88 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Anae109_0524 on replicon NC_009675
Organism: Anaeromyxobacter sp. Fw109-5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009675  Anae109_0524  putative hydrogenase 2 b cytochrome subunit  100 
 
 
416 aa  820    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.920848  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0507  putative hydrogenase 2 b cytochrome subunit  71.15 
 
 
415 aa  583  1.0000000000000001e-165  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0512  putative hydrogenase 2 b cytochrome subunit  71.63 
 
 
415 aa  584  1.0000000000000001e-165  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0479  putative hydrogenase 2 b cytochrome subunit  70.67 
 
 
415 aa  580  1e-164  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.304039  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3524  polysulphide reductase NrfD  49.04 
 
 
401 aa  342  7e-93  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.902311  normal  0.369035 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3521  polysulphide reductase NrfD  42.2 
 
 
405 aa  296  4e-79  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.538127  normal  0.625626 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0146  putative hydrogenase 2 b cytochrome subunit  35.89 
 
 
421 aa  251  1e-65  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3972  putative hydrogenase 2 b cytochrome subunit  36.5 
 
 
386 aa  249  8e-65  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.158247  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3137  putative hydrogenase 2 b cytochrome subunit  34.62 
 
 
446 aa  244  1.9999999999999999e-63  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4090  putative hydrogenase 2 b cytochrome subunit  36.32 
 
 
388 aa  244  1.9999999999999999e-63  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.194025  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1125  putative hydrogenase 2 b cytochrome subunit  34.52 
 
 
435 aa  242  1e-62  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1945  putative hydrogenase 2 b cytochrome subunit  34.77 
 
 
438 aa  233  3e-60  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3395  putative hydrogenase 2 b cytochrome subunit  32.44 
 
 
392 aa  223  6e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.522703 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3330  putative hydrogenase 2 b cytochrome subunit  32.44 
 
 
392 aa  223  6e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.353265  normal  0.837141 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3401  putative hydrogenase 2 b cytochrome subunit  32.44 
 
 
392 aa  223  6e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3321  putative hydrogenase 2 b cytochrome subunit  32.44 
 
 
392 aa  223  6e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.437559  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3496  putative hydrogenase 2 b cytochrome subunit  32.44 
 
 
392 aa  223  6e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.426978  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3422  putative hydrogenase 2 b cytochrome subunit  32.2 
 
 
392 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3281  putative hydrogenase 2 b cytochrome subunit  32.52 
 
 
392 aa  221  1.9999999999999999e-56  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0698  putative hydrogenase 2 b cytochrome subunit  32.52 
 
 
392 aa  221  1.9999999999999999e-56  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3464  putative hydrogenase 2 b cytochrome subunit  32.2 
 
 
392 aa  221  1.9999999999999999e-56  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3175  putative hydrogenase 2 b cytochrome subunit  32.52 
 
 
392 aa  221  1.9999999999999999e-56  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4307  putative hydrogenase 2 b cytochrome subunit  32.52 
 
 
392 aa  221  1.9999999999999999e-56  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02820  hypothetical protein  32.52 
 
 
392 aa  221  1.9999999999999999e-56  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0701  Polysulphide reductase NrfD  32.52 
 
 
392 aa  221  1.9999999999999999e-56  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02871  predicted hydrogenase 2 cytochrome b type component  32.52 
 
 
392 aa  221  1.9999999999999999e-56  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0784  putative hydrogenase 2 b cytochrome subunit  32.94 
 
 
442 aa  217  2.9999999999999998e-55  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.242896  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2504  putative hydrogenase 2 b cytochrome subunit  35.04 
 
 
382 aa  208  1e-52  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.130941 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1412  putative hydrogenase 2 b cytochrome subunit  34.54 
 
 
399 aa  205  2e-51  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2532  putative hydrogenase 2 b cytochrome subunit  34.78 
 
 
399 aa  203  4e-51  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.346938  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1984  putative hydrogenase 2 b cytochrome subunit  34.15 
 
 
414 aa  199  7.999999999999999e-50  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00764136  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4239  nickel-dependent hydrogenase, membrane protein  36.07 
 
 
443 aa  199  7.999999999999999e-50  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.442151  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2236  putative hydrogenase 2 b cytochrome subunit  33.94 
 
 
414 aa  193  4e-48  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.263965 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3386  polysulphide reductase, NrfD  31.85 
 
 
403 aa  160  6e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0170  Polysulphide reductase NrfD  29.49 
 
 
378 aa  160  6e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0779  formate dehydrogenase, b-type cytochrome subunit, putative  30.66 
 
 
401 aa  158  2e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2265  Polysulphide reductase NrfD  32.72 
 
 
403 aa  157  4e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1061  polysulphide reductase, NrfD  31.22 
 
 
401 aa  156  5.0000000000000005e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.079733 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0292  Polysulphide reductase NrfD  28.72 
 
 
396 aa  153  5e-36  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.468469  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1957  Polysulphide reductase NrfD  31.78 
 
 
403 aa  153  5.9999999999999996e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0875  Polysulphide reductase NrfD  29.43 
 
