106 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_0273 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013223  Dret_0273  molybdopterin oxidoreductase, transmembrane subunit, putative  100 
 
 
409 aa  822    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3393  Polysulphide reductase NrfD  72.99 
 
 
411 aa  631  1e-180  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2935  molybdopterin oxidoreductase, transmembrane subunit, putative  72.06 
 
 
418 aa  630  1e-179  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.52066  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2271  molybdopterin oxidoreductase, transmembrane subunit, putative  71.15 
 
 
419 aa  618  1e-176  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2687  Polysulphide reductase NrfD  69.61 
 
 
417 aa  600  1e-170  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.046719 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2549  polysulphide reductase NrfD  54.28 
 
 
410 aa  442  1e-123  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0608  molybdopterin oxidoreductase, transmembrane subunit, putative  54.48 
 
 
417 aa  436  1e-121  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0543645  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2602  polysulphide reductase, NrfD  31.19 
 
 
398 aa  140  3.9999999999999997e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1957  Polysulphide reductase NrfD  30.89 
 
 
403 aa  128  2.0000000000000002e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2265  Polysulphide reductase NrfD  30.38 
 
 
403 aa  124  3e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0292  Polysulphide reductase NrfD  28.8 
 
 
396 aa  123  5e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.468469  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1061  polysulphide reductase, NrfD  28.03 
 
 
401 aa  120  3.9999999999999996e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.079733 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0779  formate dehydrogenase, b-type cytochrome subunit, putative  28.34 
 
 
401 aa  120  4.9999999999999996e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3386  polysulphide reductase, NrfD  30.61 
 
 
403 aa  119  9.999999999999999e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2943  polysulphide reductase, NrfD  27.5 
 
 
394 aa  112  1.0000000000000001e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.486448  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0170  Polysulphide reductase NrfD  27.59 
 
 
378 aa  111  3e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1578  putative hydrogenase cytochrome b subunit  29.28 
 
 
394 aa  110  4.0000000000000004e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.534156  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1044  putative hydrogenase cytochrome b subunit  28.73 
 
 
401 aa  108  2e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0186  formate dehydrogenase, membrane subunit, putative  27.45 
 
 
403 aa  102  1e-20  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2087  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  29.21 
 
 
731 aa  102  1e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1198  Polysulphide reductase NrfD  27.84 
 
 
400 aa  102  1e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_175  molybdopterin oxidoreductase, formate dehydrogenase membrane subunit  27.45 
 
 
403 aa  102  1e-20  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.100817  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1790  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  29.21 
 
 
731 aa  101  2e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0166  polysulphide reductase, NrfD  27.45 
 
 
403 aa  101  3e-20  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.391929  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0570  Polysulphide reductase NrfD  26.58 
 
 
389 aa  99  1e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1869  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  28.04 
 
 
731 aa  98.2  2e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.856186  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2252  polysulphide reductase NrfD  25.53 
 
 
402 aa  97.4  4e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.38952  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0160  polysulphide reductase, NrfD  27.96 
 
 
402 aa  97.4  4e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3042  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  27.97 
 
 
744 aa  96.7  6e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2596  Polysulphide reductase NrfD  28.28 
 
 
388 aa  94.4  3e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1116  polysulphide reductase, NrfD  29.64 
 
 
386 aa  94.4  4e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2040  Polysulphide reductase NrfD  29.95 
 
 
404 aa  93.2  7e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.918159  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0455  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  26.8 
 
 
729 aa  89.4  1e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.453465 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4619  Polysulphide reductase NrfD  28.53 
 
 
416 aa  87  6e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0651  hmc operon protein 3  26.49 
 
 
389 aa  86.3  8e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.958991  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0875  Polysulphide reductase NrfD  26.98 
 
 
402 aa  85.9  0.000000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.946275  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1801  polysulphide reductase NrfD  26.46 
 
 
408 aa  84.7  0.000000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4239  nickel-dependent hydrogenase, membrane protein  33.53 
 
 
443 aa  84  0.000000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.442151  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2407  polysulphide reductase, NrfD  26.26 
 
 
388 aa  83.6  0.000000000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.0385052 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0461  putative hydrogenase cytochrome b subunit  32.11 
 
 
381 aa  83.6  0.000000000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1957  Polysulphide reductase NrfD  25.78 
 
 
403 aa  80.9  0.00000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0356047  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3521  polysulphide reductase NrfD  32.32 
 
 
405 aa  79.3  0.0000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.538127  normal  0.625626 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0524  putative hydrogenase 2 b cytochrome subunit  30.67 
 
 
416 aa  78.6  0.0000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.920848  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3972  putative hydrogenase 2 b cytochrome subunit  24.27 
 
 
386 aa  76.3  0.000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.158247  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2006  polysulphide reductase, NrfD  25.78 
 
 
403 aa  74.3  0.000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1872  Polysulphide reductase NrfD  25.78 
 
 
403 aa  73.6  0.000000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4090  putative hydrogenase 2 b cytochrome subunit  23.18 
 
 
388 aa  73.2  0.000000000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.194025  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0260  Polysulphide reductase NrfD  24.37 
 
 
383 aa  70.5  0.00000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3401  putative hydrogenase 2 b cytochrome subunit  25.77 
 
 
392 aa  69.3  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3395  putative hydrogenase 2 b cytochrome subunit  25.77 
 
 
392 aa  69.3  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.522703 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3330  putative hydrogenase 2 b cytochrome subunit  25.77 
 
