85 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_0707 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010803  Clim_0707  Polysulphide reductase NrfD  100 
 
 		 385 aa  769    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0140  polysulphide reductase, NrfD  82.89 
 
 		 383 aa  630  1e-179  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1845  Polysulphide reductase NrfD  72.66 
 
 		 384 aa  590  1e-167  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0829523  normal  0.148655 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0041  Polysulphide reductase NrfD  73.89 
 
 		 383 aa  579  1e-164  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0260  Polysulphide reductase NrfD  63.09 
 
 		 383 aa  498  1e-140  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0454  polysulphide reductase NrfD  57.33 
 
 		 389 aa  459  9.999999999999999e-129  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1603  polysulphide reductase, NrfD  57.44 
 
 		 385 aa  459  9.999999999999999e-129  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00601969  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1150  polysulphide reductase, NrfD  59.16 
 
 		 385 aa  460  9.999999999999999e-129  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0596071  normal  0.937608 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0274  Polysulphide reductase NrfD  57.55 
 
 		 384 aa  439  9.999999999999999e-123  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00211929  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0239  Polysulphide reductase NrfD  56.02 
 
 		 386 aa  423  1e-117  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0066  Polysulphide reductase NrfD  54.05 
 
 		 387 aa  417  9.999999999999999e-116  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.411771 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2275  reductase, transmembrane subunit, putative  52.6 
 
 		 387 aa  403  1e-111  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1779  polysulphide reductase, NrfD  54.05 
 
 		 387 aa  400  9.999999999999999e-111  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.263014 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0447  Polysulphide reductase NrfD  50.91 
 
 		 389 aa  387  1e-106  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.542742  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2309  Polysulphide reductase NrfD  43.49 
 
 		 358 aa  270  2e-71  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.823905  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2406  polysulphide reductase NrfD  41.42 
 
 		 417 aa  261  1e-68  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.148885  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2436  Polysulphide reductase NrfD  40.47 
 
 		 416 aa  258  1e-67  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.136872  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1424  polysulphide reductase, NrfD  40.47 
 
 		 416 aa  257  2e-67  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2523  Polysulphide reductase NrfD  38.12 
 
 		 416 aa  248  1e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0048  polysulfide reductase, subunit C, putative  37.76 
 
 		 391 aa  243  3.9999999999999997e-63  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.939472 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0481  Polysulphide reductase NrfD  28.99 
 
 		 413 aa  133  6.999999999999999e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1944  polysulfide reductase, subunit C, putative  36.26 
 
 		 339 aa  132  9e-30  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1906  polysulphide reductase, NrfD  31.42 
 
 		 413 aa  123  6e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.105136  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1867  Polysulphide reductase NrfD  26.34 
 
 		 411 aa  114  4.0000000000000004e-24  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0715566 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1631  Polysulphide reductase NrfD  29.3 
 
 		 393 aa  112  1.0000000000000001e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27690  polysulphide reductase  29.64 
 
 		 384 aa  110  3e-23  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13670  polysulphide reductase  29.44 
 
 		 414 aa  109  7.000000000000001e-23  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27750  polysulphide reductase  29.64 
 
 		 388 aa  109  8.000000000000001e-23  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.273464  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2403  Polysulphide reductase NrfD  29.41 
 
 		 406 aa  106  6e-22  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.418724  normal  0.657025 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02130  polysulphide reductase  30.43 
 
 		 389 aa  105  1e-21  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2383  Polysulphide reductase NrfD  26.9 
 
 		 408 aa  98.2  2e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.290901 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2372  Polysulphide reductase NrfD  26.52 
 
 		 408 aa  97.1  4e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.103022  normal  0.75303 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3262  Polysulphide reductase NrfD  27.25 
 
 		 442 aa  95.9  1e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0389204 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4225  Polysulphide reductase NrfD  30.37 
 
 		 389 aa  80.1  0.00000000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000782128  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4229  Polysulphide reductase NrfD  27.84 
 
 		 386 aa  79.3  0.0000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_112  molybdopterin oxidoreductase, membrane subunit  26.6 
 
 		 393 aa  76.6  0.0000000000007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0266  polysulphide reductase, NrfD  25.77 
 
 		 393 aa  75.9  0.000000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0102  molybdopterin oxidoreductase, membrane subunit, putative  25.64 
 
 		 393 aa  75.1  0.000000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.757619  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2196  Polysulphide reductase NrfD  24.74 
 
 		 414 aa  71.2  0.00000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.203832  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1709  polysulphide reductase, NrfD  25.58 
 
 		 397 aa  68.6  0.0000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0260794  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0223  Polysulphide reductase NrfD  23.19 
 
 		 484 aa  65.9  0.000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2211  molybdopterin oxidoreductase  25.35 
 
