21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_4924 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011757  Mchl_4924  hypothetical protein  100 
 
 
409 aa  761    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0637585  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4460  hypothetical protein  99.02 
 
 
409 aa  755    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4974  hypothetical protein  86.34 
 
 
410 aa  538  9.999999999999999e-153  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.743328  normal  0.0685373 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1040  hypothetical protein  48.02 
 
 
353 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.279399  normal  0.0353846 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1955  hypothetical protein  39.14 
 
 
352 aa  138  2e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.359636  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3817  hypothetical protein  38.15 
 
 
352 aa  104  3e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.438372  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2416  hypothetical protein  26.47 
 
 
409 aa  67.8  0.0000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.039677  normal  0.33337 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1591  hypothetical protein  28.68 
 
 
413 aa  61.6  0.00000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1467  hypothetical protein  27.38 
 
 
414 aa  60.5  0.00000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.800329 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4144  hypothetical protein  27.64 
 
 
414 aa  58.5  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0226  hypothetical protein  26.55 
 
 
417 aa  58.2  0.0000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.567411  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2999  hypothetical protein  26.95 
 
 
398 aa  57.4  0.0000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00101465 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5951  hypothetical protein  30.08 
 
 
345 aa  55.8  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3382  hypothetical protein  25.74 
 
 
411 aa  55.1  0.000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.725263  normal  0.261187 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1242  hypothetical protein  25.35 
 
 
392 aa  49.3  0.0001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3986  hypothetical protein  23.26 
 
 
417 aa  49.7  0.0001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.74759  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0848  hypothetical protein  28.33 
 
 
394 aa  45.8  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0852  hypothetical protein  28.49 
 
 
394 aa  46.2  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0800  hypothetical protein  27.14 
 
 
394 aa  46.2  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.523609  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2208  hypothetical protein  26.47 
 
 
470 aa  44.3  0.004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0167503  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5669  hypothetical protein  25.84 
 
 
436 aa  43.5  0.007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>