39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_4183 on replicon NC_007959
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007959  Nham_4183  hypothetical protein  100 
 
 		 348 aa  649    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6889  hypothetical protein  53.93 
 
 		 319 aa  243  3e-63  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0220  hypothetical protein  48.58 
 
 		 318 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0164  hypothetical protein  48.58 
 
 		 318 aa  233  5e-60  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.489222  normal  0.0160984 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5820  hypothetical protein  59.49 
 
 		 329 aa  228  9e-59  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.187366  hitchhiker  0.00937701 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6227  hypothetical protein  53.58 
 
 		 321 aa  220  3e-56  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.039965  normal  0.0374412 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0022  hypothetical protein  49.64 
 
 		 318 aa  204  2e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1242  hypothetical protein  30.55 
 
 		 392 aa  151  2e-35  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0845  hypothetical protein  30.84 
 
 		 394 aa  132  1.0000000000000001e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.609913  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1591  hypothetical protein  27.3 
 
 		 413 aa  124  3e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5951  hypothetical protein  32.91 
 
 		 345 aa  118  9.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4432  signal peptide and transmembrane prediction  33.56 
 
 		 304 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.181697  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2999  hypothetical protein  26.88 
 
 		 398 aa  114  3e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00101465 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0831  hypothetical protein  34.04 
 
 		 344 aa  107  3e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.136835 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0800  hypothetical protein  29.71 
 
 		 394 aa  104  3e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.523609  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0852  hypothetical protein  28.7 
 
 		 394 aa  100  5e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0848  hypothetical protein  28.12 
 
 		 394 aa  98.2  2e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0226  hypothetical protein  23.25 
 
 		 417 aa  95.1  1e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.567411  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3382  hypothetical protein  23.08 
 
 		 411 aa  94  3e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.725263  normal  0.261187 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4144  hypothetical protein  27.89 
 
 		 414 aa  92.8  8e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1467  hypothetical protein  27.42 
 
 		 414 aa  90.5  3e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.800329 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3986  hypothetical protein  22.51 
 
 		 417 aa  87.4  3e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.74759  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01290  hypothetical protein  25.26 
 
 		 458 aa  76.3  0.0000000000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2416  hypothetical protein  24.32 
 
 		 409 aa  75.1  0.000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.039677  normal  0.33337 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1639  hypothetical protein  24.01 
 
 		 464 aa  73.2  0.000000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.347688  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2709  hypothetical protein  26.86 
 
 		 400 aa  69.3  0.00000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.227296 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0123  hypothetical protein  29.7 
 
 		 358 aa  68.9  0.0000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0104  hypothetical protein  30.05 
 
 		 358 aa  69.3  0.0000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00147272 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1955  hypothetical protein  28.27 
 
 		 352 aa  62.4  0.00000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.359636  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1421  conserved hypothetical protein, membrane  24.06 
 
 		 253 aa  62  0.00000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.000100005  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0524  hypothetical protein  21.14 
 
 		 402 aa  57.4  0.0000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.140722  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3817  hypothetical protein  29.41 
 
 		 352 aa  52  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.438372  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2208  hypothetical protein  23.08 
 
 		 470 aa  51.6  0.00002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0167503  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3930  hypothetical protein  22.19 
 
 		 422 aa  51.2  0.00003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0681798  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5669  hypothetical protein  20.98 
 
 		 436 aa  49.3  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2554  hypothetical protein  26.07 
 
 		 346 aa  49.3  0.0001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.990789  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1040  hypothetical protein  30.13 
 
 		 353 aa  48.5  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.279399  normal  0.0353846 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3472  hypothetical protein  21.99 
 
 		 455 aa  43.9  0.005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0090694  normal  0.166385 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0293  hypothetical protein  20.4 
 
 		 404 aa  43.5  0.006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0247634  hitchhiker  0.00128473 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>