21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_4460 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_4460  hypothetical protein  100 
 
 		 409 aa  761    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4924  hypothetical protein  99.02 
 
 		 409 aa  755    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0637585  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4974  hypothetical protein  86.59 
 
 		 410 aa  540  9.999999999999999e-153  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.743328  normal  0.0685373 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1955  hypothetical protein  39.76 
 
 		 352 aa  142  9.999999999999999e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.359636  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1040  hypothetical protein  47.42 
 
 		 353 aa  137  4e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.279399  normal  0.0353846 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3817  hypothetical protein  38.15 
 
 		 352 aa  106  8e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.438372  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2416  hypothetical protein  26.47 
 
 		 409 aa  65.9  0.000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.039677  normal  0.33337 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1591  hypothetical protein  27.55 
 
 		 413 aa  64.3  0.000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2999  hypothetical protein  27.34 
 
 		 398 aa  58.2  0.0000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00101465 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5951  hypothetical protein  30.08 
 
 		 345 aa  56.2  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1467  hypothetical protein  27.79 
 
 		 414 aa  56.2  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.800329 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0226  hypothetical protein  26.69 
 
 		 417 aa  55.5  0.000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.567411  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4144  hypothetical protein  26.56 
 
 		 414 aa  54.3  0.000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3382  hypothetical protein  25.41 
 
 		 411 aa  53.1  0.000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.725263  normal  0.261187 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1242  hypothetical protein  25.7 
 
 		 392 aa  52.4  0.00002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0852  hypothetical protein  28.25 
 
 		 394 aa  49.3  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0800  hypothetical protein  27.75 
 
 		 394 aa  49.3  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.523609  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3986  hypothetical protein  22.9 
 
 		 417 aa  48.5  0.0002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.74759  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0848  hypothetical protein  27.79 
 
 		 394 aa  48.9  0.0002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2208  hypothetical protein  26.47 
 
 		 470 aa  44.3  0.004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0167503  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5669  hypothetical protein  25.23 
 
 		 436 aa  43.9  0.005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>