 
402 aa  153  7e-36  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.946275  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0186  formate dehydrogenase, membrane subunit, putative  29.97 
 
 
403 aa  152  8.999999999999999e-36  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0166  polysulphide reductase, NrfD  29.13 
 
 
403 aa  152  1e-35  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.391929  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_175  molybdopterin oxidoreductase, formate dehydrogenase membrane subunit  29.69 
 
 
403 aa  151  2e-35  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.100817  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2252  polysulphide reductase NrfD  30.29 
 
 
402 aa  147  5e-34  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.38952  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2602  polysulphide reductase, NrfD  29.43 
 
 
398 aa  144  3e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0461  putative hydrogenase cytochrome b subunit  26.93 
 
 
381 aa  139  7e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1198  Polysulphide reductase NrfD  27.27 
 
 
400 aa  137  3.0000000000000003e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1578  putative hydrogenase cytochrome b subunit  30.12 
 
 
394 aa  135  9.999999999999999e-31  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.534156  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0570  Polysulphide reductase NrfD  26.89 
 
 
389 aa  133  5e-30  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2596  Polysulphide reductase NrfD  28.81 
 
 
388 aa  132  2.0000000000000002e-29  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1116  polysulphide reductase, NrfD  28.42 
 
 
386 aa  130  3e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1801  polysulphide reductase NrfD  29.82 
 
 
408 aa  131  3e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1044  putative hydrogenase cytochrome b subunit  29.98 
 
 
401 aa  130  4.0000000000000003e-29  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0651  hmc operon protein 3  28.5 
 
 
389 aa  130  4.0000000000000003e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.958991  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2943  polysulphide reductase, NrfD  33.83 
 
 
394 aa  130  5.0000000000000004e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.486448  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4619  Polysulphide reductase NrfD  27.12 
 
 
416 aa  129  1.0000000000000001e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2040  Polysulphide reductase NrfD  27.65 
 
 
404 aa  124  2e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.918159  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2407  polysulphide reductase, NrfD  28.46 
 
 
388 aa  124  3e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.0385052 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1957  Polysulphide reductase NrfD  27.48 
 
 
403 aa  123  5e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0356047  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2006  polysulphide reductase, NrfD  27.97 
 
 
403 aa  123  7e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1872  Polysulphide reductase NrfD  27.48 
 
 
403 aa  120  6e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0160  polysulphide reductase, NrfD  31.63 
 
 
402 aa  119  9.999999999999999e-26  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0455  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  26.16 
 
 
729 aa  110  5e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.453465 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3042  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  26.49 
 
 
744 aa  105  1e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1790  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  26.62 
 
 
731 aa  101  2e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2087  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  27.1 
 
 
731 aa  100  4e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1869  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  26.84 
 
 
731 aa  97.1  5e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.856186  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2935  molybdopterin oxidoreductase, transmembrane subunit, putative  28.66 
 
 
418 aa  89.4  1e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.52066  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2687  Polysulphide reductase NrfD  28.01 
 
 
417 aa  86.3  9e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.046719 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0273  molybdopterin oxidoreductase, transmembrane subunit, putative  26.15 
 
 
409 aa  83.6  0.000000000000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2549  polysulphide reductase NrfD  26.02 
 
 
410 aa  80.9  0.00000000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2271  molybdopterin oxidoreductase, transmembrane subunit, putative  25.97 
 
 
419 aa  80.5  0.00000000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0608  molybdopterin oxidoreductase, transmembrane subunit, putative  27.15 
 
 
417 aa  79.7  0.00000000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0543645  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3393  Polysulphide reductase NrfD  26.68 
 
 
411 aa  79.3  0.0000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3654  polysulphide reductase-like protein  27.03 
 
 
465 aa  77  0.0000000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.731183  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0664  polysulphide reductase-like protein  25.25 
 
 
451 aa  75.5  0.000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0677  polysulphide reductase-like protein  25.25 
 
 
451 aa  74.3  0.000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.56556e-16 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1704  polysulphide reductase-like protein  23.46 
 
 
443 aa  73.9  0.000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.990037  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13670  polysulphide reductase  25.74 
 
 
414 aa  62.8  0.00000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1798  Polysulphide reductase NrfD  27.57 
 
 
391 aa  60.1  0.00000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02130  polysulphide reductase  22.75 
 
 
389 aa  50.8  0.00004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2414  Polysulphide reductase NrfD  22.07 
 
 
451 aa  51.2  0.00004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.0075882  normal  0.349671 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0527  Polysulphide reductase NrfD  21.18 
 
 
494 aa  50.1  0.00008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2211  molybdopterin oxidoreductase  21.74 
 
 
451 aa  46.6  0.0008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.554905  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0105  Polysulphide reductase NrfD  22.53 
 
 
624 aa  44.7  0.003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00267927 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5578  nrfD protein  28.52 
 
 
318 aa  43.9  0.006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1906  polysulphide reductase, NrfD  27.04 
 
 
413 aa  43.1  0.008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.105136  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>