218 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_3809 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_3809  NLP/P60 protein  100 
 
 		 496 aa  968    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.100771  normal  0.247532 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2988  peptidoglycan binding domain-containing protein  56.96 
 
 		 249 aa  80.5  0.00000000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.382188 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2120  Ig domain protein group 2 domain protein  38.41 
 
 		 1831 aa  76.3  0.000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.348208  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2508  peptidoglycan binding domain-containing protein  46.67 
 
 		 256 aa  75.9  0.000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0275667  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8534  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  38.1 
 
 		 438 aa  73.6  0.000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0174309  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3095  NLP/P60 protein  41.28 
 
 		 452 aa  72  0.00000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.378956 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2049  hypothetical protein  41.98 
 
 		 14609 aa  72  0.00000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2819  AAA ATPase containing von Willebrand factor type A (vWA) protein-like omain  37.12 
 
 		 1394 aa  71.6  0.00000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0967207  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5001  NLP/P60 protein  44.66 
 
 		 204 aa  70.1  0.00000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.132684  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0573  NLP/P60 protein  41.09 
 
 		 388 aa  68.6  0.0000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.774962  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1990  hypothetical protein  42.19 
 
 		 474 aa  68.6  0.0000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.842738  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07310  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  37.5 
 
 		 329 aa  67.8  0.0000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0926  Tn916, NLP/P60 family protein  36.7 
 
 		 333 aa  64.3  0.000000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007323  GBAA_pXO2_0007  nlp/p60 family protein  34.76 
 
 		 380 aa  64.7  0.000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0241644  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1364  von Willebrand factor type A  33.1 
 
 		 1188 aa  64.3  0.000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000145336  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10740  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  37.07 
 
 		 332 aa  63.9  0.000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2262  cell wall-associated hydrolase (invasion-associated proteins)  38.52 
 
 		 388 aa  63.9  0.000000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1030  NLP/P60 family secreted protein  36.84 
 
 		 340 aa  62.8  0.00000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.427961  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06710  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  38.46 
 
 		 292 aa  62  0.00000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6205  NLP/P60 protein  40.34 
 
 		 417 aa  62.4  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0502801 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3321  hypothetical protein  38.41 
 
 		 1316 aa  61.6  0.00000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.72566 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3084  Lytic transglycosylase catalytic  40.78 
 
 		 623 aa  60.8  0.00000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1103  NLP/P60 protein  31.58 
 
 		 349 aa  60.1  0.00000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.107402  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3122  S-layer-like domain-containing protein  37.5 
 
 		 692 aa  60.1  0.00000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2139  NLP/P60 protein  38.64 
 
 		 374 aa  60.1  0.00000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.606148  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3124  NLP/P60 protein  40.78 
 
 		 327 aa  60.1  0.00000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0606455  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1072  NLP/P60 protein  35.77 
 
 		 393 aa  60.1  0.0000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.191144  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3235  NLP/P60 protein  36.04 
 
 		 446 aa  59.7  0.0000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.177919  hitchhiker  0.000140663 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2144  NLP/P60 protein  41 
 
 		 374 aa  58.2  0.0000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3237  NLP/P60 protein  39.81 
 
 		 380 aa  58.2  0.0000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00058739  hitchhiker  0.000426733 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1999  LamG domain-containing protein  35.65 
 
 		 3907 aa  57.4  0.0000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2683  NLP/P60 protein  32 
 
 		 232 aa  57  0.0000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.65308e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2273  NLP/P60 protein  39.68 
 
 		 333 aa  57  0.0000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.543976  normal  0.489772 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3552  NLP/P60 protein  36.44 
 
 		 378 aa  57  0.0000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11930  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  36.36 
 
 		 176 aa  56.2  0.000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.39384 
 
 
-
 
NC_006578  pBT9727_0007  NLP/P60 family protein  32.6 
 
 		 380 aa  56.6  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6095  NLP/P60 protein  39.13 
 
 		 366 aa  56.2  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0901691 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0041  NLP/P60  38.89 
 
 		 331 aa  55.8  0.000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.430296  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0148  NLP/P60 protein  36.59 
 
 		 392 aa  55.5  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4498  NLP/P60 protein  40.43 
 
 		 398 aa  55.8  0.000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.055455  normal  0.0701003 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0586  NLP/P60 protein  33.96 
 
 		 432 aa  55.1  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3287  NLP/P60  38.26 
 
 		 372 aa  55.1  0.000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3349  NLP/P60 protein  38.26 
 
 		 372 aa  55.1  0.000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0832432  normal  0.0310886 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0142  NLP/P60 protein  40 
 
 		 370 aa  54.7  0.000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4506  NLP/P60 protein  38.39 
 
 		 501 aa  54.7  0.000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.918319  normal  0.0864721 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4084  TPR repeat-containing protein  36.36 
 
 		 462 aa  54.3  0.000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.806562  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0806  hypothetical protein  35.58 
 
 		 1107 aa  54.3  0.000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0060  NLP/P60 protein  34.96 
 
 		 337 aa  53.9  0.000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.306663  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1783  NLP/P60 protein  39.22 
 
