical protein  22.68 
 
 		 318 aa  63.5  0.000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0164  hypothetical protein  23 
 
 		 318 aa  63.2  0.000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.489222  normal  0.0160984 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6889  hypothetical protein  22.47 
 
 		 319 aa  60.1  0.00000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3933  polysulphide reductase NrfD  23.08 
 
 		 493 aa  59.3  0.0000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.053608  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6892  Polysulphide reductase NrfD  21.75 
 
 		 454 aa  55.5  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0022  hypothetical protein  23.36 
 
 		 318 aa  54.7  0.000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1875  hypothetical protein  26.82 
 
 		 410 aa  54.7  0.000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.110835  normal  0.701823 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3817  hypothetical protein  26.16 
 
 		 352 aa  54.7  0.000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.438372  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5823  polysulphide reductase NrfD  23.02 
 
 		 451 aa  53.9  0.000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.110878  normal  0.0226017 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0223  Polysulphide reductase NrfD  26.32 
 
 		 484 aa  53.5  0.000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4186  polysulphide reductase, NrfD  23.94 
 
 		 456 aa  53.1  0.00001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.317108  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1464  polysulphide reductase NrfD  38.64 
 
 		 471 aa  52.4  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.920048  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2211  molybdopterin oxidoreductase  22.41 
 
 		 451 aa  51.6  0.00002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.554905  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4141  polysulphide reductase, NrfD  37.5 
 
 		 476 aa  51.6  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4183  hypothetical protein  24.28 
 
 		 348 aa  51.6  0.00002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0845  Polysulphide reductase NrfD  25.22 
 
 		 478 aa  49.3  0.0001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.207631  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0849  Polysulphide reductase NrfD  25.22 
 
 		 478 aa  49.3  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0797  polysulphide reductase, NrfD  25.22 
 
 		 478 aa  49.7  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6224  polysulphide reductase NrfD  26.09 
 
 		 452 aa  48.5  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.468999  normal  0.0125183 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6227  hypothetical protein  21.86 
 
 		 321 aa  48.1  0.0003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.039965  normal  0.0374412 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5666  Polysulphide reductase NrfD  21.99 
 
 		 476 aa  47.8  0.0004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.544636  normal  0.989219 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0842  polysulphide reductase NrfD  23.92 
 
 		 482 aa  47  0.0005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.363179  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3984  Polysulphide reductase NrfD  28.87 
 
 		 478 aa  46.6  0.0008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.545328  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4429  polysulphide reductase, NrfD  24.33 
 
 		 466 aa  45.8  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.217558  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3475  Polysulphide reductase NrfD  33.67 
 
 		 477 aa  45.1  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.198201  normal  0.251286 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3002  polysulphide reductase, NrfD  28.32 
 
 		 468 aa  45.4  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00130542 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01305  molybdopterin oxidoredutase membrane subunit  22.03 
 
 		 593 aa  45.1  0.003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0161  Polysulphide reductase NrfD  22.34 
 
 		 456 aa  44.7  0.003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.116185  normal  0.0186835 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0217  polysulphide reductase NrfD  21.6 
 
 		 456 aa  44.7  0.003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1594  Polysulphide reductase NrfD  31.4 
 
 		 463 aa  44.3  0.004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0527  Polysulphide reductase NrfD  29.55 
 
 		 494 aa  44.3  0.004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5820  hypothetical protein  23.36 
 
 		 329 aa  43.5  0.007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.187366  hitchhiker  0.00937701 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4974  hypothetical protein  24.78 
 
 		 410 aa  43.1  0.01  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.743328  normal  0.0685373 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>