39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_4144 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_4144  hypothetical protein  100 
 
 		 414 aa  822    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1467  hypothetical protein  94.2 
 
 		 414 aa  763    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.800329 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1242  hypothetical protein  38.21 
 
 		 392 aa  284  3.0000000000000004e-75  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1591  hypothetical protein  38.54 
 
 		 413 aa  276  6e-73  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3382  hypothetical protein  36.32 
 
 		 411 aa  262  8.999999999999999e-69  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.725263  normal  0.261187 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0226  hypothetical protein  34.59 
 
 		 417 aa  225  1e-57  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.567411  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2999  hypothetical protein  35.44 
 
 		 398 aa  224  3e-57  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00101465 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2416  hypothetical protein  34.56 
 
 		 409 aa  220  5e-56  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.039677  normal  0.33337 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3986  hypothetical protein  34.56 
 
 		 417 aa  219  8.999999999999998e-56  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.74759  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0845  hypothetical protein  38.16 
 
 		 394 aa  212  1e-53  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.609913  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0852  hypothetical protein  38.41 
 
 		 394 aa  210  3e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0800  hypothetical protein  37.06 
 
 		 394 aa  209  5e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.523609  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0848  hypothetical protein  38.11 
 
 		 394 aa  209  1e-52  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2709  hypothetical protein  34.88 
 
 		 400 aa  160  5e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.227296 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3930  hypothetical protein  32.16 
 
 		 422 aa  147  4.0000000000000006e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0681798  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01290  hypothetical protein  31.07 
 
 		 458 aa  142  9.999999999999999e-33  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5669  hypothetical protein  30.21 
 
 		 436 aa  131  2.0000000000000002e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0524  hypothetical protein  28.7 
 
 		 402 aa  131  3e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.140722  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4432  signal peptide and transmembrane prediction  30.55 
 
 		 304 aa  119  7.999999999999999e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.181697  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1639  hypothetical protein  26.8 
 
 		 464 aa  117  3.9999999999999997e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.347688  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0293  hypothetical protein  27.95 
 
 		 404 aa  116  7.999999999999999e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0247634  hitchhiker  0.00128473 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3472  hypothetical protein  33.47 
 
 		 455 aa  112  1.0000000000000001e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0090694  normal  0.166385 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0831  hypothetical protein  28.31 
 
 		 344 aa  105  1e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.136835 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2208  hypothetical protein  29.58 
 
 		 470 aa  97.8  3e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0167503  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1421  conserved hypothetical protein, membrane  32.87 
 
 		 253 aa  87  5e-16  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.000100005  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5951  hypothetical protein  27.31 
 
 		 345 aa  86.7  8e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0220  hypothetical protein  25.08 
 
 		 318 aa  77.4  0.0000000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0164  hypothetical protein  25 
 
 		 318 aa  77.4  0.0000000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.489222  normal  0.0160984 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6889  hypothetical protein  26.69 
 
 		 319 aa  77  0.0000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1955  hypothetical protein  25.83 
 
 		 352 aa  72.8  0.00000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.359636  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5820  hypothetical protein  26.77 
 
 		 329 aa  71.6  0.00000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.187366  hitchhiker  0.00937701 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0022  hypothetical protein  25.91 
 
 		 318 aa  68.2  0.0000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2554  hypothetical protein  27.76 
 
 		 346 aa  64.3  0.000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.990789  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6227  hypothetical protein  25.95 
 
 		 321 aa  59.3  0.0000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.039965  normal  0.0374412 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3817  hypothetical protein  25.91 
 
 		 352 aa  52  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.438372  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0104  hypothetical protein  26.55 
 
 		 358 aa  49.3  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00147272 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2775  polysulphide reductase, NrfD  22.16 
 
 		 472 aa  47  0.0006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0295745  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1040  hypothetical protein  25.4 
 
 		 353 aa  45.8  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.279399  normal  0.0353846 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4924  hypothetical protein  26.9 
 
 		 409 aa  44.3  0.004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0637585  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>