26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cag_1944 on replicon NC_007514
Organism: Chlorobium chlorochromatii CaD3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007514  Cag_1944  polysulfide reductase, subunit C, putative  100 
 
 
339 aa  644    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2309  Polysulphide reductase NrfD  38.53 
 
 
358 aa  186  6e-46  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.823905  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0707  Polysulphide reductase NrfD  31.68 
 
 
385 aa  170  3e-41  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0140  polysulphide reductase, NrfD  31.76 
 
 
383 aa  154  1e-36  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0041  Polysulphide reductase NrfD  36.64 
 
 
383 aa  154  2e-36  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1845  Polysulphide reductase NrfD  28.39 
 
 
384 aa  142  6e-33  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0829523  normal  0.148655 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0260  Polysulphide reductase NrfD  26.7 
 
 
383 aa  134  3e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2275  reductase, transmembrane subunit, putative  27.42 
 
 
387 aa  125  1e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0239  Polysulphide reductase NrfD  27.69 
 
 
386 aa  124  2e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0274  Polysulphide reductase NrfD  26.11 
 
 
384 aa  117  1.9999999999999998e-25  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00211929  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0454  polysulphide reductase NrfD  25.85 
 
 
389 aa  116  5e-25  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1779  polysulphide reductase, NrfD  26.56 
 
 
387 aa  115  2.0000000000000002e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.263014 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1603  polysulphide reductase, NrfD  24.8 
 
 
385 aa  114  2.0000000000000002e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00601969  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0066  Polysulphide reductase NrfD  24.74 
 
 
387 aa  114  2.0000000000000002e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.411771 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1150  polysulphide reductase, NrfD  26.7 
 
 
385 aa  107  4e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0596071  normal  0.937608 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0048  polysulfide reductase, subunit C, putative  32.59 
 
 
391 aa  102  9e-21  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.939472 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0447  Polysulphide reductase NrfD  24.54 
 
 
389 aa  94  3e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.542742  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1424  polysulphide reductase, NrfD  23.06 
 
 
416 aa  70.5  0.00000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2523  Polysulphide reductase NrfD  22.8 
 
 
416 aa  70.1  0.00000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2436  Polysulphide reductase NrfD  22.02 
 
 
416 aa  68.6  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.136872  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2406  polysulphide reductase NrfD  23.16 
 
 
417 aa  67.4  0.0000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.148885  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4225  Polysulphide reductase NrfD  27.75 
 
 
389 aa  60.5  0.00000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000782128  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4229  Polysulphide reductase NrfD  29.88 
 
 
386 aa  58.9  0.0000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13670  polysulphide reductase  23.14 
 
 
414 aa  49.3  0.00009  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1906  polysulphide reductase, NrfD  25.11 
 
 
413 aa  49.3  0.0001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.105136  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2383  Polysulphide reductase NrfD  26.92 
 
 
408 aa  46.6  0.0007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.290901 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>