111 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_0260 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011830  Dhaf_0260  Polysulphide reductase NrfD  100 
 
 
383 aa  764    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1845  Polysulphide reductase NrfD  62.57 
 
 
384 aa  513  1e-144  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0829523  normal  0.148655 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1603  polysulphide reductase, NrfD  64.32 
 
 
385 aa  509  1e-143  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00601969  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0454  polysulphide reductase NrfD  61.78 
 
 
389 aa  500  1e-140  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0707  Polysulphide reductase NrfD  63.09 
 
 
385 aa  498  1e-140  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0239  Polysulphide reductase NrfD  64.49 
 
 
386 aa  499  1e-140  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1150  polysulphide reductase, NrfD  63.97 
 
 
385 aa  491  9.999999999999999e-139  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0596071  normal  0.937608 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0274  Polysulphide reductase NrfD  62.4 
 
 
384 aa  491  9.999999999999999e-139  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00211929  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0140  polysulphide reductase, NrfD  61.42 
 
 
383 aa  473  1e-132  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0041  Polysulphide reductase NrfD  60.47 
 
 
383 aa  471  1e-132  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0066  Polysulphide reductase NrfD  58.75 
 
 
387 aa  472  1e-132  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.411771 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1779  polysulphide reductase, NrfD  59.9 
 
 
387 aa  457  9.999999999999999e-129  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.263014 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0447  Polysulphide reductase NrfD  60.16 
 
 
389 aa  461  9.999999999999999e-129  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.542742  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2275  reductase, transmembrane subunit, putative  57.96 
 
 
387 aa  457  1e-127  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2406  polysulphide reductase NrfD  42.44 
 
 
417 aa  271  1e-71  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.148885  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2436  Polysulphide reductase NrfD  42.26 
 
 
416 aa  266  4e-70  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.136872  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1424  polysulphide reductase, NrfD  41.73 
 
 
416 aa  266  5.999999999999999e-70  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2523  Polysulphide reductase NrfD  40.16 
 
 
416 aa  256  4e-67  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2309  Polysulphide reductase NrfD  37.86 
 
 
358 aa  231  2e-59  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.823905  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0048  polysulfide reductase, subunit C, putative  36.76 
 
 
391 aa  225  1e-57  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.939472 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1631  Polysulphide reductase NrfD  31.18 
 
 
393 aa  138  2e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0481  Polysulphide reductase NrfD  28.99 
 
 
413 aa  135  9e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1867  Polysulphide reductase NrfD  29.7 
 
 
411 aa  123  5e-27  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0715566 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1906  polysulphide reductase, NrfD  26.8 
 
 
413 aa  123  6e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.105136  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02130  polysulphide reductase  28.12 
 
 
389 aa  120  3e-26  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27690  polysulphide reductase  30.07 
 
 
384 aa  117  3.9999999999999997e-25  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27750  polysulphide reductase  28.12 
 
 
388 aa  117  3.9999999999999997e-25  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.273464  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2372  Polysulphide reductase NrfD  27.3 
 
 
408 aa  113  6e-24  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.103022  normal  0.75303 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13670  polysulphide reductase  32.54 
 
 
414 aa  112  1.0000000000000001e-23  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2403  Polysulphide reductase NrfD  27.97 
 
 
406 aa  110  4.0000000000000004e-23  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.418724  normal  0.657025 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1944  polysulfide reductase, subunit C, putative  25.65 
 
 
339 aa  103  7e-21  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2383  Polysulphide reductase NrfD  26.44 
 
 
408 aa  102  8e-21  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.290901 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3262  Polysulphide reductase NrfD  26.65 
 
 
442 aa  96.7  7e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0389204 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2552  molybdopterin oxidoreductase  24.32 
 
 
430 aa  79  0.0000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4225  Polysulphide reductase NrfD  29.05 
 
 
389 aa  79  0.0000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000782128  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1798  Polysulphide reductase NrfD  24.85 
 
 
391 aa  77.4  0.0000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4229  Polysulphide reductase NrfD  26.19 
 
 
386 aa  75.9  0.000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1196  Polysulphide reductase NrfD  23.37 
 
 
348 aa  73.2  0.000000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1709  polysulphide reductase, NrfD  24.9 
 
 
397 aa  70.9  0.00000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0260794  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3393  Polysulphide reductase NrfD  21.57 
 
 
411 aa  70.9  0.00000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0273  molybdopterin oxidoreductase, transmembrane subunit, putative  24.37 
 
 
409 aa  70.5  0.00000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0102  molybdopterin oxidoreductase, membrane subunit, putative  25.58 
 
 
393 aa  68.9  0.0000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.757619  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0266  polysulphide reductase, NrfD  25.82 
 
 
393 aa  67.8  0.0000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2775  polysulphide reductase, NrfD  23.76 
 
 
472 aa  67  0.0000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0295745  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0223  Polysulphide reductase NrfD  26.18 
 
 
484 aa  67  0.0000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2196  Polysulphide reductase NrfD  23.51 
 
 
414 aa  66.6  0.0000000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.203832  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01305  molybdopterin oxidoredutase membrane subunit  26.09 
 
 
593 aa  65.9  0.000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_112  molybdopterin oxidoreductase, membrane subunit  24.91 
 
 
393 aa  65.1  0.000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1636  polysulphide reductase, NrfD  24.92 
 
 
466 aa  63.5  0.000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.513529  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02400  polysulphide reductase  24.93 
 
