72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_3933 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_3933  polysulphide reductase NrfD  100 
 
 		 493 aa  999    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.053608  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3984  Polysulphide reductase NrfD  64.33 
 
 		 478 aa  562  1.0000000000000001e-159  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.545328  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0223  Polysulphide reductase NrfD  60.53 
 
 		 484 aa  536  1e-151  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2414  Polysulphide reductase NrfD  57.46 
 
 		 451 aa  531  1e-149  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.0075882  normal  0.349671 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2211  molybdopterin oxidoreductase  57.75 
 
 		 451 aa  495  1e-139  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.554905  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0527  Polysulphide reductase NrfD  56.92 
 
 		 494 aa  498  1e-139  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3475  Polysulphide reductase NrfD  58.64 
 
 		 477 aa  494  9.999999999999999e-139  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.198201  normal  0.251286 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01305  molybdopterin oxidoredutase membrane subunit  52.13 
 
 		 593 aa  489  1e-137  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5666  Polysulphide reductase NrfD  58.2 
 
 		 476 aa  491  1e-137  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.544636  normal  0.989219 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0290  Polysulphide reductase NrfD  52.77 
 
 		 490 aa  482  1e-135  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0581587  hitchhiker  0.000681201 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1594  Polysulphide reductase NrfD  55.73 
 
 		 463 aa  480  1e-134  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3002  polysulphide reductase, NrfD  53.42 
 
 		 468 aa  480  1e-134  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00130542 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1636  polysulphide reductase, NrfD  52.51 
 
 		 466 aa  474  1e-132  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.513529  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0849  Polysulphide reductase NrfD  54.36 
 
 		 478 aa  467  9.999999999999999e-131  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0845  Polysulphide reductase NrfD  54.36 
 
 		 478 aa  467  9.999999999999999e-131  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.207631  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0842  polysulphide reductase NrfD  58.96 
 
 		 482 aa  464  1e-129  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.363179  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0797  polysulphide reductase, NrfD  53.91 
 
 		 478 aa  465  1e-129  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4141  polysulphide reductase, NrfD  54.44 
 
 		 476 aa  460  9.999999999999999e-129  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1464  polysulphide reductase NrfD  54.19 
 
 		 471 aa  454  1.0000000000000001e-126  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.920048  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4429  polysulphide reductase, NrfD  51.69 
 
 		 466 aa  446  1.0000000000000001e-124  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.217558  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1423  Polysulphide reductase NrfD  51.21 
 
 		 603 aa  444  1e-123  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.15148  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2712  Polysulphide reductase NrfD  52.09 
 
 		 472 aa  439  9.999999999999999e-123  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.544038  normal  0.344395 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3385  Polysulphide reductase NrfD  52.19 
 
 		 486 aa  440  9.999999999999999e-123  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.253171 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1239  polysulphide reductase, NrfD  49.33 
 
 		 454 aa  433  1e-120  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.39739  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2552  molybdopterin oxidoreductase  53.73 
 
 		 430 aa  392  1e-108  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0834  Polysulphide reductase NrfD  46.26 
 
 		 448 aa  393  1e-108  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.352451 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0124  Polysulphide reductase NrfD  47.53 
 
 		 624 aa  380  1e-104  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0105  Polysulphide reductase NrfD  49.4 
 
 		 624 aa  381  1e-104  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00267927 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5954  Polysulphide reductase NrfD  44.57 
 
 		 445 aa  374  1e-102  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.604828  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6892  Polysulphide reductase NrfD  44.88 
 
 		 454 aa  367  1e-100  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5823  polysulphide reductase NrfD  44.8 
 
 		 451 aa  347  2e-94  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.110878  normal  0.0226017 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6224  polysulphide reductase NrfD  41.53 
 
 		 452 aa  340  2.9999999999999998e-92  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.468999  normal  0.0125183 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0217  polysulphide reductase NrfD  39.82 
 
 		 456 aa  334  2e-90  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0161  Polysulphide reductase NrfD  40.05 
 
 		 456 aa  334  2e-90  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.116185  normal  0.0186835 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0019  Polysulphide reductase NrfD  40 
 
