40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_0293 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_0293  hypothetical protein  100 
 
 		 404 aa  828    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0247634  hitchhiker  0.00128473 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5669  hypothetical protein  42 
 
 		 436 aa  334  2e-90  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1639  hypothetical protein  37.61 
 
 		 464 aa  302  6.000000000000001e-81  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.347688  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3472  hypothetical protein  45.88 
 
 		 455 aa  301  1e-80  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0090694  normal  0.166385 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0524  hypothetical protein  39.66 
 
 		 402 aa  293  3e-78  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.140722  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2208  hypothetical protein  46.05 
 
 		 470 aa  288  2e-76  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0167503  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01290  hypothetical protein  39.94 
 
 		 458 aa  285  1.0000000000000001e-75  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0226  hypothetical protein  32.21 
 
 		 417 aa  204  2e-51  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.567411  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2416  hypothetical protein  31.65 
 
 		 409 aa  191  2e-47  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.039677  normal  0.33337 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3986  hypothetical protein  32.58 
 
 		 417 aa  171  2e-41  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.74759  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3382  hypothetical protein  26.12 
 
 		 411 aa  138  2e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.725263  normal  0.261187 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0845  hypothetical protein  28.35 
 
 		 394 aa  135  9.999999999999999e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.609913  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0852  hypothetical protein  28.78 
 
 		 394 aa  133  5e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0800  hypothetical protein  28.96 
 
 		 394 aa  132  7.999999999999999e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.523609  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1591  hypothetical protein  27.37 
 
 		 413 aa  132  1.0000000000000001e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0848  hypothetical protein  28.78 
 
 		 394 aa  132  2.0000000000000002e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1467  hypothetical protein  27.58 
 
 		 414 aa  120  3.9999999999999996e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.800329 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4144  hypothetical protein  27.53 
 
 		 414 aa  118  1.9999999999999998e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1421  conserved hypothetical protein, membrane  32.7 
 
 		 253 aa  114  2.0000000000000002e-24  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.000100005  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3930  hypothetical protein  27.12 
 
 		 422 aa  110  4.0000000000000004e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0681798  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2709  hypothetical protein  26.54 
 
 		 400 aa  103  6e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.227296 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2999  hypothetical protein  24.21 
 
 		 398 aa  93.6  5e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00101465 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1242  hypothetical protein  22.08 
 
 		 392 aa  92  2e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2554  hypothetical protein  29.52 
 
 		 346 aa  91.7  2e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.990789  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0104  hypothetical protein  27.72 
 
 		 358 aa  75.9  0.000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00147272 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4432  signal peptide and transmembrane prediction  28.81 
 
 		 304 aa  75.5  0.000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.181697  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0123  hypothetical protein  28.33 
 
 		 358 aa  71.2  0.00000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2775  polysulphide reductase, NrfD  24.74 
 
 		 472 aa  63.2  0.000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0295745  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1812  polysulphide reductase, NrfD  22.84 
 
 		 456 aa  60.1  0.00000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5951  hypothetical protein  23.39 
 
 		 345 aa  57.4  0.0000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0842  polysulphide reductase NrfD  26.09 
 
 		 482 aa  55.1  0.000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.363179  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6889  hypothetical protein  21.13 
 
 		 319 aa  48.1  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0831  hypothetical protein  26.37 
 
 		 344 aa  45.8  0.001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.136835 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0849  Polysulphide reductase NrfD  24.85 
 
 		 478 aa  45.8  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0845  Polysulphide reductase NrfD  24.85 
 
 		 478 aa  45.8  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.207631  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0797  polysulphide reductase, NrfD  24.85 
 
 		 478 aa  46.2  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0223  Polysulphide reductase NrfD  22.1 
 
 		 484 aa  45.4  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2552  molybdopterin oxidoreductase  20.26 
 
 		 430 aa  45.4  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1239  polysulphide reductase, NrfD  20.7 
 
 		 454 aa  43.1  0.009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.39739  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0527  Polysulphide reductase NrfD  22.77 
 
 		 494 aa  43.1  0.01  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>