69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amuc_1872 on replicon NC_010655
Organism: Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010655  Amuc_1872  Polysulphide reductase NrfD  100 
 
 		 448 aa  886    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0540714  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2414  Polysulphide reductase NrfD  43.9 
 
 		 451 aa  345  1e-93  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.0075882  normal  0.349671 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0527  Polysulphide reductase NrfD  41.44 
 
 		 494 aa  323  5e-87  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3933  polysulphide reductase NrfD  42.15 
 
 		 493 aa  318  1e-85  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.053608  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4429  polysulphide reductase, NrfD  42.18 
 
 		 466 aa  316  4e-85  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.217558  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3984  Polysulphide reductase NrfD  42.59 
 
 		 478 aa  315  9.999999999999999e-85  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.545328  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1423  Polysulphide reductase NrfD  39.4 
 
 		 603 aa  313  2.9999999999999996e-84  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.15148  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3002  polysulphide reductase, NrfD  43.12 
 
 		 468 aa  313  2.9999999999999996e-84  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00130542 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0842  polysulphide reductase NrfD  43.91 
 
 		 482 aa  311  1e-83  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.363179  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4141  polysulphide reductase, NrfD  43.95 
 
 		 476 aa  308  1.0000000000000001e-82  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0290  Polysulphide reductase NrfD  39.35 
 
 		 490 aa  308  2.0000000000000002e-82  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0581587  hitchhiker  0.000681201 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01305  molybdopterin oxidoredutase membrane subunit  38.79 
 
 		 593 aa  308  2.0000000000000002e-82  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1464  polysulphide reductase NrfD  45.22 
 
 		 471 aa  306  5.0000000000000004e-82  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.920048  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1636  polysulphide reductase, NrfD  38.55 
 
 		 466 aa  305  8.000000000000001e-82  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.513529  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2712  Polysulphide reductase NrfD  44.59 
 
 		 472 aa  305  1.0000000000000001e-81  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.544038  normal  0.344395 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2211  molybdopterin oxidoreductase  38.9 
 
 		 451 aa  305  2.0000000000000002e-81  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.554905  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0849  Polysulphide reductase NrfD  43.23 
 
 		 478 aa  301  2e-80  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1594  Polysulphide reductase NrfD  44.64 
 
 		 463 aa  301  2e-80  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0845  Polysulphide reductase NrfD  43.23 
 
 		 478 aa  301  2e-80  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.207631  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0223  Polysulphide reductase NrfD  41.45 
 
 		 484 aa  300  3e-80  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0797  polysulphide reductase, NrfD  42.97 
 
 		 478 aa  298  2e-79  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3385  Polysulphide reductase NrfD  41.94 
 
 		 486 aa  298  2e-79  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.253171 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0834  Polysulphide reductase NrfD  38.33 
 
 		 448 aa  296  5e-79  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.352451 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1239  polysulphide reductase, NrfD  38 
 
 		 454 aa  292  7e-78  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.39739  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5666  Polysulphide reductase NrfD  43.3 
 
 		 476 aa  290  3e-77  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.544636  normal  0.989219 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3475  Polysulphide reductase NrfD  41.54 
 
 		 477 aa  289  8e-77  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.198201  normal  0.251286 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6224  polysulphide reductase NrfD  41.71 
 
 		 452 aa  286  4e-76  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.468999  normal  0.0125183 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2552  molybdopterin oxidoreductase  39.73 
 
 		 430 aa  286  5e-76  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6892  Polysulphide reductase NrfD  40.49 
 
 		 454 aa  283  5.000000000000001e-75  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5954  Polysulphide reductase NrfD  41.56 
 
 		 445 aa  278  1e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.604828  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2775  polysulphide reductase, NrfD  37.32 
 
 		 472 aa  277  2e-73  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0295745  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0019  Polysulphide reductase NrfD  39.95 
 
 		 461 aa  277  3e-73  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0465805  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0161  Polysulphide reductase NrfD  39.6 
 