 		 461 aa  333  3e-90  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0465805  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1812  polysulphide reductase, NrfD  43.09 
 
 		 456 aa  330  3e-89  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2775  polysulphide reductase, NrfD  39.86 
 
 		 472 aa  317  2e-85  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0295745  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4186  polysulphide reductase, NrfD  41.19 
 
 		 456 aa  316  8e-85  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.317108  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1872  Polysulphide reductase NrfD  41.92 
 
 		 448 aa  313  4.999999999999999e-84  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0540714  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1042  polysulphide reductase NrfD  34.92 
 
 		 674 aa  225  2e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0482955  normal  0.0753031 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4973  hypothetical protein  27.27 
 
 		 666 aa  107  4e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.492562  normal  0.0494168 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13670  polysulphide reductase  24.24 
 
 		 414 aa  88.2  3e-16  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1906  polysulphide reductase, NrfD  25 
 
 		 413 aa  82.4  0.00000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.105136  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3083  Polysulphide reductase NrfD  24.53 
 
 		 448 aa  81.6  0.00000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4923  hypothetical protein  30.05 
 
 		 642 aa  75.9  0.000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.116245  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4459  hypothetical protein  29.61 
 
 		 642 aa  76.3  0.000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1759  Polysulphide reductase NrfD  23.93 
 
 		 453 aa  75.1  0.000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1258  Polysulphide reductase NrfD  23.04 
 
 		 483 aa  73.2  0.00000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2523  Polysulphide reductase NrfD  24.15 
 
 		 416 aa  72.4  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02130  polysulphide reductase  21.2 
 
 		 389 aa  63.9  0.000000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1867  Polysulphide reductase NrfD  21.28 
 
 		 411 aa  63.5  0.000000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0715566 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0481  Polysulphide reductase NrfD  21.15 
 
 		 413 aa  63.2  0.00000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2436  Polysulphide reductase NrfD  22.84 
 
 		 416 aa  62.8  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.136872  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1424  polysulphide reductase, NrfD  22.27 
 
 		 416 aa  60.8  0.00000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27690  polysulphide reductase  23.35 
 
 		 384 aa  60.8  0.00000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2416  hypothetical protein  22.7 
 
 		 409 aa  60.5  0.00000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.039677  normal  0.33337 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2403  Polysulphide reductase NrfD  21.24 
 
 		 406 aa  58.9  0.0000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.418724  normal  0.657025 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1631  Polysulphide reductase NrfD  22.22 
 
 		 393 aa  56.2  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0226  hypothetical protein  23.38 
 
 		 417 aa  55.8  0.000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.567411  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27750  polysulphide reductase  22.12 
 
 		 388 aa  55.5  0.000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.273464  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2406  polysulphide reductase NrfD  22.11 
 
 		 417 aa  54.3  0.000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.148885  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3543  Polysulphide reductase NrfD  22.55 
 
 		 469 aa  53.9  0.000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.400001  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1562  Polysulphide reductase NrfD  23.12 
 
 		 435 aa  52.8  0.00001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.382538  normal  0.988263 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1603  polysulphide reductase, NrfD  21.77 
 
 		 385 aa  52  0.00003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00601969  normal  1 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3262  Polysulphide reductase NrfD  23.58 
 
 		 442 aa  50.4  0.00006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0389204 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0454  polysulphide reductase NrfD  20.26 
 
 		 389 aa  49.3  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0260  Polysulphide reductase NrfD  23.78 
 
 		 383 aa  47  0.0008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2372  Polysulphide reductase NrfD  23.71 
 
 		 408 aa  46.6  0.001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.103022  normal  0.75303 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2383  Polysulphide reductase NrfD  24.62 
 
 		 408 aa  45.4  0.003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.290901 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0041  Polysulphide reductase NrfD  20.59 
 
 		 383 aa  45.1  0.003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2999  hypothetical protein  24.29 
 
 		 398 aa  44.3  0.005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00101465 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0524  hypothetical protein  22.14 
 
 		 402 aa  43.9  0.006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.140722  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>