 
378 aa  63.5  0.000000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2211  molybdopterin oxidoreductase  24.56 
 
 
451 aa  62.8  0.000000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.554905  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3475  Polysulphide reductase NrfD  24.23 
 
 
477 aa  62.4  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.198201  normal  0.251286 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1423  Polysulphide reductase NrfD  22.11 
 
 
603 aa  62  0.00000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.15148  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0217  polysulphide reductase NrfD  21.91 
 
 
456 aa  60.8  0.00000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3083  Polysulphide reductase NrfD  31.15 
 
 
448 aa  61.2  0.00000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0161  Polysulphide reductase NrfD  21.55 
 
 
456 aa  61.2  0.00000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.116185  normal  0.0186835 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0105  Polysulphide reductase NrfD  23.78 
 
 
624 aa  61.2  0.00000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00267927 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5666  Polysulphide reductase NrfD  25.52 
 
 
476 aa  60.8  0.00000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.544636  normal  0.989219 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2687  Polysulphide reductase NrfD  23.47 
 
 
417 aa  60.8  0.00000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.046719 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0019  Polysulphide reductase NrfD  21.35 
 
 
461 aa  59.7  0.00000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0465805  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0797  polysulphide reductase, NrfD  22.86 
 
 
478 aa  59.3  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0845  Polysulphide reductase NrfD  22.86 
 
 
478 aa  59.3  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.207631  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4782  Polysulphide reductase NrfD  23.32 
 
 
400 aa  59.3  0.0000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0849  Polysulphide reductase NrfD  22.86 
 
 
478 aa  59.3  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1664  polysulphide reductase, NrfD  22.08 
 
 
425 aa  58.5  0.0000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2271  molybdopterin oxidoreductase, transmembrane subunit, putative  20.57 
 
 
419 aa  58.5  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3085  polysulphide reductase NrfD  24.73 
 
 
405 aa  58.5  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.488046  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5954  Polysulphide reductase NrfD  20.83 
 
 
445 aa  57  0.0000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.604828  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1239  polysulphide reductase, NrfD  21.98 
 
 
454 aa  56.6  0.0000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.39739  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1957  Polysulphide reductase NrfD  28.03 
 
 
403 aa  56.6  0.0000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2265  Polysulphide reductase NrfD  28.03 
 
 
403 aa  56.2  0.0000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1812  polysulphide reductase, NrfD  22.59 
 
 
456 aa  56.2  0.000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2602  polysulphide reductase, NrfD  26.63 
 
 
398 aa  55.8  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0290  Polysulphide reductase NrfD  25.17 
 
 
490 aa  56.2  0.000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0581587  hitchhiker  0.000681201 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1562  Polysulphide reductase NrfD  29.79 
 
 
435 aa  55.8  0.000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.382538  normal  0.988263 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4186  polysulphide reductase, NrfD  21.17 
 
 
456 aa  55.1  0.000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.317108  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0842  polysulphide reductase NrfD  23.45 
 
 
482 aa  55.1  0.000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.363179  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0124  Polysulphide reductase NrfD  22.7 
 
 
624 aa  55.5  0.000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1229  Polysulphide reductase NrfD  26.95 
 
 
304 aa  55.5  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6892  Polysulphide reductase NrfD  21.94 
 
 
454 aa  55.1  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3386  polysulphide reductase, NrfD  24.84 
 
 
403 aa  53.5  0.000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6224  polysulphide reductase NrfD  20.85 
 
 
452 aa  53.9  0.000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.468999  normal  0.0125183 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3385  Polysulphide reductase NrfD  23.32 
 
 
486 aa  53.9  0.000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.253171 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3002  polysulphide reductase, NrfD  22.7 
 
 
468 aa  53.5  0.000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00130542 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1061  polysulphide reductase, NrfD  28.8 
 
 
401 aa  53.1  0.000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.079733 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2712  Polysulphide reductase NrfD  21.02 
 
 
472 aa  53.1  0.000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.544038  normal  0.344395 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1162  Polysulphide reductase NrfD  32 
 
 
323 aa  52.4  0.00001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.130935  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0451  Polysulphide reductase NrfD  22.41 
 
 
445 aa  52  0.00002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3543  Polysulphide reductase NrfD  29.92 
 
 
469 aa  51.2  0.00003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.400001  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5823  polysulphide reductase NrfD  22.34 
 
 
451 aa  51.2  0.00003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.110878  normal  0.0226017 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0527  Polysulphide reductase NrfD  21.94 
 
 
494 aa  51.2  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1740  putative tetrathionate reductase subunit C  23.5 
 
 
361 aa  50.8  0.00004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.214544 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2474  molybdopterin oxidoreductase, membrane subunit  24.81 
 
 
400 aa  49.7  0.00008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.750101  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1464  polysulphide reductase NrfD  22.47 
 
 
471 aa  49.3  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.920048  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2549  polysulphide reductase NrfD  23.02 
 
 
410 aa  48.5  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0779  formate dehydrogenase, b-type cytochrome subunit, putative  28.33 
 
 
401 aa  48.1  0.0003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4141  polysulphide reductase, NrfD  22.03 
 
 
476 aa  47.4  0.0004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3933  polysulphide reductase NrfD  23.78 
 
 
493 aa  47  0.0006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.053608  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4429  polysulphide reductase, NrfD  21.25 
 
 
466 aa  46.6  0.0007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.217558  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4045  polysulfide reductase, subunit C  24.45 
 
 
313 aa  46.6  0.0008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>