95 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_2552 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_2552  molybdopterin oxidoreductase  100 
 
 		 430 aa  856    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0105  Polysulphide reductase NrfD  55.2 
 
 		 624 aa  439  9.999999999999999e-123  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00267927 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0124  Polysulphide reductase NrfD  54.78 
 
 		 624 aa  437  1e-121  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0527  Polysulphide reductase NrfD  48.94 
 
 		 494 aa  412  1e-114  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0223  Polysulphide reductase NrfD  52.05 
 
 		 484 aa  407  1.0000000000000001e-112  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3933  polysulphide reductase NrfD  53.59 
 
 		 493 aa  392  1e-108  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.053608  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01305  molybdopterin oxidoredutase membrane subunit  47.28 
 
 		 593 aa  392  1e-108  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1636  polysulphide reductase, NrfD  47.99 
 
 		 466 aa  391  1e-107  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.513529  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2414  Polysulphide reductase NrfD  48.24 
 
 		 451 aa  391  1e-107  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.0075882  normal  0.349671 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4429  polysulphide reductase, NrfD  50 
 
 		 466 aa  385  1e-106  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.217558  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2211  molybdopterin oxidoreductase  48.15 
 
 		 451 aa  388  1e-106  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.554905  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3984  Polysulphide reductase NrfD  50.12 
 
 		 478 aa  388  1e-106  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.545328  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2775  polysulphide reductase, NrfD  45.69 
 
 		 472 aa  384  1e-105  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0295745  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3002  polysulphide reductase, NrfD  49.05 
 
 		 468 aa  384  1e-105  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00130542 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0797  polysulphide reductase, NrfD  49.38 
 
 		 478 aa  378  1e-104  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0290  Polysulphide reductase NrfD  46.54 
 
 		 490 aa  379  1e-104  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0581587  hitchhiker  0.000681201 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0845  Polysulphide reductase NrfD  49.26 
 
 		 478 aa  378  1e-104  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.207631  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0849  Polysulphide reductase NrfD  49.26 
 
 		 478 aa  378  1e-104  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1812  polysulphide reductase, NrfD  45.26 
 
 		 456 aa  380  1e-104  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0842  polysulphide reductase NrfD  49.87 
 
 		 482 aa  372  1e-102  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.363179  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3475  Polysulphide reductase NrfD  48.78 
 
 		 477 aa  366  1e-100  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.198201  normal  0.251286 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5666  Polysulphide reductase NrfD  50.88 
 
 		 476 aa  365  1e-99  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.544636  normal  0.989219 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2712  Polysulphide reductase NrfD  51.02 
 
 		 472 aa  364  2e-99  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.544038  normal  0.344395 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1423  Polysulphide reductase NrfD  48.35 
 
 		 603 aa  358  1.9999999999999998e-97  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.15148  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1594  Polysulphide reductase NrfD  50.52 
 
 		 463 aa  357  2.9999999999999997e-97  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4141  polysulphide reductase, NrfD  46.79 
 
 		 476 aa  354  2e-96  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1464  polysulphide reductase NrfD  48.56 
 
 		 471 aa  350  2e-95  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.920048  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1239  polysulphide reductase, NrfD  43.71 
 
 		 454 aa  344  1e-93  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.39739  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3385  Polysulphide reductase NrfD  47.89 
 
 		 486 aa  341  1e-92  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.253171 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0834  Polysulphide reductase NrfD  44.01 
 
 		 448 aa  325  1e-87  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.352451 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6892  Polysulphide reductase NrfD  45.81 
 
 		 454 aa  323  5e-87  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5823  polysulphide reductase NrfD  46.34 
 
 		 451 aa  317  3e-85  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.110878  normal  0.0226017 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0019  Polysulphide reductase NrfD  43.83 
 
 		 461 aa  311  1e-83  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0465805  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0161  Polysulphide reductase NrfD  44.36 
 
 		 456 aa  311  2e-83  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.116185  normal  0.0186835 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5954  Polysulphide reductase NrfD  44.09 
 
 		 445 aa  310  4e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.604828  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0217  polysulphide reductase NrfD  44.09 
 
 		 456 aa  309  5e-83  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6224  polysulphide reductase NrfD  42.52 
 
 		 452 aa  300  4e-80  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.468999  normal  0.0125183 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1872  Polysulphide reductase NrfD  39.73 
 
 		 448 aa  278  2e-73  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0540714  normal  1 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4186  polysulphide reductase, NrfD  44.36 
 
 		 456 aa  276  6e-73  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.317108  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1042  polysulphide reductase NrfD  30.48 
 
 		 674 aa  152  2e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0482955  normal  0.0753031 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1906  polysulphide reductase, NrfD  34.96 
 
 		 413 aa  108  1e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.105136  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1631  Polysulphide reductase NrfD  26.74 
 
 		 393 aa  108  2e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13670  polysulphide reductase  26.22 
 
 		 414 aa  108  3e-22  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02130  polysulphide reductase  25.5 
 
 		 389 aa  107  4e-22  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27750  polysulphide reductase  25.34 
 
 		 388 aa  98.2  3e-19  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.273464  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1867  Polysulphide reductase NrfD  25.69 
 
