40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_01290 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014230  CA2559_01290  hypothetical protein  100 
 
 		 458 aa  932    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1639  hypothetical protein  63.83 
 
 		 464 aa  634  1e-180  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.347688  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5669  hypothetical protein  41.53 
 
 		 436 aa  289  6e-77  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0293  hypothetical protein  39.94 
 
 		 404 aa  275  2.0000000000000002e-72  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0247634  hitchhiker  0.00128473 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2208  hypothetical protein  38.03 
 
 		 470 aa  256  7e-67  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0167503  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3472  hypothetical protein  41.5 
 
 		 455 aa  254  2.0000000000000002e-66  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0090694  normal  0.166385 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0524  hypothetical protein  39.78 
 
 		 402 aa  240  4e-62  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.140722  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0800  hypothetical protein  36.36 
 
 		 394 aa  192  1e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.523609  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0852  hypothetical protein  35.76 
 
 		 394 aa  189  5.999999999999999e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0848  hypothetical protein  35.45 
 
 		 394 aa  187  3e-46  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3986  hypothetical protein  33.52 
 
 		 417 aa  186  7e-46  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.74759  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2416  hypothetical protein  32.95 
 
 		 409 aa  185  1.0000000000000001e-45  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.039677  normal  0.33337 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0845  hypothetical protein  34.64 
 
 		 394 aa  179  7e-44  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.609913  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0226  hypothetical protein  32.57 
 
 		 417 aa  170  4e-41  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.567411  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1421  conserved hypothetical protein, membrane  36.49 
 
 		 253 aa  157  5.0000000000000005e-37  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.000100005  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4144  hypothetical protein  31.07 
 
 		 414 aa  140  3.9999999999999997e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1467  hypothetical protein  32.22 
 
 		 414 aa  136  6.0000000000000005e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.800329 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1591  hypothetical protein  27.41 
 
 		 413 aa  135  9.999999999999999e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1242  hypothetical protein  26.36 
 
 		 392 aa  134  3.9999999999999996e-30  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3382  hypothetical protein  27 
 
 		 411 aa  132  9e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.725263  normal  0.261187 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2709  hypothetical protein  28.13 
 
 		 400 aa  117  3e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.227296 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3930  hypothetical protein  28.12 
 
 		 422 aa  113  7.000000000000001e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0681798  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2999  hypothetical protein  25.88 
 
 		 398 aa  113  9e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00101465 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2554  hypothetical protein  29.09 
 
 		 346 aa  95.1  3e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.990789  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4432  signal peptide and transmembrane prediction  28.42 
 
 		 304 aa  89  2e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.181697  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0104  hypothetical protein  27.44 
 
 		 358 aa  75.9  0.000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00147272 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0123  hypothetical protein  25.61 
 
 		 358 aa  70.1  0.00000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0831  hypothetical protein  27.15 
 
 		 344 aa  69.7  0.0000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.136835 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1812  polysulphide reductase, NrfD  25.71 
 
 		 456 aa  68.6  0.0000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2775  polysulphide reductase, NrfD  24.68 
 
 		 472 aa  67.8  0.0000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0295745  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4183  hypothetical protein  24.28 
 
 		 348 aa  60.5  0.00000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0223  Polysulphide reductase NrfD  25.29 
 
 		 484 aa  56.6  0.0000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0220  hypothetical protein  25.48 
 
 		 318 aa  55.8  0.000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1955  hypothetical protein  24.15 
 
 		 352 aa  53.9  0.000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.359636  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5951  hypothetical protein  22.54 
 
 		 345 aa  53.1  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0164  hypothetical protein  25.56 
 
 		 318 aa  52  0.00002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.489222  normal  0.0160984 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1239  polysulphide reductase, NrfD  23 
 
 		 454 aa  46.6  0.0009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.39739  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0842  polysulphide reductase NrfD  24.5 
 
 		 482 aa  45.1  0.003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.363179  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2552  molybdopterin oxidoreductase  23.6 
 
 		 430 aa  45.1  0.003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3002  polysulphide reductase, NrfD  20.77 
 
 		 468 aa  43.5  0.008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00130542 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>