41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plut_0048 on replicon NC_007512
Organism: Chlorobium luteolum DSM 273



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007512  Plut_0048  polysulfide reductase, subunit C, putative  100 
 
 
391 aa  739    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.939472 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0707  Polysulphide reductase NrfD  37.76 
 
 
385 aa  256  5e-67  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1845  Polysulphide reductase NrfD  35.29 
 
 
384 aa  248  1e-64  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0829523  normal  0.148655 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0041  Polysulphide reductase NrfD  40.05 
 
 
383 aa  246  4e-64  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0260  Polysulphide reductase NrfD  36.76 
 
 
383 aa  238  1e-61  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0140  polysulphide reductase, NrfD  37.79 
 
 
383 aa  236  4e-61  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1603  polysulphide reductase, NrfD  34.02 
 
 
385 aa  223  6e-57  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00601969  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0454  polysulphide reductase NrfD  33.59 
 
 
389 aa  213  3.9999999999999995e-54  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1150  polysulphide reductase, NrfD  32.65 
 
 
385 aa  211  1e-53  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0596071  normal  0.937608 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0239  Polysulphide reductase NrfD  35.04 
 
 
386 aa  203  3e-51  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0066  Polysulphide reductase NrfD  31.36 
 
 
387 aa  201  3e-50  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.411771 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0274  Polysulphide reductase NrfD  32.4 
 
 
384 aa  200  3e-50  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00211929  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2275  reductase, transmembrane subunit, putative  31.74 
 
 
387 aa  197  2.0000000000000003e-49  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1779  polysulphide reductase, NrfD  31.88 
 
 
387 aa  189  1e-46  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.263014 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0447  Polysulphide reductase NrfD  29.62 
 
 
389 aa  168  1e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.542742  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2309  Polysulphide reductase NrfD  33.08 
 
 
358 aa  156  6e-37  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.823905  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2523  Polysulphide reductase NrfD  26.22 
 
 
416 aa  119  9.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2436  Polysulphide reductase NrfD  26.74 
 
 
416 aa  118  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.136872  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1424  polysulphide reductase, NrfD  26.74 
 
 
416 aa  117  3e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2406  polysulphide reductase NrfD  28.72 
 
 
417 aa  109  6e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.148885  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1944  polysulfide reductase, subunit C, putative  33.7 
 
 
339 aa  82.8  0.000000000000009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0481  Polysulphide reductase NrfD  26.12 
 
 
413 aa  74.7  0.000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1906  polysulphide reductase, NrfD  24.51 
 
 
413 aa  67.8  0.0000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.105136  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2403  Polysulphide reductase NrfD  26.69 
 
 
406 aa  65.9  0.000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.418724  normal  0.657025 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1867  Polysulphide reductase NrfD  23.9 
 
 
411 aa  63.9  0.000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0715566 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1631  Polysulphide reductase NrfD  27.35 
 
 
393 aa  62.4  0.00000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4225  Polysulphide reductase NrfD  25.23 
 
 
389 aa  62  0.00000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000782128  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2383  Polysulphide reductase NrfD  25.67 
 
 
408 aa  60.1  0.00000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.290901 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4229  Polysulphide reductase NrfD  26.67 
 
 
386 aa  59.3  0.0000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2372  Polysulphide reductase NrfD  24.3 
 
 
408 aa  58.5  0.0000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.103022  normal  0.75303 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13670  polysulphide reductase  26.02 
 
 
414 aa  56.6  0.0000008  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27750  polysulphide reductase  26.61 
 
 
388 aa  52.4  0.00001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.273464  normal 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3262  Polysulphide reductase NrfD  23.43 
 
 
442 aa  51.2  0.00003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0389204 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27690  polysulphide reductase  24.48 
 
 
384 aa  49.7  0.00009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1798  Polysulphide reductase NrfD  27.27 
 
 
391 aa  49.3  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1229  Polysulphide reductase NrfD  26.76 
 
 
304 aa  45.1  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02130  polysulphide reductase  22.68 
 
 
389 aa  44.7  0.003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0266  polysulphide reductase, NrfD  21.89 
 
 
393 aa  43.9  0.005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0102  molybdopterin oxidoreductase, membrane subunit, putative  21.89 
 
 
393 aa  43.1  0.007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.757619  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_112  molybdopterin oxidoreductase, membrane subunit  21.39 
 
 
393 aa  43.5  0.007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1196  Polysulphide reductase NrfD  24.43 
 
 
348 aa  43.1  0.008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>