76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_4186 on replicon NC_007959
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007959  Nham_4186  polysulphide reductase, NrfD  100 
 
 		 456 aa  904    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.317108  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6892  Polysulphide reductase NrfD  68.43 
 
 		 454 aa  613  9.999999999999999e-175  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5823  polysulphide reductase NrfD  67.18 
 
 		 451 aa  583  1.0000000000000001e-165  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.110878  normal  0.0226017 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0217  polysulphide reductase NrfD  64.38 
 
 		 456 aa  576  1.0000000000000001e-163  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0161  Polysulphide reductase NrfD  64.16 
 
 		 456 aa  575  1.0000000000000001e-163  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.116185  normal  0.0186835 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0019  Polysulphide reductase NrfD  63.19 
 
 		 461 aa  571  1.0000000000000001e-162  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0465805  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6224  polysulphide reductase NrfD  64.04 
 
 		 452 aa  570  1e-161  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.468999  normal  0.0125183 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1239  polysulphide reductase, NrfD  53.4 
 
 		 454 aa  449  1e-125  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.39739  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4429  polysulphide reductase, NrfD  50.12 
 
 		 466 aa  405  1.0000000000000001e-112  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.217558  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3002  polysulphide reductase, NrfD  44.49 
 
 		 468 aa  400  9.999999999999999e-111  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00130542 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1594  Polysulphide reductase NrfD  47.89 
 
 		 463 aa  400  9.999999999999999e-111  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0842  polysulphide reductase NrfD  50.26 
 
 		 482 aa  376  1e-103  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.363179  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0797  polysulphide reductase, NrfD  46.15 
 
 		 478 aa  372  1e-102  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5954  Polysulphide reductase NrfD  46.26 
 
 		 445 aa  373  1e-102  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.604828  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3385  Polysulphide reductase NrfD  46.1 
 
 		 486 aa  369  1e-101  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.253171 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0845  Polysulphide reductase NrfD  47.49 
 
 		 478 aa  371  1e-101  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.207631  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0849  Polysulphide reductase NrfD  47.49 
 
 		 478 aa  371  1e-101  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4141  polysulphide reductase, NrfD  46.26 
 
 		 476 aa  366  1e-100  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1464  polysulphide reductase NrfD  46.45 
 
 		 471 aa  368  1e-100  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.920048  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0834  Polysulphide reductase NrfD  47.92 
 
 		 448 aa  364  2e-99  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.352451 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2414  Polysulphide reductase NrfD  44.19 
 
 		 451 aa  360  2e-98  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.0075882  normal  0.349671 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1636  polysulphide reductase, NrfD  42.92 
 
 		 466 aa  356  5e-97  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.513529  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2712  Polysulphide reductase NrfD  46.88 
 
 		 472 aa  356  5.999999999999999e-97  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.544038  normal  0.344395 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01305  molybdopterin oxidoredutase membrane subunit  42.27 
 
 		 593 aa  352  8.999999999999999e-96  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5666  Polysulphide reductase NrfD  43.17 
 
 		 476 aa  352  8.999999999999999e-96  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.544636  normal  0.989219 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0290  Polysulphide reductase NrfD  43.99 
 
 		 490 aa  348  8e-95  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0581587  hitchhiker  0.000681201 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3984  Polysulphide reductase NrfD  44.42 
 
 		 478 aa  347  3e-94  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.545328  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0223  Polysulphide reductase NrfD  44.95 
 
 		 484 aa  347  3e-94  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3475  Polysulphide reductase NrfD  44.14 
 
 		 477 aa  344  2e-93  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.198201  normal  0.251286 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1423  Polysulphide reductase NrfD  42.99 
 
 		 603 aa  341  1e-92  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.15148  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0527  Polysulphide reductase NrfD  42.53 
 
 		 494 aa  341  2e-92  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2211  molybdopterin oxidoreductase  41.26 
 
 		 451 aa  337  1.9999999999999998e-91  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.554905  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3933  polysulphide reductase NrfD  41.19 
 
 		 493 aa  328  1.0000000000000001e-88  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.053608  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2775  polysulphide reductase, NrfD  39.05 
 
 		 472 aa  299  8e-80  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0295745  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2552  molybdopterin oxidoreductase  44.36 
 
 		 430 aa  296  4e-79  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1812  polysulphide reductase, NrfD  38.39 
 
