More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_0107 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_0107  ABC transporter related  100 
 
 		 326 aa  637    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.208875  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2602  ABC transporter related  72.28 
 
 		 341 aa  421  1e-117  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.43511  normal  0.142388 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0533  ABC transporter related  75.5 
 
 		 317 aa  423  1e-117  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000671777  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30210  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  65.83 
 
 		 326 aa  402  1e-111  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.816797  normal  0.132168 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6164  ABC transporter related  65.53 
 
 		 406 aa  365  1e-100  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0995946  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2711  ABC transporter related protein  66.89 
 
 		 305 aa  357  9.999999999999999e-98  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.358434  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1274  ABC transporter related protein  64.53 
 
 		 298 aa  356  2.9999999999999997e-97  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0835  ABC transporter related protein  62.33 
 
 		 307 aa  343  2e-93  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.240086  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0904  ABC transporter-like protein  59.66 
 
 		 293 aa  338  5e-92  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.212918  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1115  ABC transporter-like protein  59.52 
 
 		 292 aa  335  5.999999999999999e-91  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.894559  normal  0.173515 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1781  ABC transporter related  60.9 
 
 		 297 aa  329  3e-89  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00286846 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0581  ABC transporter related protein  56.66 
 
 		 290 aa  325  5e-88  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1795  ABC transporter related  59.86 
 
 		 294 aa  324  1e-87  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.881236  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1945  ABC transporter related  57.53 
 
 		 303 aa  323  3e-87  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0153054  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0732  ABC transporter related protein  58 
 
 		 318 aa  305  9.000000000000001e-82  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.515959  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0858  ABC transporter related protein  56.15 
 
 		 303 aa  286  2.9999999999999996e-76  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00621522  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4174  ABC transporter related  54.48 
 
 		 295 aa  286  4e-76  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2742  ABC transporter related  52.56 
 
 		 292 aa  286  4e-76  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.145736  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26830  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  52.08 
 
 		 291 aa  283  2.0000000000000002e-75  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.381076  normal  0.317185 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3029  ABC transporter related  53.38 
 
 		 305 aa  271  1e-71  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000334829 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1385  ABC transporter related  48.44 
 
 		 293 aa  266  5e-70  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.208813  normal  0.990681 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0634  ABC transporter related  42.09 
 
 		 299 aa  243  3e-63  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000003558  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1450  ABC transporter related protein  42.52 
 
 		 299 aa  233  4.0000000000000004e-60  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4023  ABC transporter ATP-binding protein  36.73 
 
 		 299 aa  231  1e-59  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000993933 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2366  ABC transporter related  37.16 
 
 		 299 aa  226  5.0000000000000005e-58  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2411  ABC transporter related  37.16 
 
 		 299 aa  226  5.0000000000000005e-58  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0293991  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1946  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  37.41 
 
 		 309 aa  222  4.9999999999999996e-57  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.036978  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4512  ABC transporter, ATPase subunit  39.07 
 
 		 305 aa  214  9.999999999999999e-55  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.16714  normal  0.549745 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0703  ABC transporter, ATP-binding protein  37.88 
 
 		 296 aa  214  1.9999999999999998e-54  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.282688  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7297  ABC transporter related  34.11 
 
 		 321 aa  213  2.9999999999999995e-54  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0698  ATP-binding transport protein nata  37.46 
 
 		 296 aa  212  7e-54  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.702927  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5258  ABC transporter, ATP-binding protein  36.39 
 
 		 294 aa  209  4e-53  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1534  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  32.89 
 
 		 309 aa  208  8e-53  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1177  ABC transporter related  39.57 
 
 		 298 aa  207  2e-52  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0179844  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1047  ABC transporter, ATP-binding protein  35.81 
 
 		 308 aa  206  6e-52  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2403  ABC transporter related protein  37.3 
 
 		 309 aa  204  2e-51  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.983822  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4245  ABC transporter ATP-binding protein  35.52 
 
 		 303 aa  199  6e-50  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.198772  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4638  ABC transporter, ATP-binding protein  35.64 
 
 		 294 aa  199  6e-50  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.672601  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0617  ABC transporter, ATP-binding protein  35.86 
 
 		 294 aa  198  9e-50  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3210  ABC transporter-related protein  34.68 
 
 		 294 aa  198  1.0000000000000001e-49  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4618  sodium export ATP-binding protein  35.86 
 
 		 294 aa  198  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4622  ABC transporter, ATP-binding protein  35.03 
 
 		 294 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4257  ABC transporter ATP-binding protein  35.03 
 
 		 303 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0129746  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4636  ABC transporter, ATP-binding protein  35.03 
 
 		 294 aa  197  3e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1451  ABC transporter related protein  38.57 
 
 		 266 aa  197  3e-49  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0850349  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4338  ABC transporter related  36.03 
 
 		 303 aa  196  5.000000000000001e-49  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1057  ABC transporter related  33.11 
 
 		 312 aa  195  9e-49  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000853274  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0946  ABC transporter, ATP-binding protein  36.42 
 
