33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_5669 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_5669  hypothetical protein  100 
 
 		 436 aa  890    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3472  hypothetical protein  63.88 
 
 		 455 aa  578  1e-164  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0090694  normal  0.166385 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2208  hypothetical protein  46.32 
 
 		 470 aa  387  1e-106  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0167503  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0293  hypothetical protein  42 
 
 		 404 aa  322  7e-87  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0247634  hitchhiker  0.00128473 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01290  hypothetical protein  40.68 
 
 		 458 aa  292  7e-78  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1639  hypothetical protein  39.34 
 
 		 464 aa  288  2e-76  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.347688  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0524  hypothetical protein  36.93 
 
 		 402 aa  264  3e-69  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.140722  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0226  hypothetical protein  35.94 
 
 		 417 aa  209  6e-53  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.567411  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2416  hypothetical protein  33.18 
 
 		 409 aa  197  3e-49  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.039677  normal  0.33337 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3986  hypothetical protein  30.84 
 
 		 417 aa  156  6e-37  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.74759  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0800  hypothetical protein  31.55 
 
 		 394 aa  153  7e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.523609  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0852  hypothetical protein  32.44 
 
 		 394 aa  153  7e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0848  hypothetical protein  32.14 
 
 		 394 aa  150  3e-35  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0845  hypothetical protein  33.44 
 
 		 394 aa  149  1.0000000000000001e-34  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.609913  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1591  hypothetical protein  27.91 
 
 		 413 aa  146  6e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1421  conserved hypothetical protein, membrane  39.53 
 
 		 253 aa  141  1.9999999999999998e-32  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.000100005  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3930  hypothetical protein  28.65 
 
 		 422 aa  134  1.9999999999999998e-30  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0681798  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3382  hypothetical protein  27.95 
 
 		 411 aa  132  2.0000000000000002e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.725263  normal  0.261187 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4144  hypothetical protein  30.21 
 
 		 414 aa  131  3e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1467  hypothetical protein  29.77 
 
 		 414 aa  129  9.000000000000001e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.800329 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2709  hypothetical protein  27.52 
 
 		 400 aa  111  2.0000000000000002e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.227296 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2999  hypothetical protein  26.57 
 
 		 398 aa  103  7e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00101465 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1242  hypothetical protein  23.47 
 
 		 392 aa  85.1  0.000000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2554  hypothetical protein  27.43 
 
 		 346 aa  83.2  0.000000000000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.990789  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4432  signal peptide and transmembrane prediction  29.28 
 
 		 304 aa  80.9  0.00000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.181697  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0831  hypothetical protein  25.74 
 
 		 344 aa  63.5  0.000000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.136835 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1812  polysulphide reductase, NrfD  23.9 
 
 		 456 aa  59.3  0.0000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0104  hypothetical protein  27.33 
 
 		 358 aa  58.9  0.0000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00147272 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2775  polysulphide reductase, NrfD  21.79 
 
 		 472 aa  54.7  0.000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0295745  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0123  hypothetical protein  25.75 
 
 		 358 aa  50.8  0.00005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1239  polysulphide reductase, NrfD  27.27 
 
 		 454 aa  50.8  0.00005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.39739  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0223  Polysulphide reductase NrfD  25.14 
 
 		 484 aa  46.2  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1955  hypothetical protein  21.7 
 
 		 352 aa  43.1  0.009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.359636  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>