37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_0220 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_0220  hypothetical protein  100 
 
 		 318 aa  591  1e-168  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0164  hypothetical protein  96.86 
 
 		 318 aa  514  1e-144  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.489222  normal  0.0160984 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0022  hypothetical protein  81.45 
 
 		 318 aa  402  1e-111  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6227  hypothetical protein  68.85 
 
 		 321 aa  321  9.999999999999999e-87  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.039965  normal  0.0374412 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6889  hypothetical protein  53.71 
 
 		 319 aa  233  4.0000000000000004e-60  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5820  hypothetical protein  53.25 
 
 		 329 aa  220  3e-56  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.187366  hitchhiker  0.00937701 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4183  hypothetical protein  47.76 
 
 		 348 aa  210  2e-53  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0831  hypothetical protein  34.38 
 
 		 344 aa  128  2.0000000000000002e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.136835 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1242  hypothetical protein  27.91 
 
 		 392 aa  122  9.999999999999999e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4432  signal peptide and transmembrane prediction  35.4 
 
 		 304 aa  104  2e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.181697  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1591  hypothetical protein  24.76 
 
 		 413 aa  97.8  2e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5951  hypothetical protein  33.02 
 
 		 345 aa  95.9  8e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2999  hypothetical protein  26.56 
 
 		 398 aa  94  3e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00101465 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0226  hypothetical protein  28.03 
 
 		 417 aa  87.8  2e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.567411  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3382  hypothetical protein  23.68 
 
 		 411 aa  83.6  0.000000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.725263  normal  0.261187 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4144  hypothetical protein  25.4 
 
 		 414 aa  83.2  0.000000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0845  hypothetical protein  26.62 
 
 		 394 aa  79.3  0.00000000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.609913  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1467  hypothetical protein  24.12 
 
 		 414 aa  79  0.0000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.800329 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0800  hypothetical protein  25.42 
 
 		 394 aa  75.5  0.000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.523609  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0852  hypothetical protein  24.41 
 
 		 394 aa  74.3  0.000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1955  hypothetical protein  28.57 
 
 		 352 aa  74.3  0.000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.359636  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0848  hypothetical protein  24.41 
 
 		 394 aa  73.6  0.000000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1421  conserved hypothetical protein, membrane  26.56 
 
 		 253 aa  73.2  0.000000000006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.000100005  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2416  hypothetical protein  22.67 
 
 		 409 aa  72.8  0.000000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.039677  normal  0.33337 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01290  hypothetical protein  25.43 
 
 		 458 aa  67.8  0.0000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3986  hypothetical protein  22.37 
 
 		 417 aa  56.6  0.0000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.74759  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1639  hypothetical protein  21.74 
 
 		 464 aa  55.5  0.000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.347688  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2709  hypothetical protein  26.3 
 
 		 400 aa  54.7  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.227296 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0104  hypothetical protein  26.37 
 
 		 358 aa  48.1  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00147272 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3930  hypothetical protein  22.04 
 
 		 422 aa  46.6  0.0006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0681798  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3817  hypothetical protein  29.83 
 
 		 352 aa  45.4  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.438372  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2208  hypothetical protein  22.73 
 
 		 470 aa  45.4  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0167503  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2554  hypothetical protein  26.8 
 
 		 346 aa  44.7  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.990789  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1239  polysulphide reductase, NrfD  24.14 
 
 		 454 aa  44.3  0.002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.39739  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0842  polysulphide reductase NrfD  26.21 
 
 		 482 aa  43.1  0.006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.363179  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0123  hypothetical protein  26.42 
 
 		 358 aa  42.7  0.008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0524  hypothetical protein  22.86 
 
 		 402 aa  42.4  0.009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.140722  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>