43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_6889 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_6889  hypothetical protein  100 
 
 		 319 aa  597  1e-170  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5820  hypothetical protein  76.21 
 
 		 329 aa  355  6.999999999999999e-97  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.187366  hitchhiker  0.00937701 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6227  hypothetical protein  55.62 
 
 		 321 aa  253  4.0000000000000004e-66  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.039965  normal  0.0374412 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0220  hypothetical protein  53.71 
 
 		 318 aa  248  8e-65  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0164  hypothetical protein  53.38 
 
 		 318 aa  246  3e-64  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.489222  normal  0.0160984 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4183  hypothetical protein  52.32 
 
 		 348 aa  225  8e-58  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0022  hypothetical protein  54.35 
 
 		 318 aa  219  3e-56  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1242  hypothetical protein  30 
 
 		 392 aa  147  2.0000000000000003e-34  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0831  hypothetical protein  36.51 
 
 		 344 aa  119  4.9999999999999996e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.136835 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2999  hypothetical protein  26.85 
 
 		 398 aa  113  5e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00101465 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4432  signal peptide and transmembrane prediction  34.74 
 
 		 304 aa  110  2.0000000000000002e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.181697  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1591  hypothetical protein  26.13 
 
 		 413 aa  108  1e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0845  hypothetical protein  28.53 
 
 		 394 aa  102  9e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.609913  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4144  hypothetical protein  27.03 
 
 		 414 aa  97.8  2e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5951  hypothetical protein  32.74 
 
 		 345 aa  97.8  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3382  hypothetical protein  25.7 
 
 		 411 aa  97.1  3e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.725263  normal  0.261187 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1467  hypothetical protein  26.16 
 
 		 414 aa  93.2  5e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.800329 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3986  hypothetical protein  23.66 
 
 		 417 aa  84.7  0.000000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.74759  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0852  hypothetical protein  25.88 
 
 		 394 aa  82.4  0.000000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0848  hypothetical protein  25.88 
 
 		 394 aa  81.6  0.00000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0226  hypothetical protein  26.17 
 
 		 417 aa  79.7  0.00000000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.567411  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0800  hypothetical protein  26.2 
 
 		 394 aa  79  0.0000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.523609  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2416  hypothetical protein  22.86 
 
 		 409 aa  78.2  0.0000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.039677  normal  0.33337 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0104  hypothetical protein  29.7 
 
 		 358 aa  71.2  0.00000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00147272 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2709  hypothetical protein  28.08 
 
 		 400 aa  70.5  0.00000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.227296 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1955  hypothetical protein  28.33 
 
 		 352 aa  67.4  0.0000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.359636  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0123  hypothetical protein  28.71 
 
 		 358 aa  65.9  0.000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1421  conserved hypothetical protein, membrane  26.18 
 
 		 253 aa  60.1  0.00000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.000100005  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2554  hypothetical protein  28.04 
 
 		 346 aa  58.9  0.0000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.990789  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0293  hypothetical protein  21.43 
 
 		 404 aa  58.5  0.0000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0247634  hitchhiker  0.00128473 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2208  hypothetical protein  23.74 
 
 		 470 aa  55.5  0.000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0167503  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01290  hypothetical protein  21.31 
 
 		 458 aa  55.1  0.000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1639  hypothetical protein  21.16 
 
 		 464 aa  55.1  0.000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.347688  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2775  polysulphide reductase, NrfD  24.1 
 
 		 472 aa  48.5  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0295745  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1812  polysulphide reductase, NrfD  24.86 
 
 		 456 aa  48.9  0.0001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3930  hypothetical protein  22.6 
 
 		 422 aa  47.4  0.0004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0681798  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1239  polysulphide reductase, NrfD  25 
 
 		 454 aa  47.4  0.0004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.39739  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5669  hypothetical protein  21.16 
 
 		 436 aa  46.6  0.0006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0223  Polysulphide reductase NrfD  24.34 
 
 		 484 aa  45.4  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0105  Polysulphide reductase NrfD  29.95 
 
 		 624 aa  44.7  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00267927 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3817  hypothetical protein  28.67 
 
 		 352 aa  45.1  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.438372  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1875  hypothetical protein  28.62 
 
 		 410 aa  44.3  0.003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.110835  normal  0.701823 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02130  polysulphide reductase  41.82 
 
 		 389 aa  43.1  0.007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>