112 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_0454 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_0454  polysulphide reductase NrfD  100 
 
 		 389 aa  778    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1150  polysulphide reductase, NrfD  63.64 
 
 		 385 aa  503  1e-141  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0596071  normal  0.937608 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0260  Polysulphide reductase NrfD  61.78 
 
 		 383 aa  500  1e-140  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1845  Polysulphide reductase NrfD  62.04 
 
 		 384 aa  491  9.999999999999999e-139  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0829523  normal  0.148655 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0274  Polysulphide reductase NrfD  59.95 
 
 		 384 aa  491  9.999999999999999e-139  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00211929  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1603  polysulphide reductase, NrfD  59.53 
 
 		 385 aa  476  1e-133  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00601969  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0066  Polysulphide reductase NrfD  58.7 
 
 		 387 aa  464  9.999999999999999e-131  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.411771 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0239  Polysulphide reductase NrfD  59.38 
 
 		 386 aa  468  9.999999999999999e-131  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0707  Polysulphide reductase NrfD  57.33 
 
 		 385 aa  459  9.999999999999999e-129  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0041  Polysulphide reductase NrfD  57.59 
 
 		 383 aa  453  1.0000000000000001e-126  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2275  reductase, transmembrane subunit, putative  57.66 
 
 		 387 aa  451  1e-125  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0140  polysulphide reductase, NrfD  58.16 
 
 		 383 aa  449  1e-125  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1779  polysulphide reductase, NrfD  56.48 
 
 		 387 aa  438  9.999999999999999e-123  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.263014 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0447  Polysulphide reductase NrfD  52.97 
 
 		 389 aa  404  1e-111  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.542742  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2406  polysulphide reductase NrfD  42.16 
 
 		 417 aa  278  1e-73  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.148885  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1424  polysulphide reductase, NrfD  41.9 
 
 		 416 aa  269  5e-71  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2436  Polysulphide reductase NrfD  41.65 
 
 		 416 aa  267  2e-70  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.136872  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2523  Polysulphide reductase NrfD  41.13 
 
 		 416 aa  263  4e-69  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2309  Polysulphide reductase NrfD  33.6 
 
 		 358 aa  212  1e-53  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.823905  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0048  polysulfide reductase, subunit C, putative  33.59 
 
 		 391 aa  201  1.9999999999999998e-50  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.939472 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0481  Polysulphide reductase NrfD  27.37 
 
 		 413 aa  146  8.000000000000001e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02130  polysulphide reductase  28.83 
 
 		 389 aa  142  9e-33  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2403  Polysulphide reductase NrfD  28.7 
 
 		 406 aa  126  7e-28  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.418724  normal  0.657025 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1631  Polysulphide reductase NrfD  27.32 
 
 		 393 aa  125  1e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1906  polysulphide reductase, NrfD  30.16 
 
 		 413 aa  123  4e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.105136  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1867  Polysulphide reductase NrfD  26.22 
 
 		 411 aa  121  3e-26  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0715566 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27690  polysulphide reductase  26.89 
 
 		 384 aa  119  6e-26  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2383  Polysulphide reductase NrfD  27.3 
 
 		 408 aa  118  9.999999999999999e-26  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.290901 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27750  polysulphide reductase  26.12 
 
 		 388 aa  118  1.9999999999999998e-25  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.273464  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13670  polysulphide reductase  32.73 
 
 		 414 aa  118  1.9999999999999998e-25  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2372  Polysulphide reductase NrfD  25.56 
 
 		 408 aa  114  3e-24  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.103022  normal  0.75303 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3262  Polysulphide reductase NrfD  25.26 
 
 		 442 aa  96.7  6e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0389204 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1944  polysulfide reductase, subunit C, putative  28.24 
 
 		 339 aa  95.5  2e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4225  Polysulphide reductase NrfD  23.98 
 
 		 389 aa  93.2  7e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000782128  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4229  Polysulphide reductase NrfD  27.06 
 
 		 386 aa  91.3  2e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0105  Polysulphide reductase NrfD  26.53 
 
 		 624 aa  90.9  4e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00267927 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0124  Polysulphide reductase NrfD  25.62 
 
 		 624 aa  84.3  0.000000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1709  polysulphide reductase, NrfD  27.55 
 
 		 397 aa  82.8  0.000000000000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0260794  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1636  polysulphide reductase, NrfD  24.24 
 
 		 466 aa  81.6  0.00000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.513529  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01305  molybdopterin oxidoredutase membrane subunit  23.47 
 
 		 593 aa  81.3  0.00000000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2552  molybdopterin oxidoreductase  22.87 
 
 		 430 aa  80.9  0.00000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0019  Polysulphide reductase NrfD  23.1 
 
 		 461 aa  76.6  0.0000000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0465805  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0223  Polysulphide reductase NrfD  24.27 
 
 		 484 aa  75.1  0.000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0217  polysulphide reductase NrfD  23.06 
 
 		 456 aa  74.3  0.000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0161  Polysulphide reductase NrfD  22.8 
 
 		 456 aa  74.3  0.000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.116185  normal  0.0186835 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1423  Polysulphide reductase NrfD  23.25 
 
 		 603 aa  73.6  0.000000000006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.15148  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3002  polysulphide reductase, NrfD  24.15 
 
 		 468 aa  72  0.00000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00130542 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0527  Polysulphide reductase NrfD  23.2 
 
 		 494 aa  70.1  0.00000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2211  molybdopterin oxidoreductase  22.04 
 
 		 451 aa  68.9  0.0000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.554905  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6224  polysulphide reductase NrfD  21.26 
 