 		 317 aa  53.9  0.000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.114987  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6528  NLP/P60 protein  36.67 
 
 		 392 aa  53.5  0.000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.203343 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4909  NLP/P60 protein  37.27 
 
 		 335 aa  53.5  0.000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0423  NLP/P60  38.61 
 
 		 459 aa  53.5  0.000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0609  NLP/P60 protein  36.21 
 
 		 495 aa  53.5  0.000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00032953 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3183  hypothetical protein  37.62 
 
 		 286 aa  53.5  0.000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2834  peptidoglycan binding domain-containing protein  34.62 
 
 		 166 aa  53.5  0.000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0426204  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1679  NLP/P60 protein  32.67 
 
 		 210 aa  52.8  0.00001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3054  NLP/P60 protein  30.47 
 
 		 381 aa  52.8  0.00001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0610428  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1402  NLP/P60 protein  31.82 
 
 		 175 aa  52.8  0.00001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2959  NLP/P60 protein  37.25 
 
 		 378 aa  53.1  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.454421  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0012  YD repeat protein  38.27 
 
 		 3027 aa  52.8  0.00001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2097  NLP/P60 protein  33.94 
 
 		 341 aa  53.1  0.00001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0055  NLP/P60 protein  35.4 
 
 		 337 aa  53.1  0.00001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.275537  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0132  hypothetical protein  36.84 
 
 		 830 aa  53.1  0.00001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  decreased coverage  0.00263601  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0190  cell wall-associated hydrolase (invasion-associated proteins)  39 
 
 		 235 aa  52.8  0.00002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2283  cell wall-associated hydrolase (invasion-associated proteins)  35.17 
 
 		 222 aa  52  0.00002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0696  PgdS peptidase. cysteine peptidase. MEROPS family C40  37.25 
 
 		 300 aa  52  0.00002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3298  NLP/P60 protein  37.39 
 
 		 372 aa  52.4  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.382335  normal  0.154902 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4127  NLP/P60 protein  36.11 
 
 		 532 aa  52  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4480  NLP/P60 protein  32.76 
 
 		 340 aa  52  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2808  NLP/P60 protein  37.39 
 
 		 348 aa  51.6  0.00003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1216  NLP/P60 protein  35.65 
 
 		 212 aa  51.6  0.00003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000177513  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0388  NLP/P60 protein  36.94 
 
 		 480 aa  51.2  0.00004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0871  NLP/P60 protein  30.11 
 
 		 175 aa  51.2  0.00004  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1215  NLP/P60 protein  35.19 
 
 		 532 aa  51.2  0.00004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.35545  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9152  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  37.11 
 
 		 321 aa  51.2  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2104  NLP/P60  30.17 
 
 		 217 aa  50.8  0.00005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.178668  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2032  hypothetical protein  34.07 
 
 		 1908 aa  50.8  0.00005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4528  NLP/P60 protein  32.28 
 
 		 370 aa  51.2  0.00005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.160091  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3279  PA14 domain protein  35.88 
 
 		 4009 aa  50.8  0.00006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0589032 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0980  NLP/P60 protein  34.02 
 
 		 230 aa  50.8  0.00006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.475517  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2169  LamG domain-containing protein  32.14 
 
 		 4357 aa  50.8  0.00006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8103  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  33.07 
 
 		 393 aa  50.4  0.00007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10024  hypothetical protein  35 
 
 		 281 aa  50.4  0.00007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0388  NLP/P60  35.25 
 
 		 170 aa  50.1  0.00008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.815605  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8562  NLP/P60 protein  40.22 
 
 		 373 aa  50.4  0.00008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0614213  hitchhiker  0.0073147 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3713  NLP/P60 protein  35.9 
 
 		 348 aa  50.1  0.00008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.761513  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5350  NLP/P60 protein  35.9 
 
 		 348 aa  50.4  0.00008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0577  NLP/P60 protein  33.33 
 
 		 242 aa  50.1  0.00009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0285  NLP/P60  37.08 
 
 		 368 aa  49.7  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1461  NLP/P60  32.08 
 
 		 366 aa  49.7  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.495869  decreased coverage  0.00837381 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3049  NLP/P60 protein  36.36 
 
 		 347 aa  49.3  0.0001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1353  NLP/P60 family protein, enterotoxin  33.33 
 
 		 549 aa  49.3  0.0001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.185421  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4077  NLP/P60 protein  32.84 
 
 		 308 aa  49.7  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.0063374  normal  0.206509 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4570  NLP/P60 protein  37.25 
 
 		 363 aa  50.1  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1211  NLP/P60 protein  32.29 
 
 		 338 aa  50.1  0.0001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000171376  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5004  NLP/P60 protein  33.02 
 
 		 347 aa  50.1  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.549544  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5736  NLP/P60 protein  33.71 
 
 		 326 aa  49.3  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3145  NLP/P60 protein  36.11 
 
 		 349 aa  50.1  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.120353  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2964  NLP/P60 protein  38.27 
 
 		 208 aa  49.3  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4866  NLP/P60 protein  36.54 
 
 		 350 aa  49.3  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>