40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_3817 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_3817  hypothetical protein  100 
 
 		 352 aa  660    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.438372  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1955  hypothetical protein  86.65 
 
 		 352 aa  532  1e-150  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.359636  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1040  hypothetical protein  45.37 
 
 		 353 aa  139  6e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.279399  normal  0.0353846 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4974  hypothetical protein  38.87 
 
 		 410 aa  134  3e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.743328  normal  0.0685373 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4460  hypothetical protein  39.38 
 
 		 409 aa  127  3e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4924  hypothetical protein  39.38 
 
 		 409 aa  125  9e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0637585  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1242  hypothetical protein  28.08 
 
 		 392 aa  112  1.0000000000000001e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4432  signal peptide and transmembrane prediction  32.47 
 
 		 304 aa  100  4e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.181697  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0226  hypothetical protein  25.9 
 
 		 417 aa  99.8  7e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.567411  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0848  hypothetical protein  29.9 
 
 		 394 aa  98.6  1e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0852  hypothetical protein  30.61 
 
 		 394 aa  97.1  4e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1591  hypothetical protein  29.01 
 
 		 413 aa  96.7  5e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0800  hypothetical protein  30.61 
 
 		 394 aa  95.5  1e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.523609  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0845  hypothetical protein  31.61 
 
 		 394 aa  93.2  6e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.609913  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5951  hypothetical protein  30.72 
 
 		 345 aa  85.9  9e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3986  hypothetical protein  25.38 
 
 		 417 aa  85.9  0.000000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.74759  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3382  hypothetical protein  27.61 
 
 		 411 aa  83.6  0.000000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.725263  normal  0.261187 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4144  hypothetical protein  26.58 
 
 		 414 aa  83.2  0.000000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1467  hypothetical protein  25.84 
 
 		 414 aa  82.8  0.000000000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.800329 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2999  hypothetical protein  24.22 
 
 		 398 aa  81.6  0.00000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00101465 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2709  hypothetical protein  30.82 
 
 		 400 aa  78.6  0.0000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.227296 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2416  hypothetical protein  27.13 
 
 		 409 aa  75.9  0.000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.039677  normal  0.33337 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5820  hypothetical protein  32.76 
 
 		 329 aa  74.3  0.000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.187366  hitchhiker  0.00937701 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0220  hypothetical protein  30.03 
 
 		 318 aa  71.6  0.00000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0164  hypothetical protein  30.03 
 
 		 318 aa  70.5  0.00000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.489222  normal  0.0160984 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3930  hypothetical protein  26.11 
 
 		 422 aa  67.4  0.0000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0681798  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0022  hypothetical protein  29.31 
 
 		 318 aa  62  0.00000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6889  hypothetical protein  30.72 
 
 		 319 aa  60.1  0.00000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6227  hypothetical protein  32.07 
 
 		 321 aa  59.3  0.0000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.039965  normal  0.0374412 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0831  hypothetical protein  30.28 
 
 		 344 aa  58.5  0.0000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.136835 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2208  hypothetical protein  27.27 
 
 		 470 aa  57  0.0000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0167503  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0524  hypothetical protein  23.4 
 
 		 402 aa  55.1  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.140722  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5669  hypothetical protein  21.23 
 
 		 436 aa  54.3  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1639  hypothetical protein  24.07 
 
 		 464 aa  53.1  0.000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.347688  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01290  hypothetical protein  23.81 
 
 		 458 aa  52.8  0.000008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4183  hypothetical protein  28.41 
 
 		 348 aa  50.1  0.00007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3472  hypothetical protein  25.84 
 
 		 455 aa  48.9  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0090694  normal  0.166385 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1421  conserved hypothetical protein, membrane  24.51 
 
 		 253 aa  49.3  0.0001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.000100005  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2554  hypothetical protein  31.33 
 
 		 346 aa  48.9  0.0001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.990789  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0104  hypothetical protein  25.82 
 
 		 358 aa  46.6  0.0007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00147272 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>