More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_1568 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_1568  heat shock protein Hsp20  100 
 
 
251 aa  483  1e-135  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.458268 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1920  heat shock protein Hsp20  68.59 
 
 
162 aa  215  5.9999999999999996e-55  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.143113  normal  0.422548 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2174  heat shock protein Hsp20  64.33 
 
 
169 aa  202  5e-51  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.150669  normal  0.4191 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3386  heat shock protein Hsp20  45.86 
 
 
147 aa  127  2.0000000000000002e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1474  heat shock protein Hsp20  43.95 
 
 
151 aa  124  2e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.242626  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1214  molecular chaperone (small heat shock protein)  40.74 
 
 
260 aa  119  3e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.318766  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1528  heat shock protein Hsp20  34.81 
 
 
153 aa  91.7  1e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00309172  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0052  heat shock protein Hsp20  35.86 
 
 
151 aa  91.3  1e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.319643  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3765  heat shock protein Hsp20  36.3 
 
 
143 aa  90.1  3e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4342  heat shock protein Hsp20  33.79 
 
 
147 aa  84  0.000000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.232434  normal  0.204531 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0623  heat shock protein Hsp20  34.48 
 
 
152 aa  82.8  0.000000000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.844177  normal  0.400233 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0735  heat shock protein Hsp20  34.72 
 
 
145 aa  82.8  0.000000000000005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000037192  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0197  heat shock protein Hsp20  33.8 
 
 
147 aa  82  0.000000000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0542117 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4198  heat shock protein Hsp20  34.27 
 
 
152 aa  82  0.000000000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2790  heat shock protein Hsp20  33.56 
 
 
149 aa  79.7  0.00000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000163808  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0143  heat shock protein Hsp20  29.86 
 
 
156 aa  77  0.0000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0936  heat shock protein Hsp20  33.56 
 
 
155 aa  74.7  0.000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.172536  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0505  heat shock protein Hsp20  31.48 
 
 
158 aa  75.1  0.000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0037  heat shock protein Hsp20  33.81 
 
 
142 aa  74.7  0.000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2320  heat shock protein Hsp20  37.24 
 
 
149 aa  73.9  0.000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2022  heat shock protein Hsp20  30.5 
 
 
141 aa  73.6  0.000000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2049  heat shock protein Hsp20  36.76 
 
 
164 aa  72.8  0.000000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.0000140473  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1076  heat shock protein Hsp20  37.16 
 
 
148 aa  73.2  0.000000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.713568  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0539  heat shock protein Hsp20  33.12 
 
 
161 aa  73.2  0.000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4819  heat shock protein Hsp20  31.54 
 
 
146 aa  72.4  0.000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.414421 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2683  heat shock protein Hsp20  30.82 
 
 
145 aa  72  0.000000000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.338339  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3739  heat shock protein Hsp20  38.52 
 
 
182 aa  71.2  0.00000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0809036 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0369  HSP20 family protein  37.27 
 
 
153 aa  70.5  0.00000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  4.93231e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4023  heat shock protein Hsp20  30.56 
 
 
147 aa  70.5  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4061  heat shock protein Hsp20  30.56 
 
 
147 aa  70.5  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2122  heat shock protein Hsp20  29.86 
 
 
180 aa  70.1  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.451471 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3076  heat shock protein Hsp20  28.57 
 
 
148 aa  70.5  0.00000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2643  heat shock protein Hsp20  30 
 
 
151 aa  69.7  0.00000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.840862  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2642  heat shock protein Hsp20  38.18 
 
 
134 aa  69.3  0.00000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0989  heat shock protein Hsp20  31.08 
 
 
148 aa  69.3  0.00000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.543303  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1929  heat shock protein Hsp20  36.27 
 
 
149 aa  68.6  0.00000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.638493  normal  0.0128011 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2522  heat shock protein Hsp20  34.29 
 
 
150 aa  68.6  0.00000000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4766  heat shock protein Hsp20  32.45 
 
 
163 aa  68.6  0.00000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.0000408851  hitchhiker  0.00874264 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3788  heat shock protein Hsp20  30.56 
 
 
144 aa  67.8  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.964317 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1921  heat shock protein Hsp20  39.29 
 
 
167 aa  67  0.0000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.985705  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0102  heat shock protein Hsp20  30.37 
 
 
142 aa  67.4  0.0000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3234  HSP20 family protein  39.13 
 
 
231 aa  67  0.0000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2460  heat shock protein Hsp20  28.66 
 
 
186 aa  67  0.0000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0031555  normal  0.623789 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1171  heat shock protein Hsp20  32.35 
 
 
189 aa  66.6  0.0000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.726376  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0306  heat shock protein Hsp20  42.2 
 
 
138 aa  67  0.0000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0420324 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0557  heat shock protein Hsp20  33.8 
 
 
147 aa  67  0.0000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0117197  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0543  heat shock protein Hsp20  33.8 
 
 
147 aa  66.6  0.0000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0340696  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0406  heat shock protein Hsp20  32.12 
 
 
137 aa  66.2  0.0000000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0194442  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6439  heat shock protein Hsp20  33.02 
 
 
153 aa  66.6  0.0000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.024706  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0188  heat shock protein Hsp20  35.66 
 
