34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_2309 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_2309  Polysulphide reductase NrfD  100 
 
 		 358 aa  697    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.823905  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0041  Polysulphide reductase NrfD  46.32 
 
 		 383 aa  314  1.9999999999999998e-84  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1845  Polysulphide reductase NrfD  42.97 
 
 		 384 aa  308  9e-83  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0829523  normal  0.148655 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0707  Polysulphide reductase NrfD  43.49 
 
 		 385 aa  306  4.0000000000000004e-82  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0140  polysulphide reductase, NrfD  45.43 
 
 		 383 aa  306  5.0000000000000004e-82  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0260  Polysulphide reductase NrfD  37.86 
 
 		 383 aa  253  4.0000000000000004e-66  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0454  polysulphide reductase NrfD  34.12 
 
 		 389 aa  229  7e-59  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1603  polysulphide reductase, NrfD  33.59 
 
 		 385 aa  227  2e-58  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00601969  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1150  polysulphide reductase, NrfD  36.58 
 
 		 385 aa  227  3e-58  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0596071  normal  0.937608 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0274  Polysulphide reductase NrfD  34.11 
 
 		 384 aa  220  3.9999999999999997e-56  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00211929  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0239  Polysulphide reductase NrfD  35.53 
 
 		 386 aa  211  1e-53  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0066  Polysulphide reductase NrfD  32.28 
 
 		 387 aa  209  4e-53  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.411771 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1779  polysulphide reductase, NrfD  33.6 
 
 		 387 aa  205  9e-52  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.263014 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0447  Polysulphide reductase NrfD  33.42 
 
 		 389 aa  191  2e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.542742  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2275  reductase, transmembrane subunit, putative  32.47 
 
 		 387 aa  188  1e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0048  polysulfide reductase, subunit C, putative  34.27 
 
 		 391 aa  166  5.9999999999999996e-40  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.939472 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1944  polysulfide reductase, subunit C, putative  37.68 
 
 		 339 aa  166  5.9999999999999996e-40  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2406  polysulphide reductase NrfD  30.39 
 
 		 417 aa  141  1.9999999999999998e-32  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.148885  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2523  Polysulphide reductase NrfD  27.51 
 
 		 416 aa  131  2.0000000000000002e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2436  Polysulphide reductase NrfD  28.02 
 
 		 416 aa  130  5.0000000000000004e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.136872  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1424  polysulphide reductase, NrfD  28.64 
 
 		 416 aa  127  2.0000000000000002e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0481  Polysulphide reductase NrfD  26.15 
 
 		 413 aa  66.2  0.0000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1631  Polysulphide reductase NrfD  25.55 
 
 		 393 aa  60.8  0.00000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1906  polysulphide reductase, NrfD  22.75 
 
 		 413 aa  54.7  0.000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.105136  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02130  polysulphide reductase  24.38 
 
 		 389 aa  54.3  0.000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27690  polysulphide reductase  26.23 
 
 		 384 aa  52.8  0.00001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2383  Polysulphide reductase NrfD  26.92 
 
 		 408 aa  51.6  0.00002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.290901 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4225  Polysulphide reductase NrfD  29.37 
 
 		 389 aa  50.8  0.00003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000782128  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2403  Polysulphide reductase NrfD  28.04 
 
 		 406 aa  50.4  0.00005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.418724  normal  0.657025 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27750  polysulphide reductase  26.47 
 
 		 388 aa  49.7  0.00007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.273464  normal  1 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3262  Polysulphide reductase NrfD  23.54 
 
 		 442 aa  49.3  0.0001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0389204 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13670  polysulphide reductase  24.58 
 
 		 414 aa  45.8  0.001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2372  Polysulphide reductase NrfD  24.81 
 
 		 408 aa  46.2  0.001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.103022  normal  0.75303 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4229  Polysulphide reductase NrfD  27.48 
 
 		 386 aa  45.1  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>