 		 456 aa  273  3e-72  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.116185  normal  0.0186835 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1812  polysulphide reductase, NrfD  36.12 
 
 		 456 aa  273  5.000000000000001e-72  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0217  polysulphide reductase NrfD  39.2 
 
 		 456 aa  272  1e-71  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5823  polysulphide reductase NrfD  40.27 
 
 		 451 aa  268  2e-70  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.110878  normal  0.0226017 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0105  Polysulphide reductase NrfD  38.39 
 
 		 624 aa  263  4e-69  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00267927 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0124  Polysulphide reductase NrfD  37.33 
 
 		 624 aa  259  7e-68  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4186  polysulphide reductase, NrfD  37.63 
 
 		 456 aa  226  5.0000000000000005e-58  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.317108  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1042  polysulphide reductase NrfD  30.56 
 
 		 674 aa  137  5e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0482955  normal  0.0753031 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1759  Polysulphide reductase NrfD  25.96 
 
 		 453 aa  92  2e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1258  Polysulphide reductase NrfD  24.81 
 
 		 483 aa  84  0.000000000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3083  Polysulphide reductase NrfD  25.19 
 
 		 448 aa  82.4  0.00000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13670  polysulphide reductase  27.76 
 
 		 414 aa  82  0.00000000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1631  Polysulphide reductase NrfD  25.76 
 
 		 393 aa  73.9  0.000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1906  polysulphide reductase, NrfD  28.44 
 
 		 413 aa  70.9  0.00000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.105136  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0481  Polysulphide reductase NrfD  28.17 
 
 		 413 aa  68.9  0.0000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4973  hypothetical protein  27.71 
 
 		 666 aa  65.5  0.000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.492562  normal  0.0494168 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1867  Polysulphide reductase NrfD  24.15 
 
 		 411 aa  62.4  0.00000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0715566 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3543  Polysulphide reductase NrfD  28.25 
 
 		 469 aa  61.6  0.00000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.400001  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2403  Polysulphide reductase NrfD  23.53 
 
 		 406 aa  59.3  0.0000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.418724  normal  0.657025 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0260  Polysulphide reductase NrfD  24.6 
 
 		 383 aa  57  0.0000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2372  Polysulphide reductase NrfD  25.98 
 
 		 408 aa  57  0.0000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.103022  normal  0.75303 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2383  Polysulphide reductase NrfD  26.94 
 
 		 408 aa  56.6  0.0000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.290901 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02130  polysulphide reductase  24.35 
 
 		 389 aa  56.6  0.0000009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0707  Polysulphide reductase NrfD  21.84 
 
 		 385 aa  56.2  0.000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27690  polysulphide reductase  24.34 
 
 		 384 aa  53.1  0.000009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4225  Polysulphide reductase NrfD  28 
 
 		 389 aa  52.8  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000782128  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0041  Polysulphide reductase NrfD  22.56 
 
 		 383 aa  52  0.00002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27750  polysulphide reductase  22.64 
 
 		 388 aa  51.6  0.00003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.273464  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1562  Polysulphide reductase NrfD  23.16 
 
 		 435 aa  50.4  0.00007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.382538  normal  0.988263 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1798  Polysulphide reductase NrfD  24.27 
 
 		 391 aa  50.4  0.00007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3262  Polysulphide reductase NrfD  29.72 
 
 		 442 aa  49.7  0.0001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0389204 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0140  polysulphide reductase, NrfD  21.1 
 
 		 383 aa  48.1  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2406  polysulphide reductase NrfD  25.23 
 
 		 417 aa  47.4  0.0005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.148885  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2436  Polysulphide reductase NrfD  23.63 
 
 		 416 aa  46.2  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.136872  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1424  polysulphide reductase, NrfD  23.63 
 
 		 416 aa  45.1  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2523  Polysulphide reductase NrfD  23.59 
 
 		 416 aa  45.8  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1845  Polysulphide reductase NrfD  21.23 
 
 		 384 aa  43.5  0.007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0829523  normal  0.148655 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>