85 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Elen_0451 on replicon NC_013204
Organism: Eggerthella lenta DSM 2243



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013204  Elen_0451  Polysulphide reductase NrfD  100 
 
 
445 aa  850    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0481  Polysulphide reductase NrfD  25.78 
 
 
413 aa  89.4  1e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1631  Polysulphide reductase NrfD  25.76 
 
 
393 aa  85.9  0.000000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27750  polysulphide reductase  24.42 
 
 
388 aa  84  0.000000000000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.273464  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1511  Polysulphide reductase NrfD  26.32 
 
 
382 aa  82.8  0.00000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0266  polysulphide reductase, NrfD  25.14 
 
 
393 aa  75.5  0.000000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2403  Polysulphide reductase NrfD  26.95 
 
 
406 aa  74.3  0.000000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.418724  normal  0.657025 
 
 
-
 
NC_002936  DET0102  molybdopterin oxidoreductase, membrane subunit, putative  23.31 
 
 
393 aa  73.9  0.000000000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.757619  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0355  polysulphide reductase, NrfD  30.37 
 
 
393 aa  73.2  0.000000000009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0121208  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3666  Polysulphide reductase NrfD  23.91 
 
 
380 aa  73.2  0.00000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.396142  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_112  molybdopterin oxidoreductase, membrane subunit  24.03 
 
 
393 aa  70.9  0.00000000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0273  molybdopterin oxidoreductase, transmembrane subunit, putative  23.47 
 
 
409 aa  68.6  0.0000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27690  polysulphide reductase  26.22 
 
 
384 aa  67  0.0000000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1562  Polysulphide reductase NrfD  25.44 
 
 
435 aa  65.9  0.000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.382538  normal  0.988263 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2943  polysulphide reductase, NrfD  28.68 
 
 
394 aa  65.5  0.000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.486448  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0292  Polysulphide reductase NrfD  25.25 
 
 
396 aa  65.5  0.000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.468469  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1798  Polysulphide reductase NrfD  27.25 
 
 
391 aa  63.9  0.000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1906  polysulphide reductase, NrfD  25 
 
 
413 aa  63.9  0.000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.105136  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4229  Polysulphide reductase NrfD  28.33 
 
 
386 aa  63.5  0.000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3262  Polysulphide reductase NrfD  24.56 
 
 
442 aa  63.2  0.000000009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0389204 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4225  Polysulphide reductase NrfD  25.25 
 
 
389 aa  63.2  0.00000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000782128  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1867  Polysulphide reductase NrfD  24.24 
 
 
411 aa  62  0.00000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0715566 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02130  polysulphide reductase  23.78 
 
 
389 aa  61.2  0.00000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3346  Polysulphide reductase NrfD  20.82 
 
 
402 aa  60.8  0.00000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000267  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0214  polysulphide reductase, NrfD  25.66 
 
 
397 aa  60.8  0.00000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2372  Polysulphide reductase NrfD  25.66 
 
 
408 aa  58.9  0.0000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.103022  normal  0.75303 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3393  Polysulphide reductase NrfD  21.62 
 
 
411 aa  58.9  0.0000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02400  polysulphide reductase  26.86 
 
 
378 aa  58.5  0.0000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1957  Polysulphide reductase NrfD  22.78 
 
 
403 aa  58.9  0.0000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2265  Polysulphide reductase NrfD  22.08 
 
 
403 aa  57.8  0.0000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2383  Polysulphide reductase NrfD  24.25 
 
 
408 aa  57.4  0.0000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.290901 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2935  molybdopterin oxidoreductase, transmembrane subunit, putative  23.11 
 
 
418 aa  57.4  0.0000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.52066  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3085  polysulphide reductase NrfD  25.71 
 
 
405 aa  57  0.0000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.488046  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4782  Polysulphide reductase NrfD  23.5 
 
 
400 aa  57  0.0000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3083  Polysulphide reductase NrfD  27.06 
 
 
448 aa  56.2  0.000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4619  Polysulphide reductase NrfD  24.45 
 
 
416 aa  55.5  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13670  polysulphide reductase  22.98 
 
 
414 aa  55.8  0.000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0170  Polysulphide reductase NrfD  24 
 
 
378 aa  54.7  0.000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1845  Polysulphide reductase NrfD  23.53 
 
 
384 aa  54.3  0.000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0829523  normal  0.148655 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4106  polysulphide reductase NrfD  27.59 
 
 
311 aa  53.9  0.000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.354906  normal  0.247792 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0166  polysulphide reductase, NrfD  24.33 
 
 
403 aa  53.9  0.000006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.391929  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3282  Polysulphide reductase NrfD  25.45 
 
 
413 aa  53.1  0.000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3188  Polysulphide reductase NrfD  25.45 
 