 		 319 aa  195  1e-48  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.15139 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4405  ABC transporter ATP-binding protein  34.69 
 
 		 303 aa  194  2e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4745  ABC transporter ATP-binding protein  34.69 
 
 		 294 aa  194  2e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2557  ABC transporter related  39.16 
 
 		 315 aa  192  6e-48  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.471575  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2672  ABC transporter related  37 
 
 		 300 aa  191  1e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.425869  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0361  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  32.78 
 
 		 297 aa  189  4e-47  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3473  ABC transporter related  37.46 
 
 		 315 aa  189  4e-47  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1739  ABC transporter related protein  35.25 
 
 		 305 aa  189  8e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.783462 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0227  ABC transporter related  31.65 
 
 		 296 aa  187  2e-46  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08261  ABC transporter, ATP-binding protein  30.13 
 
 		 309 aa  185  1.0000000000000001e-45  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.915315  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1546  ABC transporter related protein  38.92 
 
 		 341 aa  184  1.0000000000000001e-45  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4965  ABC transporter related  36.52 
 
 		 304 aa  182  6e-45  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0851  sodium extrusion protein NatA, putative  33.33 
 
 		 298 aa  181  1e-44  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0484534  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0485  ABC transporter, ATP-binding protein  31.77 
 
 		 301 aa  181  1e-44  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5049  ABC transporter related  30.92 
 
 		 309 aa  181  2e-44  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0770  ABC transporter related  33.33 
 
 		 298 aa  179  4e-44  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_755  ABC transproter, ATP-binding protein  32.54 
 
 		 298 aa  179  4.999999999999999e-44  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0604586  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0892  ABC transporter related  37.42 
 
 		 332 aa  179  7e-44  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0904315  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2040  ABC transporter related  31.25 
 
 		 309 aa  176  3e-43  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2867  ABC transporter related  40.54 
 
 		 318 aa  176  3e-43  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.599491 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_3998  ABC transporter related  35.06 
 
 		 316 aa  176  4e-43  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.296947 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2132  ABC transporter-related protein  38.64 
 
 		 245 aa  175  9.999999999999999e-43  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.76673  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5207  ABC transporter permease/ATP-binding protein  37.01 
 
 		 906 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.468455  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0021  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  36.36 
 
 		 321 aa  173  3.9999999999999995e-42  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0068  ATPase  39 
 
 		 329 aa  172  5.999999999999999e-42  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1808  ABC transporter related  37.85 
 
 		 294 aa  172  7.999999999999999e-42  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000000000539962 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5115  ABC transporter related  36.97 
 
 		 906 aa  171  1e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2411  ABC transporter related  40.37 
 
 		 360 aa  171  1e-41  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.96204 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0787  ABC transporter related  36.65 
 
 		 316 aa  171  1e-41  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0039  ABC transporter related  37.68 
 
 		 310 aa  171  2e-41  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1634  nodulation ABC transporter NodI  37.4 
 
 		 304 aa  170  2e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.770331  normal  0.764361 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0215  ABC transporter-related protein  33.91 
 
 		 310 aa  171  2e-41  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.314538  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5974  putative ABC transporter ATP-binding protein/permease  41.26 
 
 		 916 aa  170  3e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0218  ABC transporter related  42.11 
 
 		 329 aa  169  4e-41  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.977972  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2709  ABC transporter related  36.45 
 
 		 298 aa  170  4e-41  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0350953 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3419  ABC transporter related  41.63 
 
 		 929 aa  170  4e-41  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29680  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  37.22 
 
 		 312 aa  169  5e-41  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.619183  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1770  ABC transporter related protein  39.47 
 
 		 308 aa  169  5e-41  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.471072  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1731  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  34.96 
 
 		 298 aa  169  5e-41  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000125196  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2980  ABC transporter related  39.83 
 
 		 306 aa  169  6e-41  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1683  ABC transporter related  34.55 
 
 		 314 aa  169  8e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1768  nodulation ABC transporter NodI  38.75 
 
 		 304 aa  169  8e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.733108  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1723  ABC transporter ATP-binding protein  39.32 
 
 		 308 aa  168  1e-40  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5268  ABC transporter related  36.04 
 
 		 906 aa  168  1e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.155488  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0458  ABC transporter-like protein  40.83 
 
 		 309 aa  167  2e-40  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1431  ABC transporter related  38.02 
 
 		 316 aa  167  2e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2419  ABC transporter related  41.67 
 
 		 328 aa  167  2e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.513097 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4073  ABC transporter related protein  39.57 
 
 		 309 aa  167  2e-40  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  decreased coverage  0.00347724  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4686  ABC transporter related  41.82 
 
 		 912 aa  167  2e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.248247 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0298  ABC transporter related protein  41.42 
 
 		 367 aa  167  2.9999999999999998e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.717985  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1780  ABC transporter related  34.01 
 
 		 293 aa  167  2.9999999999999998e-40  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.09165  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1427  ABC transporter related  41.45 
 
 		 332 aa  166  4e-40  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1722  ABC transporter related  34.01 
 
 		 293 aa  166  5e-40  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>