 		 451 aa  64.7  0.000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.554905  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1798  Polysulphide reductase NrfD  24.07 
 
 		 391 aa  63.2  0.000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02400  polysulphide reductase  27.43 
 
 		 378 aa  62.4  0.00000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0105  Polysulphide reductase NrfD  24 
 
 		 624 aa  60.8  0.00000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00267927 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1423  Polysulphide reductase NrfD  21.28 
 
 		 603 aa  60.5  0.00000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.15148  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3475  Polysulphide reductase NrfD  22.92 
 
 		 477 aa  60.1  0.00000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.198201  normal  0.251286 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5666  Polysulphide reductase NrfD  25.27 
 
 		 476 aa  59.7  0.00000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.544636  normal  0.989219 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3083  Polysulphide reductase NrfD  29.17 
 
 		 448 aa  59.3  0.0000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0527  Polysulphide reductase NrfD  25.26 
 
 		 494 aa  58.5  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1196  Polysulphide reductase NrfD  25.52 
 
 		 348 aa  58.5  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01305  molybdopterin oxidoredutase membrane subunit  22.65 
 
 		 593 aa  58.5  0.0000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0290  Polysulphide reductase NrfD  21.96 
 
 		 490 aa  58.2  0.0000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0581587  hitchhiker  0.000681201 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2552  molybdopterin oxidoreductase  22.49 
 
 		 430 aa  57.4  0.0000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2775  polysulphide reductase, NrfD  24.8 
 
 		 472 aa  57  0.0000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0295745  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0124  Polysulphide reductase NrfD  23.46 
 
 		 624 aa  56.6  0.0000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1562  Polysulphide reductase NrfD  31.47 
 
 		 435 aa  56.2  0.000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.382538  normal  0.988263 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2474  molybdopterin oxidoreductase, membrane subunit  23.12 
 
 		 400 aa  53.1  0.000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.750101  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1229  Polysulphide reductase NrfD  24.82 
 
 		 304 aa  53.1  0.000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1636  polysulphide reductase, NrfD  20.85 
 
 		 466 aa  52.8  0.00001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.513529  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0161  Polysulphide reductase NrfD  20.64 
 
 		 456 aa  51.2  0.00003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.116185  normal  0.0186835 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4782  Polysulphide reductase NrfD  24.03 
 
 		 400 aa  50.8  0.00004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0217  polysulphide reductase NrfD  20.28 
 
 		 456 aa  50.4  0.00005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1664  polysulphide reductase, NrfD  24.4 
 
 		 425 aa  49.7  0.0001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1239  polysulphide reductase, NrfD  22.18 
 
 		 454 aa  48.1  0.0002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.39739  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5954  Polysulphide reductase NrfD  20.72 
 
 		 445 aa  48.9  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.604828  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1812  polysulphide reductase, NrfD  23.2 
 
 		 456 aa  48.5  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0019  Polysulphide reductase NrfD  19.93 
 
 		 461 aa  48.9  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0465805  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3002  polysulphide reductase, NrfD  22.66 
 
 		 468 aa  47.8  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00130542 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3385  Polysulphide reductase NrfD  22.22 
 
 		 486 aa  47.4  0.0004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.253171 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0634  polysulphide reductase, NrfD  22.78 
 
 		 364 aa  47  0.0005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00221682 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4186  polysulphide reductase, NrfD  20.9 
 
 		 456 aa  46.6  0.0007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.317108  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2712  Polysulphide reductase NrfD  20.35 
 
 		 472 aa  46.6  0.0008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.544038  normal  0.344395 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4429  polysulphide reductase, NrfD  21.12 
 
 		 466 aa  46.2  0.0008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.217558  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0842  polysulphide reductase NrfD  20.52 
 
 		 482 aa  45.8  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.363179  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5823  polysulphide reductase NrfD  20.71 
 
 		 451 aa  45.8  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.110878  normal  0.0226017 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1872  Polysulphide reductase NrfD  21.84 
 
 		 448 aa  46.2  0.001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0540714  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0797  polysulphide reductase, NrfD  22.48 
 
 		 478 aa  45.8  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1740  putative tetrathionate reductase subunit C  22.44 
 
 		 361 aa  45.8  0.001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.214544 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3085  polysulphide reductase NrfD  23.56 
 
 		 405 aa  45.4  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.488046  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0634  polysulphide reductase, NrfD  21.85 
 
 		 364 aa  43.9  0.005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00082842 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0845  Polysulphide reductase NrfD  21.94 
 
 		 478 aa  43.9  0.005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.207631  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6892  Polysulphide reductase NrfD  20.07 
 
 		 454 aa  43.9  0.005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0849  Polysulphide reductase NrfD  21.94 
 
 		 478 aa  43.9  0.005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3537  polysulphide reductase, NrfD  24.59 
 
 		 315 aa  43.5  0.006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>