90 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_0875 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013223  Dret_0875  Polysulphide reductase NrfD  100 
 
 		 402 aa  811    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.946275  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2252  polysulphide reductase NrfD  73.13 
 
 		 402 aa  585  1e-166  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.38952  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0651  hmc operon protein 3  71.62 
 
 		 389 aa  549  1e-155  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.958991  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2407  polysulphide reductase, NrfD  71.08 
 
 		 388 aa  547  1e-154  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0385052 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2596  Polysulphide reductase NrfD  69.84 
 
 		 388 aa  541  1e-153  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0570  Polysulphide reductase NrfD  65.22 
 
 		 389 aa  488  1e-137  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2040  Polysulphide reductase NrfD  61.44 
 
 		 404 aa  463  1e-129  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.918159  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1957  Polysulphide reductase NrfD  50.27 
 
 		 403 aa  367  1e-100  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0356047  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1872  Polysulphide reductase NrfD  50.27 
 
 		 403 aa  357  1.9999999999999998e-97  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2006  polysulphide reductase, NrfD  50.54 
 
 		 403 aa  357  1.9999999999999998e-97  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1801  polysulphide reductase NrfD  47.83 
 
 		 408 aa  350  2e-95  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0664  polysulphide reductase-like protein  38.46 
 
 		 451 aa  262  1e-68  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3654  polysulphide reductase-like protein  41.35 
 
 		 465 aa  260  4e-68  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.731183  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0677  polysulphide reductase-like protein  39.73 
 
 		 451 aa  257  3e-67  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.56556e-16 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1704  polysulphide reductase-like protein  36.54 
 
 		 443 aa  232  1e-59  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.990037  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2602  polysulphide reductase, NrfD  39.78 
 
 		 398 aa  225  1e-57  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2265  Polysulphide reductase NrfD  37.11 
 
 		 403 aa  218  1e-55  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1957  Polysulphide reductase NrfD  36.86 
 
 		 403 aa  217  2.9999999999999998e-55  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1061  polysulphide reductase, NrfD  35.97 
 
 		 401 aa  217  4e-55  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.079733 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0779  formate dehydrogenase, b-type cytochrome subunit, putative  35.26 
 
 		 401 aa  216  5e-55  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3386  polysulphide reductase, NrfD  35.86 
 
 		 403 aa  213  3.9999999999999995e-54  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1198  Polysulphide reductase NrfD  37.15 
 
 		 400 aa  197  4.0000000000000005e-49  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2943  polysulphide reductase, NrfD  34.78 
 
 		 394 aa  195  1e-48  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.486448  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3137  putative hydrogenase 2 b cytochrome subunit  32.92 
 
 		 446 aa  194  3e-48  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0292  Polysulphide reductase NrfD  36.31 
 
 		 396 aa  194  3e-48  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.468469  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0170  Polysulphide reductase NrfD  35.51 
 
 		 378 aa  193  4e-48  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0146  putative hydrogenase 2 b cytochrome subunit  33.58 
 
 		 421 aa  189  1e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1125  putative hydrogenase 2 b cytochrome subunit  32.19 
 
 		 435 aa  188  2e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0166  polysulphide reductase, NrfD  33.51 
 
 		 403 aa  186  5e-46  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.391929  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_175  molybdopterin oxidoreductase, formate dehydrogenase membrane subunit  34.36 
 
 		 403 aa  182  8.000000000000001e-45  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.100817  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0186  formate dehydrogenase, membrane subunit, putative  34.08 
 
 		 403 aa  181  1e-44  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3972  putative hydrogenase 2 b cytochrome subunit  30.48 
 
 		 386 aa  177  2e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.158247  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3496  putative hydrogenase 2 b cytochrome subunit  32.28 
 
 		 392 aa  175  9.999999999999999e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.426978  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3321  putative hydrogenase 2 b cytochrome subunit  32.28 
 
 		 392 aa  175  9.999999999999999e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.437559  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3330  putative hydrogenase 2 b cytochrome subunit  32.28 
 
 		 392 aa  175  9.999999999999999e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.353265  normal  0.837141 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3395  putative hydrogenase 2 b cytochrome subunit  32.28 
 
 		 392 aa  175  9.999999999999999e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.522703 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3401  putative hydrogenase 2 b cytochrome subunit  32.28 
 
 		 392 aa  175  9.999999999999999e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1116  polysulphide reductase, NrfD  37.15 
 
 		 386 aa  175  1.9999999999999998e-42  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4307  putative hydrogenase 2 b cytochrome subunit  31.11 
 
 		 392 aa  174  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02871  predicted hydrogenase 2 cytochrome b type component  31.11 
 
 		 392 aa  174  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0701  Polysulphide reductase NrfD  31.11 
 
 		 392 aa  174  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02820  hypothetical protein  31.11 
 
 		 392 aa  174  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1945  putative hydrogenase 2 b cytochrome subunit  32.75 
 
 		 438 aa  174  2.9999999999999996e-42  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0698  putative hydrogenase 2 b cytochrome subunit  31.11 
 
 		 392 aa  174  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3175  putative hydrogenase 2 b cytochrome subunit  31.11 
 
