82 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeh_0797 on replicon NC_007760
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007760  Adeh_0797  polysulphide reductase, NrfD  100 
 
 
478 aa  963    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0842  polysulphide reductase NrfD  78.99 
 
 
482 aa  743    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.363179  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0849  Polysulphide reductase NrfD  98.12 
 
 
478 aa  952    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0845  Polysulphide reductase NrfD  98.12 
 
 
478 aa  952    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.207631  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2712  Polysulphide reductase NrfD  56.32 
 
 
472 aa  512  1e-144  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.544038  normal  0.344395 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1594  Polysulphide reductase NrfD  56.6 
 
 
463 aa  493  9.999999999999999e-139  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3984  Polysulphide reductase NrfD  55.79 
 
 
478 aa  486  1e-136  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.545328  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3385  Polysulphide reductase NrfD  55.14 
 
 
486 aa  484  1e-135  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.253171 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4141  polysulphide reductase, NrfD  55.01 
 
 
476 aa  477  1e-133  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3933  polysulphide reductase NrfD  53.91 
 
 
493 aa  474  1e-132  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.053608  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2414  Polysulphide reductase NrfD  53.21 
 
 
451 aa  469  1.0000000000000001e-131  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.0075882  normal  0.349671 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1464  polysulphide reductase NrfD  55.63 
 
 
471 aa  468  1.0000000000000001e-131  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.920048  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4429  polysulphide reductase, NrfD  52.52 
 
 
466 aa  466  9.999999999999999e-131  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.217558  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3002  polysulphide reductase, NrfD  53.01 
 
 
468 aa  468  9.999999999999999e-131  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00130542 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0290  Polysulphide reductase NrfD  52.51 
 
 
490 aa  459  9.999999999999999e-129  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0581587  hitchhiker  0.000681201 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0527  Polysulphide reductase NrfD  49.78 
 
 
494 aa  456  1e-127  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1239  polysulphide reductase, NrfD  50.8 
 
 
454 aa  455  1e-127  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.39739  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01305  molybdopterin oxidoredutase membrane subunit  50.77 
 
 
593 aa  454  1.0000000000000001e-126  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1636  polysulphide reductase, NrfD  51.1 
 
 
466 aa  453  1.0000000000000001e-126  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.513529  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0223  Polysulphide reductase NrfD  49.9 
 
 
484 aa  449  1e-125  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3475  Polysulphide reductase NrfD  51.62 
 
 
477 aa  446  1.0000000000000001e-124  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.198201  normal  0.251286 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2211  molybdopterin oxidoreductase  51.59 
 
 
451 aa  446  1.0000000000000001e-124  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.554905  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5666  Polysulphide reductase NrfD  52.27 
 
 
476 aa  443  1e-123  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.544636  normal  0.989219 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1423  Polysulphide reductase NrfD  48.89 
 
 
603 aa  417  9.999999999999999e-116  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.15148  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5954  Polysulphide reductase NrfD  46.82 
 
 
445 aa  412  1e-114  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.604828  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6892  Polysulphide reductase NrfD  47.14 
 
 
454 aa  409  1e-113  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5823  polysulphide reductase NrfD  45.95 
 
 
451 aa  392  1e-107  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.110878  normal  0.0226017 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6224  polysulphide reductase NrfD  49.48 
 
 
452 aa  381  1e-104  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.468999  normal  0.0125183 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0217  polysulphide reductase NrfD  47.19 
 
 
456 aa  379  1e-104  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0161  Polysulphide reductase NrfD  46.94 
 
 
456 aa  377  1e-103  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.116185  normal  0.0186835 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0019  Polysulphide reductase NrfD  47.04 
 
 
461 aa  372  1e-102  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0465805  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2552  molybdopterin oxidoreductase  49.38 
 
 
430 aa  372  1e-102  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0834  Polysulphide reductase NrfD  46.11 
 
 
448 aa  362  1e-98  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.352451 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4186  polysulphide reductase, NrfD  46.15 
 
 
456 aa  361  2e-98  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.317108  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0105  Polysulphide reductase NrfD  48.96 
 
 
624 aa  356  5e-97  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00267927 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1812  polysulphide reductase, NrfD  42.55 
 
 
456 aa  350  4e-95  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0124  Polysulphide reductase NrfD  45.2 
 
 
624 aa  348  8e-95  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2775  polysulphide reductase, NrfD  41.11 
 
 
472 aa  340  4e-92  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0295745  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1872  Polysulphide reductase NrfD  42.97 
 
 
448 aa  288  2e-76  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0540714  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1042  polysulphide reductase NrfD  40.7 
 