 
150 aa  66.2  0.0000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3773  heat shock protein Hsp20  28.28 
 
 
148 aa  66.2  0.0000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0793  heat shock protein Hsp20  30.77 
 
 
136 aa  66.2  0.0000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.515708  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0629  heat shock protein Hsp20  32.35 
 
 
189 aa  65.9  0.0000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.185609 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1010  heat shock protein Hsp20  38.94 
 
 
153 aa  65.5  0.0000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00224234  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3394  heat shock protein Hsp20  30.63 
 
 
189 aa  65.5  0.0000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0219016  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1732  HSP20 family protein  42.34 
 
 
167 aa  65.1  0.0000000009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.371108  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0538  HSP20 family protein  27.7 
 
 
147 aa  64.7  0.000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2086  heat shock protein, Hsp20 family  28.97 
 
 
145 aa  65.1  0.000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3076  heat shock protein Hsp20  26.28 
 
 
173 aa  65.1  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1762  heat shock protein Hsp20  33.64 
 
 
144 aa  65.1  0.000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1983  heat shock protein Hsp20  29.86 
 
 
153 aa  64.7  0.000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00684856  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0540  heat shock protein Hsp20  27.7 
 
 
147 aa  65.1  0.000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1743  heat shock protein Hsp20  28.97 
 
 
145 aa  65.1  0.000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.49982  normal  0.0110244 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0383  heat shock protein Hsp20  28.39 
 
 
158 aa  65.1  0.000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2366  heat shock protein Hsp20  29.37 
 
 
151 aa  64.7  0.000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.550987  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2678  HSP20 family protein  33.85 
 
 
151 aa  63.9  0.000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2287  heat shock protein Hsp20  31.37 
 
 
189 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2657  heat shock protein Hsp20  35.07 
 
 
155 aa  64.3  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.498697  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1824  heat shock protein Hsp20  30.89 
 
 
146 aa  63.9  0.000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0843989  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3665  heat shock protein Hsp20  28.28 
 
 
148 aa  64.3  0.000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0142367  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3412  small HspC2 heat shock protein  31.37 
 
 
189 aa  63.9  0.000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.260583  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2578  putative heat shock protein  35.04 
 
 
185 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011771  BCAH820_C0008  Hsp  27.78 
 
 
146 aa  64.3  0.000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1029  Hsp20/alpha crystallin family protein  29.69 
 
 
146 aa  63.5  0.000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00339514  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0460  heat shock protein Hsp20  32.72 
 
 
155 aa  63.5  0.000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2635  heat shock protein Hsp20  30.67 
 
 
195 aa  63.5  0.000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000662159  normal  0.965311 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1344  HSP20 family protein  35.19 
 
 
121 aa  63.9  0.000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.624294  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0593  heat shock protein Hsp20  35.11 
 
 
191 aa  63.2  0.000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.95349  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1543  heat shock protein Hsp20  34.07 
 
 
146 aa  63.5  0.000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000494204  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1296  heat shock protein Hsp20  35.19 
 
 
143 aa  63.2  0.000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0391  heat shock protein Hsp20  25.17 
 
 
143 aa  63.2  0.000000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000478859  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2477  heat shock protein Hsp20  34.29 
 
 
143 aa  63.2  0.000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0833  heat shock protein Hsp20  32.03 
 
 
169 aa  63.2  0.000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6104  heat shock protein Hsp20  36.43 
 
 
158 aa  63.2  0.000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0249434 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1743  heat shock protein Hsp20  32.71 
 
 
132 aa  63.2  0.000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.174126  hitchhiker  0.00103153 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1127  heat shock protein Hsp20  38.1 
 
 
142 aa  62.8  0.000000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3312  heat shock protein, putative  34.23 
 
 
129 aa  62.8  0.000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.267805  normal  0.275059 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2505  heat shock protein Hsp20  33.33 
 
 
138 aa  62.8  0.000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.239492  normal  0.0462479 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0580  heat shock protein Hsp20  35.4 
 
 
145 aa  62.8  0.000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000199173  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1159  heat shock protein Hsp20  28.38 
 
 
148 aa  62.4  0.000000006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000413054  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0788  heat shock protein Hsp20  31.97 
 
 
143 aa  62.4  0.000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.351008  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0289  heat shock protein Hsp20  31.37 
 
 
148 aa  62.4  0.000000006  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0247001  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4812  heat shock protein Hsp20  29.87 
 
 
155 aa  62.4  0.000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00238667  normal  0.807841 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3903  heat shock protein Hsp20  34.26 
 
 
194 aa  62.4  0.000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.534424 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4119  heat shock protein Hsp20  34 
 
 
149 aa  62.4  0.000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00303961 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3461  heat shock protein Hsp20  36.36 
 
 
122 aa  62.4  0.000000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.798121  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2957  HSP20 family protein  31.82 
 
 
143 aa  62  0.000000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2365  heat shock protein Hsp20  30.48 
 
 
135 aa  62  0.000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.181504  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0838  heat shock protein Hsp20  26.55 
 
 
162 aa  62  0.00000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3498  heat shock protein Hsp20  38.74 
 
 
158 aa  62  0.00000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.938667  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>