38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_1639 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009441  Fjoh_1639  hypothetical protein  100 
 
 
464 aa  944    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.347688  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01290  hypothetical protein  63.83 
 
 
458 aa  615  1e-175  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0293  hypothetical protein  37.82 
 
 
404 aa  291  2e-77  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0247634  hitchhiker  0.00128473 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5669  hypothetical protein  40.16 
 
 
436 aa  280  3e-74  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3472  hypothetical protein  39.06 
 
 
455 aa  255  1.0000000000000001e-66  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0090694  normal  0.166385 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2208  hypothetical protein  36.1 
 
 
470 aa  240  4e-62  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0167503  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0524  hypothetical protein  36.68 
 
 
402 aa  220  3e-56  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.140722  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2416  hypothetical protein  32.69 
 
 
409 aa  175  1.9999999999999998e-42  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.039677  normal  0.33337 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3986  hypothetical protein  32.12 
 
 
417 aa  168  2e-40  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.74759  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0226  hypothetical protein  31.27 
 
 
417 aa  168  2e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.567411  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1421  conserved hypothetical protein, membrane  34.77 
 
 
253 aa  154  2e-36  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.000100005  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0845  hypothetical protein  32.25 
 
 
394 aa  151  2e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.609913  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0800  hypothetical protein  31.47 
 
 
394 aa  148  2.0000000000000003e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.523609  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0852  hypothetical protein  30.83 
 
 
394 aa  147  3e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0848  hypothetical protein  30.29 
 
 
394 aa  144  3e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3382  hypothetical protein  25.56 
 
 
411 aa  131  2.0000000000000002e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.725263  normal  0.261187 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1467  hypothetical protein  27.5 
 
 
414 aa  120  3.9999999999999996e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.800329 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4144  hypothetical protein  26.8 
 
 
414 aa  115  2.0000000000000002e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1591  hypothetical protein  26.84 
 
 
413 aa  110  5e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2999  hypothetical protein  26.15 
 
 
398 aa  105  2e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00101465 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3930  hypothetical protein  27.18 
 
 
422 aa  102  2e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0681798  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1242  hypothetical protein  23.86 
 
 
392 aa  98.6  2e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2709  hypothetical protein  24.71 
 
 
400 aa  94.7  3e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.227296 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2554  hypothetical protein  29.6 
 
 
346 aa  90.9  4e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.990789  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4432  signal peptide and transmembrane prediction  27.43 
 
 
304 aa  76.6  0.0000000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.181697  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0104  hypothetical protein  27.44 
 
 
358 aa  73.9  0.000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00147272 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0123  hypothetical protein  26.83 
 
 
358 aa  70.1  0.00000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1812  polysulphide reductase, NrfD  22.82 
 
 
456 aa  66.2  0.000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2775  polysulphide reductase, NrfD  23.91 
 
 
472 aa  65.9  0.000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0295745  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0831  hypothetical protein  21.58 
 
 
344 aa  61.6  0.00000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.136835 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4183  hypothetical protein  25.73 
 
 
348 aa  58.2  0.0000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0223  Polysulphide reductase NrfD  22.39 
 
 
484 aa  48.9  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5951  hypothetical protein  24.17 
 
 
345 aa  47  0.0007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1955  hypothetical protein  22.22 
 
 
352 aa  47  0.0007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.359636  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6889  hypothetical protein  22.08 
 
 
319 aa  47  0.0008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2552  molybdopterin oxidoreductase  25.38 
 
 
430 aa  45.1  0.003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1239  polysulphide reductase, NrfD  23.68 
 
 
454 aa  44.3  0.004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.39739  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0220  hypothetical protein  22.46 
 
 
318 aa  43.9  0.006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>