 
674 aa  244  3e-63  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0482955  normal  0.0753031 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4973  hypothetical protein  27.9 
 
 
666 aa  119  9e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.492562  normal  0.0494168 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13670  polysulphide reductase  28.05 
 
 
414 aa  99.8  9e-20  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4459  hypothetical protein  28.27 
 
 
642 aa  97.8  4e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2436  Polysulphide reductase NrfD  26.02 
 
 
416 aa  89.7  1e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.136872  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1424  polysulphide reductase, NrfD  25.82 
 
 
416 aa  89.7  1e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2523  Polysulphide reductase NrfD  25.63 
 
 
416 aa  89  2e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1759  Polysulphide reductase NrfD  24.26 
 
 
453 aa  88.6  3e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3083  Polysulphide reductase NrfD  22.15 
 
 
448 aa  87.8  3e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4923  hypothetical protein  27.47 
 
 
642 aa  87.4  5e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.116245  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1906  polysulphide reductase, NrfD  28.12 
 
 
413 aa  84.3  0.000000000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.105136  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1258  Polysulphide reductase NrfD  23.84 
 
 
483 aa  80.5  0.00000000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2406  polysulphide reductase NrfD  24.88 
 
 
417 aa  79  0.0000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.148885  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1631  Polysulphide reductase NrfD  21.09 
 
 
393 aa  72.8  0.00000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1867  Polysulphide reductase NrfD  23.63 
 
 
411 aa  72  0.00000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0715566 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3543  Polysulphide reductase NrfD  21.64 
 
 
469 aa  69.7  0.0000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.400001  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0481  Polysulphide reductase NrfD  23.46 
 
 
413 aa  64.7  0.000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1150  polysulphide reductase, NrfD  24.01 
 
 
385 aa  61.2  0.00000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0596071  normal  0.937608 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1603  polysulphide reductase, NrfD  24.05 
 
 
385 aa  60.5  0.00000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00601969  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0260  Polysulphide reductase NrfD  22.86 
 
 
383 aa  59.7  0.0000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3262  Polysulphide reductase NrfD  22.73 
 
 
442 aa  56.6  0.000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0389204 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2372  Polysulphide reductase NrfD  22.87 
 
 
408 aa  56.6  0.000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.103022  normal  0.75303 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02130  polysulphide reductase  21.76 
 
 
389 aa  55.5  0.000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27750  polysulphide reductase  22.29 
 
 
388 aa  55.8  0.000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.273464  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0524  hypothetical protein  19.9 
 
 
402 aa  55.8  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.140722  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0454  polysulphide reductase NrfD  22.52 
 
 
389 aa  54.7  0.000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0140  polysulphide reductase, NrfD  23.42 
 
 
383 aa  53.9  0.000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2383  Polysulphide reductase NrfD  22.93 
 
 
408 aa  53.5  0.000009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.290901 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0041  Polysulphide reductase NrfD  23.34 
 
 
383 aa  51.6  0.00003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0239  Polysulphide reductase NrfD  23.23 
 
 
386 aa  51.6  0.00003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2271  molybdopterin oxidoreductase, transmembrane subunit, putative  28.97 
 
 
419 aa  51.2  0.00004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1562  Polysulphide reductase NrfD  22.67 
 
 
435 aa  49.7  0.0001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.382538  normal  0.988263 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27690  polysulphide reductase  22.59 
 
 
384 aa  49.3  0.0001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2416  hypothetical protein  25.22 
 
 
409 aa  49.3  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.039677  normal  0.33337 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0104  hypothetical protein  25.62 
 
 
358 aa  47.8  0.0005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00147272 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0226  hypothetical protein  20.96 
 
 
417 aa  47.8  0.0005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.567411  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1798  Polysulphide reductase NrfD  23.29 
 
 
391 aa  47.4  0.0005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2687  Polysulphide reductase NrfD  28.04 
 
 
417 aa  47.4  0.0006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.046719 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2403  Polysulphide reductase NrfD  20.91 
 
 
406 aa  45.4  0.002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.418724  normal  0.657025 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0707  Polysulphide reductase NrfD  22.48 
 
 
385 aa  45.8  0.002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2935  molybdopterin oxidoreductase, transmembrane subunit, putative  25.64 
 
 
418 aa  45.1  0.003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.52066  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3382  hypothetical protein  23.28 
 
 
411 aa  45.1  0.003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.725263  normal  0.261187 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0273  molybdopterin oxidoreductase, transmembrane subunit, putative  29.25 
 
 
409 aa  44.3  0.004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>