 
413 aa  53.1  0.000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0920163  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0834  Polysulphide reductase NrfD  24.57 
 
 
448 aa  53.1  0.000009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.352451 
 
 
-
 
NC_002936  DET0186  formate dehydrogenase, membrane subunit, putative  24.6 
 
 
403 aa  53.1  0.00001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0260  Polysulphide reductase NrfD  22.41 
 
 
383 aa  52  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3088  polysulphide reductase, NrfD  25 
 
 
414 aa  52  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.187838  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0041  Polysulphide reductase NrfD  23.94 
 
 
383 aa  50.8  0.00005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0066  Polysulphide reductase NrfD  20.83 
 
 
387 aa  50.4  0.00007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.411771 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2271  molybdopterin oxidoreductase, transmembrane subunit, putative  21.34 
 
 
419 aa  49.7  0.0001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0274  Polysulphide reductase NrfD  22.79 
 
 
384 aa  49.3  0.0001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00211929  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_175  molybdopterin oxidoreductase, formate dehydrogenase membrane subunit  23.66 
 
 
403 aa  49.3  0.0002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.100817  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0327  polysulphide reductase, NrfD  22.83 
 
 
417 aa  48.5  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.180424  hitchhiker  0.00000238958 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1709  polysulphide reductase, NrfD  22 
 
 
397 aa  48.9  0.0002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0260794  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0447  Polysulphide reductase NrfD  22.7 
 
 
389 aa  49.3  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.542742  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3521  polysulphide reductase NrfD  26.44 
 
 
405 aa  47.8  0.0004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.538127  normal  0.625626 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3137  putative hydrogenase 2 b cytochrome subunit  21.88 
 
 
446 aa  47.4  0.0005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1664  polysulphide reductase, NrfD  26.01 
 
 
425 aa  47.4  0.0005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0779  formate dehydrogenase, b-type cytochrome subunit, putative  20.65 
 
 
401 aa  47  0.0006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3386  polysulphide reductase, NrfD  20.1 
 
 
403 aa  47  0.0006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0105  Polysulphide reductase NrfD  24.46 
 
 
624 aa  47  0.0006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00267927 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2252  polysulphide reductase NrfD  24.15 
 
 
402 aa  47  0.0007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.38952  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0387  phosphatidylglycerophosphatase A  28.57 
 
 
311 aa  46.2  0.001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.682978  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2552  molybdopterin oxidoreductase  26.19 
 
 
430 aa  45.8  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1066  Polysulphide reductase NrfD  24.79 
 
 
412 aa  45.4  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.4681800000000002e-26 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1801  polysulphide reductase NrfD  24.43 
 
 
408 aa  45.4  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1196  Polysulphide reductase NrfD  22.05 
 
 
348 aa  45.1  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0936  polysulphide reductase, NrfD  29.28 
 
 
290 aa  45.4  0.002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  decreased coverage  0.00000369278  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2275  reductase, transmembrane subunit, putative  19.1 
 
 
387 aa  45.8  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0124  Polysulphide reductase NrfD  23.35 
 
 
624 aa  45.4  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2687  Polysulphide reductase NrfD  21.29 
 
 
417 aa  44.7  0.003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.046719 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3196  Polysulphide reductase NrfD  25.43 
 
 
412 aa  44.7  0.003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1061  polysulphide reductase, NrfD  20.45 
 
 
401 aa  44.7  0.003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.079733 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3520  polysulphide reductase, NrfD  24.66 
 
 
417 aa  44.7  0.003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000358671  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0651  hmc operon protein 3  21.92 
 
 
389 aa  44.7  0.003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.958991  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1125  putative hydrogenase 2 b cytochrome subunit  21.18 
 
 
435 aa  43.9  0.006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0461  putative hydrogenase cytochrome b subunit  26.11 
 
 
381 aa  43.5  0.007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0239  Polysulphide reductase NrfD  20.36 
 
 
386 aa  43.9  0.007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03110  formate-dependent nitrite reductase, membrane component  25.32 
 
 
320 aa  43.5  0.007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0454  polysulphide reductase NrfD  21.27 
 
 
389 aa  43.5  0.008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4045  polysulfide reductase, subunit C  23.62 
 
 
313 aa  43.5  0.008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0864  polysulphide reductase, NrfD  24.07 
 
 
415 aa  43.5  0.008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0258189  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1464  polysulphide reductase NrfD  24.78 
 
 
347 aa  43.1  0.009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2318  tRNA uridine 5-carboxymethylaminomethyl modification enzyme GidA  25.09 
 
 
294 aa  43.1  0.009  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1150  polysulphide reductase, NrfD  23.01 
 
 
385 aa  43.1  0.01  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0596071  normal  0.937608 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>