39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_0104 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_0104  hypothetical protein  100 
 
 		 358 aa  704    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00147272 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0123  hypothetical protein  93.3 
 
 		 358 aa  583  1.0000000000000001e-165  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2554  hypothetical protein  32.39 
 
 		 346 aa  103  4e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.990789  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2416  hypothetical protein  28.02 
 
 		 409 aa  95.5  1e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.039677  normal  0.33337 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0848  hypothetical protein  27.51 
 
 		 394 aa  89.7  8e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0524  hypothetical protein  27.19 
 
 		 402 aa  89  1e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.140722  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0845  hypothetical protein  27.84 
 
 		 394 aa  87  4e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.609913  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1242  hypothetical protein  28.67 
 
 		 392 aa  86.7  6e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0852  hypothetical protein  27.22 
 
 		 394 aa  85.9  9e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3986  hypothetical protein  25.57 
 
 		 417 aa  85.1  0.000000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.74759  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2999  hypothetical protein  27.05 
 
 		 398 aa  84  0.000000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00101465 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0800  hypothetical protein  26.92 
 
 		 394 aa  82.4  0.00000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.523609  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1591  hypothetical protein  25.45 
 
 		 413 aa  79.7  0.00000000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01290  hypothetical protein  27 
 
 		 458 aa  79  0.0000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0226  hypothetical protein  23.12 
 
 		 417 aa  78.6  0.0000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.567411  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1639  hypothetical protein  24.33 
 
 		 464 aa  78.6  0.0000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.347688  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0831  hypothetical protein  30.87 
 
 		 344 aa  78.2  0.0000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.136835 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0293  hypothetical protein  27 
 
 		 404 aa  77.4  0.0000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0247634  hitchhiker  0.00128473 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2208  hypothetical protein  24.92 
 
 		 470 aa  75.9  0.000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0167503  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3382  hypothetical protein  24.49 
 
 		 411 aa  73.9  0.000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.725263  normal  0.261187 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5951  hypothetical protein  31.62 
 
 		 345 aa  69.3  0.00000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1421  conserved hypothetical protein, membrane  27.81 
 
 		 253 aa  67  0.0000000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.000100005  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4432  signal peptide and transmembrane prediction  29.41 
 
 		 304 aa  65.5  0.000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.181697  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6889  hypothetical protein  28.71 
 
 		 319 aa  64.3  0.000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2709  hypothetical protein  26.67 
 
 		 400 aa  63.2  0.000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.227296 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3472  hypothetical protein  25.79 
 
 		 455 aa  58.5  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0090694  normal  0.166385 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4183  hypothetical protein  28.38 
 
 		 348 aa  58.5  0.0000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5669  hypothetical protein  27.33 
 
 		 436 aa  58.5  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1812  polysulphide reductase, NrfD  21.19 
 
 		 456 aa  54.7  0.000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2775  polysulphide reductase, NrfD  20.4 
 
 		 472 aa  52.8  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0295745  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1239  polysulphide reductase, NrfD  26.92 
 
 		 454 aa  51.6  0.00002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.39739  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0797  polysulphide reductase, NrfD  23.33 
 
 		 478 aa  51.2  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4144  hypothetical protein  25.79 
 
 		 414 aa  50.4  0.00005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0849  Polysulphide reductase NrfD  23.06 
 
 		 478 aa  50.1  0.00006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0845  Polysulphide reductase NrfD  23.06 
 
 		 478 aa  50.1  0.00006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.207631  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6224  polysulphide reductase NrfD  24 
 
 		 452 aa  48.1  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.468999  normal  0.0125183 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1467  hypothetical protein  24.84 
 
 		 414 aa  48.5  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.800329 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3930  hypothetical protein  23.6 
 
 		 422 aa  47.8  0.0003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0681798  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0842  polysulphide reductase NrfD  21.91 
 
 		 482 aa  45.1  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.363179  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>