 		 452 aa  68.2  0.0000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.468999  normal  0.0125183 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4141  polysulphide reductase, NrfD  24.64 
 
 		 476 aa  67.4  0.0000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5823  polysulphide reductase NrfD  22.16 
 
 		 451 aa  67.4  0.0000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.110878  normal  0.0226017 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1798  Polysulphide reductase NrfD  21.66 
 
 		 391 aa  67  0.0000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2414  Polysulphide reductase NrfD  21.48 
 
 		 451 aa  66.6  0.0000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.0075882  normal  0.349671 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0290  Polysulphide reductase NrfD  23 
 
 		 490 aa  66.6  0.0000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0581587  hitchhiker  0.000681201 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1239  polysulphide reductase, NrfD  21.93 
 
 		 454 aa  66.6  0.0000000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.39739  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1664  polysulphide reductase, NrfD  23.28 
 
 		 425 aa  66.2  0.0000000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2196  Polysulphide reductase NrfD  24.72 
 
 		 414 aa  66.2  0.0000000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.203832  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1196  Polysulphide reductase NrfD  24.43 
 
 		 348 aa  65.9  0.000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4782  Polysulphide reductase NrfD  22.04 
 
 		 400 aa  63.9  0.000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1464  polysulphide reductase NrfD  23.04 
 
 		 471 aa  63.5  0.000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.920048  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3475  Polysulphide reductase NrfD  22.47 
 
 		 477 aa  63.5  0.000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.198201  normal  0.251286 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4186  polysulphide reductase, NrfD  21.9 
 
 		 456 aa  62.4  0.00000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.317108  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0842  polysulphide reductase NrfD  23.12 
 
 		 482 aa  62.4  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.363179  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3385  Polysulphide reductase NrfD  24.45 
 
 		 486 aa  62.8  0.00000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.253171 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6892  Polysulphide reductase NrfD  22.16 
 
 		 454 aa  62.8  0.00000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3083  Polysulphide reductase NrfD  31.85 
 
 		 448 aa  60.8  0.00000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2775  polysulphide reductase, NrfD  25.1 
 
 		 472 aa  60.5  0.00000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0295745  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3386  polysulphide reductase, NrfD  25.63 
 
 		 403 aa  60.1  0.00000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5666  Polysulphide reductase NrfD  21.96 
 
 		 476 aa  60.1  0.00000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.544636  normal  0.989219 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3393  Polysulphide reductase NrfD  21.82 
 
 		 411 aa  59.7  0.00000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02400  polysulphide reductase  21.33 
 
 		 378 aa  59.3  0.0000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1562  Polysulphide reductase NrfD  25 
 
 		 435 aa  58.9  0.0000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.382538  normal  0.988263 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1594  Polysulphide reductase NrfD  24.86 
 
 		 463 aa  57.4  0.0000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3085  polysulphide reductase NrfD  23.69 
 
 		 405 aa  57.4  0.0000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.488046  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4429  polysulphide reductase, NrfD  22.54 
 
 		 466 aa  57.4  0.0000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.217558  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0102  molybdopterin oxidoreductase, membrane subunit, putative  21.64 
 
 		 393 aa  56.6  0.0000007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.757619  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0797  polysulphide reductase, NrfD  22.52 
 
 		 478 aa  55.1  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1957  Polysulphide reductase NrfD  23.14 
 
 		 403 aa  55.5  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0273  molybdopterin oxidoreductase, transmembrane subunit, putative  22.99 
 
 		 409 aa  55.5  0.000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2602  polysulphide reductase, NrfD  27.4 
 
 		 398 aa  53.9  0.000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0845  Polysulphide reductase NrfD  22.52 
 
 		 478 aa  54.3  0.000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.207631  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0849  Polysulphide reductase NrfD  22.52 
 
 		 478 aa  54.3  0.000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5954  Polysulphide reductase NrfD  20.33 
 
 		 445 aa  54.3  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.604828  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0166  polysulphide reductase, NrfD  22.74 
 
 		 403 aa  52.4  0.00001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.391929  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_112  molybdopterin oxidoreductase, membrane subunit  21.93 
 
 		 393 aa  52.4  0.00001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1740  putative tetrathionate reductase subunit C  25.64 
 
 		 361 aa  52  0.00002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.214544 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1812  polysulphide reductase, NrfD  22.59 
 
 		 456 aa  51.6  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2265  Polysulphide reductase NrfD  23.14 
 
 		 403 aa  52  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0834  Polysulphide reductase NrfD  20.2 
 
 		 448 aa  52  0.00002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.352451 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0266  polysulphide reductase, NrfD  22.98 
 
 		 393 aa  51.2  0.00003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2712  Polysulphide reductase NrfD  20.41 
 
 		 472 aa  50.8  0.00004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.544038  normal  0.344395 
 
 
-
 
NC_002936  DET0186  formate dehydrogenase, membrane subunit, putative  22.06 
 
 		 403 aa  50.1  0.00006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3997  polysulphide reductase NrfD  26.79 
 
 		 315 aa  48.9  0.0001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3984  Polysulphide reductase NrfD  21.15 
 
 		 478 aa  48.5  0.0002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.545328  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2687  Polysulphide reductase NrfD  22.37 
 
 		 417 aa  48.5  0.0002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.046719 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2040  Polysulphide reductase NrfD  23.64 
 
 		 404 aa  48.1  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.918159  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1865  Polysulphide reductase NrfD  27.56 
 
 		 304 aa  47  0.0006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0342025 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1337  Polysulphide reductase NrfD  24.51 
 
 		 304 aa  46.6  0.0007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.794344  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3543  Polysulphide reductase NrfD  29.6 
 
 		 469 aa  46.6  0.0008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.400001  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>