 
392 aa  69.3  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.353265  normal  0.837141 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3321  putative hydrogenase 2 b cytochrome subunit  25.77 
 
 
392 aa  69.3  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.437559  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3496  putative hydrogenase 2 b cytochrome subunit  25.77 
 
 
392 aa  69.3  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.426978  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0451  Polysulphide reductase NrfD  23.47 
 
 
445 aa  68.6  0.0000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3524  polysulphide reductase NrfD  26.42 
 
 
401 aa  67.8  0.0000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.902311  normal  0.369035 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3464  putative hydrogenase 2 b cytochrome subunit  25.13 
 
 
392 aa  67.4  0.0000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3422  putative hydrogenase 2 b cytochrome subunit  25.13 
 
 
392 aa  67.4  0.0000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02871  predicted hydrogenase 2 cytochrome b type component  25.13 
 
 
392 aa  67  0.0000000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0701  Polysulphide reductase NrfD  25.13 
 
 
392 aa  67  0.0000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3175  putative hydrogenase 2 b cytochrome subunit  25.13 
 
 
392 aa  67  0.0000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0698  putative hydrogenase 2 b cytochrome subunit  25.13 
 
 
392 aa  67  0.0000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3281  putative hydrogenase 2 b cytochrome subunit  25.13 
 
 
392 aa  67  0.0000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4307  putative hydrogenase 2 b cytochrome subunit  25.13 
 
 
392 aa  67  0.0000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02820  hypothetical protein  25.13 
 
 
392 aa  67  0.0000000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0479  putative hydrogenase 2 b cytochrome subunit  29.82 
 
 
415 aa  66.6  0.0000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.304039  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0512  putative hydrogenase 2 b cytochrome subunit  28.92 
 
 
415 aa  66.6  0.0000000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2275  reductase, transmembrane subunit, putative  25 
 
 
387 aa  65.9  0.000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0507  putative hydrogenase 2 b cytochrome subunit  28.92 
 
 
415 aa  66.2  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2504  putative hydrogenase 2 b cytochrome subunit  30.16 
 
 
382 aa  65.5  0.000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.130941 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1412  putative hydrogenase 2 b cytochrome subunit  24.33 
 
 
399 aa  65.1  0.000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0274  Polysulphide reductase NrfD  23.68 
 
 
384 aa  65.1  0.000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00211929  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3262  Polysulphide reductase NrfD  25.5 
 
 
442 aa  63.2  0.000000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0389204 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0146  putative hydrogenase 2 b cytochrome subunit  23 
 
 
421 aa  62.4  0.00000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1945  putative hydrogenase 2 b cytochrome subunit  29.5 
 
 
438 aa  60.8  0.00000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2532  putative hydrogenase 2 b cytochrome subunit  27.78 
 
 
399 aa  59.7  0.00000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.346938  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0239  Polysulphide reductase NrfD  23.72 
 
 
386 aa  59.3  0.0000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1125  putative hydrogenase 2 b cytochrome subunit  30.71 
 
 
435 aa  58.5  0.0000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0784  putative hydrogenase 2 b cytochrome subunit  30.82 
 
 
442 aa  57.4  0.0000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.242896  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3137  putative hydrogenase 2 b cytochrome subunit  29.92 
 
 
446 aa  57.8  0.0000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0066  Polysulphide reductase NrfD  23.06 
 
 
387 aa  56.6  0.0000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.411771 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0454  polysulphide reductase NrfD  22.99 
 
 
389 aa  55.5  0.000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0447  Polysulphide reductase NrfD  23.39 
 
 
389 aa  55.5  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.542742  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27690  polysulphide reductase  29.01 
 
 
384 aa  54.7  0.000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13670  polysulphide reductase  22.95 
 
 
414 aa  54.3  0.000004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02130  polysulphide reductase  24.44 
 
 
389 aa  52.8  0.00001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0664  polysulphide reductase-like protein  24.87 
 
 
451 aa  52.4  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0677  polysulphide reductase-like protein  24.68 
 
 
451 aa  50.8  0.00004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.56556e-16 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2236  putative hydrogenase 2 b cytochrome subunit  26.09 
 
 
414 aa  50.8  0.00004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.263965 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1779  polysulphide reductase, NrfD  22.31 
 
 
387 aa  48.5  0.0002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.263014 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1631  Polysulphide reductase NrfD  31.97 
 
 
393 aa  48.9  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2383  Polysulphide reductase NrfD  24.15 
 
 
408 aa  48.1  0.0003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.290901 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2403  Polysulphide reductase NrfD  32.11 
 
 
406 aa  47.8  0.0004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.418724  normal  0.657025 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1984  putative hydrogenase 2 b cytochrome subunit  22.06 
 
 
414 aa  47.4  0.0005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00764136  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1664  polysulphide reductase, NrfD  24.14 
 
 
425 aa  46.6  0.0009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0102  molybdopterin oxidoreductase, membrane subunit, putative  22.56 
 
 
393 aa  46.2  0.001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.757619  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1704  polysulphide reductase-like protein  24.25 
 
 
443 aa  46.2  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.990037  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0041  Polysulphide reductase NrfD  24.81 
 
 
383 aa  45.8  0.001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1867  Polysulphide reductase NrfD  27.34 
 
 
411 aa  45.8  0.001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0715566 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1709  polysulphide reductase, NrfD  25.23 
 
 
397 aa  44.3  0.004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0260794  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3346  Polysulphide reductase NrfD  27 
 
 
402 aa  44.3  0.004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000267  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>