39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_0831 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011365  Gdia_0831  hypothetical protein  100 
 
 
344 aa  643    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.136835 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1591  hypothetical protein  35.73 
 
 
413 aa  162  6e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1242  hypothetical protein  31.42 
 
 
392 aa  148  1.0000000000000001e-34  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2999  hypothetical protein  31.11 
 
 
398 aa  139  6e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00101465 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0226  hypothetical protein  30.82 
 
 
417 aa  125  1e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.567411  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1467  hypothetical protein  31.02 
 
 
414 aa  123  5e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.800329 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0845  hypothetical protein  31.18 
 
 
394 aa  120  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.609913  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0220  hypothetical protein  33.33 
 
 
318 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4144  hypothetical protein  29.31 
 
 
414 aa  120  3e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0800  hypothetical protein  34.44 
 
 
394 aa  120  3.9999999999999996e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.523609  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3382  hypothetical protein  30.59 
 
 
411 aa  120  4.9999999999999996e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.725263  normal  0.261187 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0022  hypothetical protein  35.82 
 
 
318 aa  118  9.999999999999999e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3986  hypothetical protein  28.99 
 
 
417 aa  117  3.9999999999999997e-25  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.74759  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0164  hypothetical protein  32.62 
 
 
318 aa  116  6.9999999999999995e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.489222  normal  0.0160984 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0852  hypothetical protein  32.43 
 
 
394 aa  115  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0848  hypothetical protein  32.09 
 
 
394 aa  113  5e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4432  signal peptide and transmembrane prediction  37.06 
 
 
304 aa  112  1.0000000000000001e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.181697  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2416  hypothetical protein  28.43 
 
 
409 aa  111  2.0000000000000002e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.039677  normal  0.33337 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5820  hypothetical protein  37.77 
 
 
329 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.187366  hitchhiker  0.00937701 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6889  hypothetical protein  37.41 
 
 
319 aa  105  1e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5951  hypothetical protein  33.1 
 
 
345 aa  99.8  6e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6227  hypothetical protein  37.38 
 
 
321 aa  97.1  4e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.039965  normal  0.0374412 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3930  hypothetical protein  27.93 
 
 
422 aa  94  4e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0681798  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2709  hypothetical protein  36.05 
 
 
400 aa  92.4  1e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.227296 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4183  hypothetical protein  33.86 
 
 
348 aa  86.7  6e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01290  hypothetical protein  27.84 
 
 
458 aa  81.3  0.00000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0104  hypothetical protein  31.41 
 
 
358 aa  79.3  0.00000000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00147272 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5669  hypothetical protein  25.74 
 
 
436 aa  78.6  0.0000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3472  hypothetical protein  29.41 
 
 
455 aa  77  0.0000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0090694  normal  0.166385 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1639  hypothetical protein  22.49 
 
 
464 aa  71.6  0.00000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.347688  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1421  conserved hypothetical protein, membrane  26.29 
 
 
253 aa  70.5  0.00000000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.000100005  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1955  hypothetical protein  30.62 
 
 
352 aa  68.6  0.0000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.359636  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0123  hypothetical protein  30.45 
 
 
358 aa  68.9  0.0000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2208  hypothetical protein  26.02 
 
 
470 aa  68.9  0.0000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0167503  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1040  hypothetical protein  33.18 
 
 
353 aa  60.8  0.00000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.279399  normal  0.0353846 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2554  hypothetical protein  31.51 
 
 
346 aa  59.7  0.00000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.990789  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0524  hypothetical protein  28.32 
 
 
402 aa  56.6  0.0000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.140722  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0293  hypothetical protein  23.27 
 
 
404 aa  53.1  0.000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0247634  hitchhiker  0.00128473 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3817  hypothetical protein  29.59 
 
 
352 aa  48.1  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.438372  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>