 		 392 aa  174  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3281  putative hydrogenase 2 b cytochrome subunit  31.11 
 
 		 392 aa  174  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3422  putative hydrogenase 2 b cytochrome subunit  30.86 
 
 		 392 aa  172  7.999999999999999e-42  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3464  putative hydrogenase 2 b cytochrome subunit  30.86 
 
 		 392 aa  172  7.999999999999999e-42  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0461  putative hydrogenase cytochrome b subunit  35.26 
 
 		 381 aa  172  1e-41  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3521  polysulphide reductase NrfD  34.33 
 
 		 405 aa  169  7e-41  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.538127  normal  0.625626 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0784  putative hydrogenase 2 b cytochrome subunit  34.64 
 
 		 442 aa  167  2.9999999999999998e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.242896  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4090  putative hydrogenase 2 b cytochrome subunit  28.43 
 
 		 388 aa  166  9e-40  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.194025  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4619  Polysulphide reductase NrfD  35.77 
 
 		 416 aa  165  1.0000000000000001e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2504  putative hydrogenase 2 b cytochrome subunit  31.62 
 
 		 382 aa  165  2.0000000000000002e-39  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.130941 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1984  putative hydrogenase 2 b cytochrome subunit  29.37 
 
 		 414 aa  152  8e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00764136  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3524  polysulphide reductase NrfD  31.84 
 
 		 401 aa  150  3e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.902311  normal  0.369035 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3042  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  31.55 
 
 		 744 aa  149  7e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1412  putative hydrogenase 2 b cytochrome subunit  31.51 
 
 		 399 aa  149  7e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2532  putative hydrogenase 2 b cytochrome subunit  33.15 
 
 		 399 aa  149  1.0000000000000001e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.346938  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2236  putative hydrogenase 2 b cytochrome subunit  28.21 
 
 		 414 aa  148  2.0000000000000003e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.263965 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0524  putative hydrogenase 2 b cytochrome subunit  27.94 
 
 		 416 aa  140  3e-32  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.920848  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0507  putative hydrogenase 2 b cytochrome subunit  26.4 
 
 		 415 aa  139  1e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0479  putative hydrogenase 2 b cytochrome subunit  26.4 
 
 		 415 aa  138  2e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.304039  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0512  putative hydrogenase 2 b cytochrome subunit  26.14 
 
 		 415 aa  137  3.0000000000000003e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1578  putative hydrogenase cytochrome b subunit  30.47 
 
 		 394 aa  137  4e-31  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.534156  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1044  putative hydrogenase cytochrome b subunit  30.2 
 
 		 401 aa  133  3.9999999999999996e-30  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1790  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  30.79 
 
 		 731 aa  133  6e-30  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2087  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  30.79 
 
 		 731 aa  132  9e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0455  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  30.9 
 
 		 729 aa  131  2.0000000000000002e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.453465 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4239  nickel-dependent hydrogenase, membrane protein  28.68 
 
 		 443 aa  130  3e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.442151  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1869  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  30.95 
 
 		 731 aa  130  5.0000000000000004e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.856186  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0160  polysulphide reductase, NrfD  30.68 
 
 		 402 aa  127  5e-28  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2935  molybdopterin oxidoreductase, transmembrane subunit, putative  26.24 
 
 		 418 aa  85.9  0.000000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.52066  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0273  molybdopterin oxidoreductase, transmembrane subunit, putative  26.98 
 
 		 409 aa  85.9  0.000000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2549  polysulphide reductase NrfD  25.06 
 
 		 410 aa  78.6  0.0000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3393  Polysulphide reductase NrfD  26.85 
 
 		 411 aa  77.8  0.0000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2271  molybdopterin oxidoreductase, transmembrane subunit, putative  26.7 
 
 		 419 aa  73.6  0.000000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2687  Polysulphide reductase NrfD  25.68 
 
 		 417 aa  72.8  0.00000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.046719 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02130  polysulphide reductase  24.34 
 
 		 389 aa  68.6  0.0000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3346  Polysulphide reductase NrfD  24 
 
 		 402 aa  61.6  0.00000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000267  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0608  molybdopterin oxidoreductase, transmembrane subunit, putative  24.27 
 
 		 417 aa  60.5  0.00000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0543645  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0214  polysulphide reductase, NrfD  24.88 
 
 		 397 aa  60.1  0.00000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3085  polysulphide reductase NrfD  23.62 
 
 		 405 aa  53.9  0.000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.488046  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27690  polysulphide reductase  22.08 
 
 		 384 aa  49.7  0.00009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1631  Polysulphide reductase NrfD  26.52 
 
 		 393 aa  48.1  0.0003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1196  Polysulphide reductase NrfD  24.49 
 
 		 348 aa  45.8  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4225  Polysulphide reductase NrfD  26.83 
 
 		 389 aa  45.1  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000782128  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0260  Polysulphide reductase NrfD  39.08 
 
 		 383 aa  44.3  0.004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0454  polysulphide reductase NrfD  24.11 
 
 		 389 aa  43.5  0.007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3666  Polysulphide reductase NrfD  21.57 
 
 		 380 aa  43.1  0.009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.396142  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>