 		 411 aa  97.1  5e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0715566 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2406  polysulphide reductase NrfD  27.59 
 
 		 417 aa  96.3  9e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.148885  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27690  polysulphide reductase  24.67 
 
 		 384 aa  94.7  3e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3083  Polysulphide reductase NrfD  25.55 
 
 		 448 aa  94  4e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0481  Polysulphide reductase NrfD  25.14 
 
 		 413 aa  94  5e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2403  Polysulphide reductase NrfD  25.29 
 
 		 406 aa  94  5e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.418724  normal  0.657025 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2383  Polysulphide reductase NrfD  26.09 
 
 		 408 aa  89.7  9e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.290901 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2523  Polysulphide reductase NrfD  25.56 
 
 		 416 aa  89.4  1e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2436  Polysulphide reductase NrfD  25.25 
 
 		 416 aa  89  2e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.136872  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2372  Polysulphide reductase NrfD  26.91 
 
 		 408 aa  87.8  4e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.103022  normal  0.75303 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1424  polysulphide reductase, NrfD  24.5 
 
 		 416 aa  87  5e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0454  polysulphide reductase NrfD  23.37 
 
 		 389 aa  86.7  7e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3262  Polysulphide reductase NrfD  26.98 
 
 		 442 aa  85.5  0.000000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0389204 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1258  Polysulphide reductase NrfD  26.21 
 
 		 483 aa  80.1  0.00000000000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0260  Polysulphide reductase NrfD  24.32 
 
 		 383 aa  80.1  0.00000000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1603  polysulphide reductase, NrfD  24.16 
 
 		 385 aa  79  0.0000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00601969  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1759  Polysulphide reductase NrfD  26.56 
 
 		 453 aa  76.6  0.0000000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0041  Polysulphide reductase NrfD  22.79 
 
 		 383 aa  75.9  0.000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3543  Polysulphide reductase NrfD  22.94 
 
 		 469 aa  73.6  0.000000000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.400001  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1150  polysulphide reductase, NrfD  23.79 
 
 		 385 aa  68.6  0.0000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0596071  normal  0.937608 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0140  polysulphide reductase, NrfD  21.83 
 
 		 383 aa  68.2  0.0000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1845  Polysulphide reductase NrfD  22.9 
 
 		 384 aa  67  0.0000000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0829523  normal  0.148655 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4973  hypothetical protein  27.54 
 
 		 666 aa  65.5  0.000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.492562  normal  0.0494168 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0066  Polysulphide reductase NrfD  25.17 
 
 		 387 aa  64.3  0.000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.411771 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2275  reductase, transmembrane subunit, putative  25.25 
 
 		 387 aa  63.5  0.000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0274  Polysulphide reductase NrfD  22.17 
 
 		 384 aa  63.2  0.00000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00211929  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1798  Polysulphide reductase NrfD  25.3 
 
 		 391 aa  61.2  0.00000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0707  Polysulphide reductase NrfD  22.83 
 
 		 385 aa  58.9  0.0000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0447  Polysulphide reductase NrfD  24.23 
 
 		 389 aa  58.5  0.0000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.542742  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4225  Polysulphide reductase NrfD  22.31 
 
 		 389 aa  57.8  0.0000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000782128  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0524  hypothetical protein  23.73 
 
 		 402 aa  57  0.0000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.140722  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4782  Polysulphide reductase NrfD  22.08 
 
 		 400 aa  55.1  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4229  Polysulphide reductase NrfD  28.28 
 
 		 386 aa  55.1  0.000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1779  polysulphide reductase, NrfD  24.94 
 
 		 387 aa  53.9  0.000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.263014 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1562  Polysulphide reductase NrfD  23.26 
 
 		 435 aa  52  0.00002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.382538  normal  0.988263 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4459  hypothetical protein  26.4 
 
 		 642 aa  52  0.00002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4923  hypothetical protein  26.4 
 
 		 642 aa  51.6  0.00002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.116245  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0226  hypothetical protein  21.18 
 
 		 417 aa  49.7  0.00009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.567411  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1639  hypothetical protein  23.61 
 
 		 464 aa  47.8  0.0004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.347688  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0239  Polysulphide reductase NrfD  24.31 
 
 		 386 aa  47.4  0.0005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01290  hypothetical protein  22.63 
 
 		 458 aa  47.4  0.0005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1709  polysulphide reductase, NrfD  24.92 
 
 		 397 aa  46.2  0.001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0260794  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0293  hypothetical protein  20.26 
 
 		 404 aa  46.2  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0247634  hitchhiker  0.00128473 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0451  Polysulphide reductase NrfD  26.8 
 
 		 445 aa  46.2  0.001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1125  putative hydrogenase 2 b cytochrome subunit  22.95 
 
 		 435 aa  45.1  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5669  hypothetical protein  21.31 
 
 		 436 aa  45.4  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02400  polysulphide reductase  25 
 
 		 378 aa  45.4  0.002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3346  Polysulphide reductase NrfD  22.81 
 
 		 402 aa  44.3  0.005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000267  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3986  hypothetical protein  28.95 
 
 		 417 aa  43.9  0.005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.74759  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0657  exsB protein  33.87 
 
 		 237 aa  43.1  0.009  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>