62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_3986 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_3986  hypothetical protein  100 
 
 		 417 aa  839    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.74759  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2416  hypothetical protein  43.15 
 
 		 409 aa  302  9e-81  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.039677  normal  0.33337 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0226  hypothetical protein  40.1 
 
 		 417 aa  277  3e-73  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.567411  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0800  hypothetical protein  41.01 
 
 		 394 aa  255  9e-67  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.523609  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0852  hypothetical protein  40.74 
 
 		 394 aa  254  3e-66  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0848  hypothetical protein  40.48 
 
 		 394 aa  252  8.000000000000001e-66  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0845  hypothetical protein  39.69 
 
 		 394 aa  251  2e-65  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.609913  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1591  hypothetical protein  36.72 
 
 		 413 aa  242  9e-63  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1467  hypothetical protein  35.22 
 
 		 414 aa  231  2e-59  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.800329 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4144  hypothetical protein  34.19 
 
 		 414 aa  223  4.9999999999999996e-57  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3382  hypothetical protein  33.06 
 
 		 411 aa  209  8e-53  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.725263  normal  0.261187 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2999  hypothetical protein  33.07 
 
 		 398 aa  208  2e-52  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00101465 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1242  hypothetical protein  35.37 
 
 		 392 aa  202  8e-51  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3930  hypothetical protein  33.9 
 
 		 422 aa  194  2e-48  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0681798  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0524  hypothetical protein  32.82 
 
 		 402 aa  192  7e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.140722  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01290  hypothetical protein  33.52 
 
 		 458 aa  192  8e-48  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2709  hypothetical protein  36.36 
 
 		 400 aa  184  2.0000000000000003e-45  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.227296 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1639  hypothetical protein  30.09 
 
 		 464 aa  175  9.999999999999999e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.347688  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0293  hypothetical protein  31.74 
 
 		 404 aa  170  4e-41  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0247634  hitchhiker  0.00128473 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5669  hypothetical protein  30.92 
 
 		 436 aa  165  1.0000000000000001e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2208  hypothetical protein  31.34 
 
 		 470 aa  153  5e-36  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0167503  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3472  hypothetical protein  29.21 
 
 		 455 aa  144  4e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0090694  normal  0.166385 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4432  signal peptide and transmembrane prediction  28.62 
 
 		 304 aa  129  1.0000000000000001e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.181697  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1421  conserved hypothetical protein, membrane  36.15 
 
 		 253 aa  122  9.999999999999999e-27  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.000100005  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0831  hypothetical protein  29.43 
 
 		 344 aa  107  3e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.136835 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2554  hypothetical protein  30.42 
 
 		 346 aa  95.1  2e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.990789  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5951  hypothetical protein  26.8 
 
 		 345 aa  95.1  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1955  hypothetical protein  24.57 
 
 		 352 aa  86.3  9e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.359636  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0104  hypothetical protein  28.88 
 
 		 358 aa  78.6  0.0000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00147272 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6889  hypothetical protein  22.01 
 
 		 319 aa  72  0.00000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0123  hypothetical protein  27.07 
 
 		 358 aa  69.7  0.00000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4183  hypothetical protein  20.53 
 
 		 348 aa  62.4  0.00000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2775  polysulphide reductase, NrfD  24.21 
 
 		 472 aa  61.2  0.00000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0295745  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1040  hypothetical protein  29.06 
 
 		 353 aa  60.1  0.00000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.279399  normal  0.0353846 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1812  polysulphide reductase, NrfD  25.32 
 
 		 456 aa  60.5  0.00000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0223  Polysulphide reductase NrfD  30.83 
 
 		 484 aa  60.1  0.00000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3817  hypothetical protein  26.45 
 
 		 352 aa  59.3  0.0000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.438372  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1239  polysulphide reductase, NrfD  26.39 
 
 		 454 aa  59.7  0.0000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.39739  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01305  molybdopterin oxidoredutase membrane subunit  24.87 
 
 		 593 aa  57.8  0.0000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1636  polysulphide reductase, NrfD  24.35 
 
 		 466 aa  55.5  0.000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.513529  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5820  hypothetical protein  22.12 
 
 		 329 aa  54.7  0.000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.187366  hitchhiker  0.00937701 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1464  polysulphide reductase NrfD  32.12 
 
 		 471 aa  53.9  0.000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.920048  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4141  polysulphide reductase, NrfD  32.12 
 
 		 476 aa  52.4  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0527  Polysulphide reductase NrfD  30.91 
 
 		 494 aa  51.2  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3475  Polysulphide reductase NrfD  26.95 
 
 		 477 aa  50.4  0.00006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.198201  normal  0.251286 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2211  molybdopterin oxidoreductase  25.36 
 
 		 451 aa  50.1  0.00008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.554905  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3984  Polysulphide reductase NrfD  23.2 
 
 		 478 aa  48.9  0.0002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.545328  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1423  Polysulphide reductase NrfD  25 
 
 		 603 aa  48.5  0.0002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.15148  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5666  Polysulphide reductase NrfD  23.08 
 
 		 476 aa  47.8  0.0004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.544636  normal  0.989219 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2552  molybdopterin oxidoreductase  26.04 
 
 		 430 aa  47.4  0.0005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4429  polysulphide reductase, NrfD  26.4 
 
 		 466 aa  47  0.0006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.217558  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0290  Polysulphide reductase NrfD  23.2 
 
 		 490 aa  47  0.0006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0581587  hitchhiker  0.000681201 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6227  hypothetical protein  21.71 
 
 		 321 aa  47  0.0007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.039965  normal  0.0374412 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1875  hypothetical protein  24.39 
 
 		 410 aa  47  0.0007  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.110835  normal  0.701823 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0220  hypothetical protein  23.05 
 
 		 318 aa  46.6  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0797  polysulphide reductase, NrfD  25.4 
 
 		 478 aa  45.8  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0845  Polysulphide reductase NrfD  25.4 
 
 		 478 aa  45.8  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.207631  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0849  Polysulphide reductase NrfD  25.4 
 
 		 478 aa  45.8  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0164  hypothetical protein  23.05 
 
 		 318 aa  45.4  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.489222  normal  0.0160984 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6892  Polysulphide reductase NrfD  24.83 
 
 		 454 aa  45.1  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0842  polysulphide reductase NrfD  22.3 
 
 		 482 aa  43.9  0.006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.363179  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3933  polysulphide reductase NrfD  23.36 
 
 		 493 aa  43.1  0.009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.053608  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>