50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewana3_0634 on replicon NC_008577
Organism: Shewanella sp. ANA-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008321  Shewmr4_0634  polysulphide reductase, NrfD  96.7 
 
 		 364 aa  674    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00082842 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0634  polysulphide reductase, NrfD  100 
 
 		 364 aa  721    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00221682 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3735  polysulphide reductase NrfD  84.4 
 
 		 360 aa  606  9.999999999999999e-173  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0590  polysulphide reductase NrfD  83.84 
 
 		 360 aa  604  9.999999999999999e-173  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3678  Polysulphide reductase NrfD  83.84 
 
 		 360 aa  603  1.0000000000000001e-171  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0663  polysulphide reductase, NrfD  84.87 
 
 		 360 aa  601  1.0000000000000001e-171  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3861  polysulphide reductase NrfD  83.01 
 
 		 360 aa  600  1e-170  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.773503 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1740  putative tetrathionate reductase subunit C  36.68 
 
 		 361 aa  180  2.9999999999999997e-44  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.214544 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003033  tetrathionate reductase subunit C  37.37 
 
 		 376 aa  175  9.999999999999999e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1068  polysulphide reductase NrfD  40.68 
 
 		 352 aa  162  8.000000000000001e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00177902 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1424  Polysulphide reductase NrfD  35.28 
 
 		 348 aa  141  1.9999999999999998e-32  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.270293  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1787  tetrathionate reductase complex, subunit C  33.61 
 
 		 340 aa  140  3e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1518  tetrathionate reductase complex subunit C  33.61 
 
 		 340 aa  140  3e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000105218 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1481  tetrathionate reductase complex subunit C  33.61 
 
 		 340 aa  140  3.9999999999999997e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.393478 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1958  tetrathionate reductase complex, subunit C  33.33 
 
 		 340 aa  139  8.999999999999999e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.413721  hitchhiker  0.000000744183 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1497  tetrathionate reductase complex, subunit C  33.89 
 
 		 340 aa  139  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000345555 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2423  polysulphide reductase, NrfD  35.28 
 
 		 348 aa  137  3.0000000000000003e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.00497953  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0898  tetrathionate reductase, subunit C  32.27 
 
 		 342 aa  136  6.0000000000000005e-31  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.392425  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4245  polysulphide reductase NrfD  33.78 
 
 		 347 aa  129  7.000000000000001e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.370954  normal  0.113587 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1798  Polysulphide reductase NrfD  26.06 
 
 		 391 aa  78.2  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4782  Polysulphide reductase NrfD  27.13 
 
 		 400 aa  75.5  0.000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2044  polysulfide reductase, subunit C, putative  26.75 
 
 		 304 aa  56.6  0.0000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.292161  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1162  Polysulphide reductase NrfD  31.39 
 
 		 323 aa  55.8  0.000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.130935  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1196  Polysulphide reductase NrfD  26.82 
 
 		 348 aa  55.1  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2141  Polysulphide reductase NrfD  29.8 
 
 		 330 aa  53.5  0.000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0724041  normal  0.879505 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1207  Polysulphide reductase NrfD  27.36 
 
 		 305 aa  52.8  0.000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1865  Polysulphide reductase NrfD  25.31 
 
 		 304 aa  52.8  0.000009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0342025 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1337  Polysulphide reductase NrfD  26.53 
 
 		 304 aa  52.4  0.00001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.794344  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4106  polysulphide reductase NrfD  28.1 
 
 		 311 aa  52.8  0.00001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.354906  normal  0.247792 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0910  Polysulphide reductase NrfD  27.75 
 
 		 330 aa  50.8  0.00003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.241015  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0916  Polysulphide reductase NrfD  22.92 
 
 		 394 aa  51.2  0.00003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.451801  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0952  polysulfide reductase, subunit C, putative  25.93 
 
 		 304 aa  50.4  0.00005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.18668  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0618  formate-dependent nitrite reductase membrane component-like  27.37 
 
 		 330 aa  49.7  0.00008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0787087  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1464  polysulphide reductase NrfD  27.92 
 
 		 347 aa  48.5  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4045  polysulfide reductase, subunit C  22.12 
 
 		 313 aa  48.9  0.0002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3520  polysulphide reductase, NrfD  26.39 
 
 		 417 aa  48.1  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000358671  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0140  polysulphide reductase, NrfD  23.21 
 
 		 383 aa  47.4  0.0004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2564  polysulphide reductase, NrfD  25.27 
 
 		 331 aa  47.4  0.0004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.564055  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0041  Polysulphide reductase NrfD  23.93 
 
 		 383 aa  47.4  0.0004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2402  Polysulphide reductase NrfD  27.15 
 
 		 331 aa  47  0.0005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000296698  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0707  Polysulphide reductase NrfD  22.78 
 
 		 385 aa  47  0.0005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0509  polysulphide reductase, NrfD  24.4 
 
 		 314 aa  47  0.0005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3196  Polysulphide reductase NrfD  26.27 
 
 		 412 aa  45.8  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1845  Polysulphide reductase NrfD  23.44 
 
 		 384 aa  44.7  0.002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0829523  normal  0.148655 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0343  polysulphide reductase, NrfD  24.69 
 
 		 345 aa  44.7  0.002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.443953  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0447  Polysulphide reductase NrfD  22.46 
 
 		 389 aa  44.3  0.003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.542742  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1066  Polysulphide reductase NrfD  25.81 
 
 		 412 aa  44.3  0.003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.4681800000000002e-26 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0862  cyclic nucleotide-binding protein  32.67 
 
 		 327 aa  43.9  0.005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1772  protein NrfD  23.66 
 
 		 323 aa  42.7  0.009  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3442  polysulphide reductase, NrfD  25.14 
 
 		 314 aa  42.7  0.009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>