 		 456 aa  294  2e-78  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0105  Polysulphide reductase NrfD  38.41 
 
 		 624 aa  268  1e-70  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00267927 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0124  Polysulphide reductase NrfD  37.5 
 
 		 624 aa  260  4e-68  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1872  Polysulphide reductase NrfD  37.53 
 
 		 448 aa  236  6e-61  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0540714  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1042  polysulphide reductase NrfD  37.7 
 
 		 674 aa  224  3e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0482955  normal  0.0753031 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3083  Polysulphide reductase NrfD  25.31 
 
 		 448 aa  91.7  3e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4973  hypothetical protein  28.16 
 
 		 666 aa  90.1  7e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.492562  normal  0.0494168 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0481  Polysulphide reductase NrfD  23.94 
 
 		 413 aa  83.2  0.000000000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4459  hypothetical protein  29.13 
 
 		 642 aa  81.6  0.00000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1258  Polysulphide reductase NrfD  23.91 
 
 		 483 aa  77.4  0.0000000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4923  hypothetical protein  28.35 
 
 		 642 aa  74.7  0.000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.116245  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1759  Polysulphide reductase NrfD  24.89 
 
 		 453 aa  73.9  0.000000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1631  Polysulphide reductase NrfD  24.06 
 
 		 393 aa  73.6  0.000000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1906  polysulphide reductase, NrfD  22.71 
 
 		 413 aa  70.5  0.00000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.105136  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0454  polysulphide reductase NrfD  21.9 
 
 		 389 aa  67.8  0.0000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1562  Polysulphide reductase NrfD  22.07 
 
 		 435 aa  66.2  0.000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.382538  normal  0.988263 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0260  Polysulphide reductase NrfD  21.17 
 
 		 383 aa  63.9  0.000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1867  Polysulphide reductase NrfD  21.86 
 
 		 411 aa  64.3  0.000000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0715566 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2403  Polysulphide reductase NrfD  21.82 
 
 		 406 aa  63.5  0.000000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.418724  normal  0.657025 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13670  polysulphide reductase  23.37 
 
 		 414 aa  59.7  0.0000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02130  polysulphide reductase  21.52 
 
 		 389 aa  57  0.0000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3543  Polysulphide reductase NrfD  29.57 
 
 		 469 aa  57  0.0000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.400001  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2416  hypothetical protein  23.55 
 
 		 409 aa  56.6  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.039677  normal  0.33337 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0041  Polysulphide reductase NrfD  21.18 
 
 		 383 aa  56.6  0.000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3262  Polysulphide reductase NrfD  24.39 
 
 		 442 aa  55.8  0.000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0389204 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1603  polysulphide reductase, NrfD  19.76 
 
 		 385 aa  55.5  0.000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00601969  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0707  Polysulphide reductase NrfD  20.9 
 
 		 385 aa  54.7  0.000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27690  polysulphide reductase  22.57 
 
 		 384 aa  53.9  0.000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1150  polysulphide reductase, NrfD  19.17 
 
 		 385 aa  53.5  0.000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0596071  normal  0.937608 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2523  Polysulphide reductase NrfD  21.95 
 
 		 416 aa  53.1  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1845  Polysulphide reductase NrfD  20.54 
 
 		 384 aa  53.1  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0829523  normal  0.148655 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2372  Polysulphide reductase NrfD  24.07 
 
 		 408 aa  50.8  0.00005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.103022  normal  0.75303 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2406  polysulphide reductase NrfD  22.28 
 
 		 417 aa  50.4  0.00006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.148885  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1424  polysulphide reductase, NrfD  21.01 
 
 		 416 aa  50.1  0.00008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2436  Polysulphide reductase NrfD  21.01 
 
 		 416 aa  49.3  0.0001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.136872  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0140  polysulphide reductase, NrfD  21.51 
 
 		 383 aa  49.7  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0845  hypothetical protein  21.62 
 
 		 394 aa  47.4  0.0005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.609913  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2383  Polysulphide reductase NrfD  22.46 
 
 		 408 aa  44.3  0.005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.290901 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1779  polysulphide reductase, NrfD  22.36 
 
 		 387 aa  43.1  0.01  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.263014 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27750  polysulphide reductase  21.08 
 
 		 388 aa  43.1  0.01  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.273464  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1613  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  29.2 
 
 		 531 aa  43.1  0.01  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>