32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_2554 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_2554  hypothetical protein  100 
 
 		 346 aa  676    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.990789  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0104  hypothetical protein  31.34 
 
 		 358 aa  104  2e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00147272 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3986  hypothetical protein  30.59 
 
 		 417 aa  101  2e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.74759  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2416  hypothetical protein  29.77 
 
 		 409 aa  100  3e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.039677  normal  0.33337 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0226  hypothetical protein  29.97 
 
 		 417 aa  99.4  9e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.567411  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1591  hypothetical protein  28.38 
 
 		 413 aa  94.7  2e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01290  hypothetical protein  29.22 
 
 		 458 aa  94.4  3e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0848  hypothetical protein  29.21 
 
 		 394 aa  92.8  7e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1421  conserved hypothetical protein, membrane  30.77 
 
 		 253 aa  90.5  3e-17  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.000100005  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0845  hypothetical protein  28.57 
 
 		 394 aa  90.5  4e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.609913  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1639  hypothetical protein  29.6 
 
 		 464 aa  90.1  5e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.347688  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0852  hypothetical protein  29.43 
 
 		 394 aa  89.7  7e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1242  hypothetical protein  24.79 
 
 		 392 aa  89.4  9e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0800  hypothetical protein  29.43 
 
 		 394 aa  87.8  2e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.523609  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2999  hypothetical protein  27.15 
 
 		 398 aa  87.4  3e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00101465 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2208  hypothetical protein  27.62 
 
 		 470 aa  87.4  3e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0167503  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0293  hypothetical protein  25.63 
 
 		 404 aa  86.7  6e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0247634  hitchhiker  0.00128473 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0123  hypothetical protein  28.37 
 
 		 358 aa  86.3  7e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5669  hypothetical protein  25.5 
 
 		 436 aa  84.3  0.000000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2709  hypothetical protein  30.17 
 
 		 400 aa  80.1  0.00000000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.227296 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3472  hypothetical protein  28.42 
 
 		 455 aa  78.2  0.0000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0090694  normal  0.166385 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0524  hypothetical protein  25.52 
 
 		 402 aa  76.3  0.0000000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.140722  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4144  hypothetical protein  26.14 
 
 		 414 aa  69.3  0.00000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4432  signal peptide and transmembrane prediction  31.82 
 
 		 304 aa  69.3  0.0000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.181697  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3930  hypothetical protein  23.92 
 
 		 422 aa  67  0.0000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0681798  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1467  hypothetical protein  25.07 
 
 		 414 aa  66.2  0.0000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.800329 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3382  hypothetical protein  22.6 
 
 		 411 aa  63.9  0.000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.725263  normal  0.261187 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0831  hypothetical protein  30.58 
 
 		 344 aa  56.6  0.0000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.136835 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5951  hypothetical protein  30.45 
 
 		 345 aa  54.3  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5820  hypothetical protein  28.32 
 
 		 329 aa  52.4  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.187366  hitchhiker  0.00937701 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6889  hypothetical protein  27.53 
 
 		 319 aa  48.9  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1955  hypothetical protein  28.57 
 
 		 352 aa  45.1  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.359636  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>