158 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_1601 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_1601  fibronectin, type III  100 
 
 		 548 aa  1128    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.751366 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0432  cellulose-binding family II  30.07 
 
 		 562 aa  187  6e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.302151 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2402  glycosy hydrolase family protein  29.94 
 
 		 504 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.924859  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03689  hydrolase transmembrane protein  29.84 
 
 		 401 aa  129  2.0000000000000002e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0493131  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_2006  cellulose-binding family II  30.87 
 
 		 1194 aa  127  4.0000000000000003e-28  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0781083  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2921  PKD domain containing protein  28.72 
 
 		 623 aa  127  8.000000000000001e-28  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1643  lysozyme  28.16 
 
 		 451 aa  126  1e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.197818 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1588  lysozyme  28.16 
 
 		 451 aa  124  4e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.421382  normal  0.415988 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1569  chitinase  28.16 
 
 		 451 aa  123  9e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.873549  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1962  glycosy hydrolase family protein  29.62 
 
 		 449 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.639701  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1165  glycosy hydrolase family protein  29.62 
 
 		 453 aa  122  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00309995  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2109  glycosy hydrolase family protein  29.62 
 
 		 453 aa  122  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1606  glycosy hydrolase family protein  29.62 
 
 		 453 aa  122  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.508169  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0268  glycosy hydrolase family protein  29.62 
 
 		 453 aa  122  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.224241  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1946  glycosy hydrolase family protein  29.62 
 
 		 453 aa  122  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0892  glycosy hydrolase family protein  29.62 
 
 		 453 aa  122  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0799389  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1190  chitinase  28.16 
 
 		 451 aa  121  3.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0835249  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1670  chitinase  28.16 
 
 		 451 aa  121  3.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0521998  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4818  glycosyl hydrolase family chitinase  27.22 
 
 		 451 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.642032 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3209  Chitinase  29.47 
 
 		 537 aa  116  8.999999999999998e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.220634  hitchhiker  0.00289702 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3505  chitinase, cellulase  29.12 
 
 		 2305 aa  113  8.000000000000001e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0820772 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2141  chitinase  30.2 
 
 		 665 aa  112  2.0000000000000002e-23  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.274855  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0302  Lysozyme  27.53 
 
 		 507 aa  112  2.0000000000000002e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0375  Lysozyme  27.21 
 
 		 897 aa  111  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.300851  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03189  periplasmic endochitinase  27.56 
 
 		 686 aa  110  5e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.407335  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03140  hypothetical protein  27.56 
 
 		 686 aa  110  5e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.268345  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3533  bifunctional chitinase/lysozyme  27.21 
 
 		 897 aa  110  6e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0541888  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0375  lysozyme  27.21 
 
 		 897 aa  110  6e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0820031  normal  0.933049 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0038  chitinase domain-containing protein  29.17 
 
 		 593 aa  109  1e-22  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6988  lysozyme  30.57 
 
 		 539 aa  108  2e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.14763  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3001  chitinase  28.32 
 
 		 2310 aa  105  2e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.426725  normal  0.0460481 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1229  glycosyl hydrolase family chitinase  27.81 
 
 		 393 aa  103  9e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.413268  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1021  carbohydrate-binding CenC domain-containing protein  30.74 
 
 		 490 aa  103  1e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.278615  normal  0.298749 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5623  Lysozyme  28.89 
 
 		 426 aa  103  1e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.700904  normal  0.234327 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1493  Lysozyme  27.36 
 
 		 481 aa  97.4  5e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.72016  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3556  Chitinase  27.54 
 
 		 358 aa  95.5  2e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0387  sugar hydrolase  30.09 
 
 		 315 aa  95.9  2e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0250299  normal  0.468483 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0879  fibronectin type III domain-containing protein  27.53 
 
 		 751 aa  95.1  3e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1022  Fibronectin type III domain-containing protein  25.24 
 
 		 492 aa  94  7e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.871792  normal  0.307006 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6238  cellulose-binding family II  23.75 
 
 		 552 aa  94  7e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2637  Ricin B lectin  31.76 
 
 		 465 aa  92  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.352697  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1328  Ricin B lectin  27.99 
 
 		 452 aa  91.3  4e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.47915  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2708  cellulose-binding family II  23.67 
 
 		 514 aa  90.1  1e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.494794 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5624  Chitinase  24.92 
 
 		 421 aa  89  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.213544 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4397  hydrolase transmembrane protein  27.24 
 
 		 324 aa  87.8  4e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.591103  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2490  Carbohydrate-binding CenC domain protein  27.02 
 
 		 526 aa  87.4  6e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0887  Chitinase  26.56 
 
 		 540 aa  85.9  0.000000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.413274  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2142  hypothetical protein  25.09 
 
 		 324 aa  84.3  0.000000000000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2169  hypothetical protein  24 
 
 		 324 aa  82  0.00000000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1918  hypothetical protein  24.03 
 
 		 561 aa  81.3  0.00000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0020  Chitinase  27.95 
 
 		 543 aa  80.1  0.0000000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  decreased coverage  0.00474187  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2212  chitin-binding domain-containing protein  36.13 
 
 		 459 aa  72  0.00000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000239148  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7591  Chitinase-like protein  44.33 
 
 		 854 aa  68.2  0.0000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0192661  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2033  glycosyl hydrolase family chitinase  26.6 
 
 		 591 aa  67.8  0.0000000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.635984  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6755  hypothetical protein  26.55 
 
 		 358 aa  67.4  0.0000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.319282 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4160  glycoside hydrolase family 18  41.9 
 
 		 762 aa  67.4  0.0000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.299546 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2512  cellulose-binding family II protein  32.87 
 
 		 637 aa  65.5  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1445  Chitinase  25.42 
 
 		 597 aa  65.5  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.586711  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2800  putative chitinase  28.83 
 
 		 455 aa  64.7  0.000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000304413 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3465  coagulation factor 5/8 type domain protein  37.32 
 
 		 729 aa  64.7  0.000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.552807  hitchhiker  0.00639075 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2556  chitin-binding protein  28.83 
 
 		 455 aa  64.3  0.000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.840991  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2924  PKD domain containing protein  27.01 
 
 		 521 aa  63.9  0.000000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0135075  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2834  glycosyl hydrolase-like  37.76 
 
 		 1238 aa  63.9  0.000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00529602  normal  0.0523238 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4723  endonuclease I  37.17 
 
 		 614 aa  63.5  0.000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03565  thermolysin  37.25 
 
 		 1154 aa  63.5  0.00000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2803  putative chitinase  33.33 
 
 		 455 aa  62.4  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0036  chitin-binding domain protein  36.29 
 
 		 456 aa  62  0.00000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0067572  normal  0.0435633 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2747  cellulose-binding domain-containing protein  26.02 
 
 		 671 aa  61.2  0.00000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1240  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  39.62 
 
 		 809 aa  61.2  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00167459 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4881  glycoside hydrolase family 6  38.71 
 
 		 743 aa  61.6  0.00000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.106483  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2523  chitin-binding protein  33.33 
 
 		 455 aa  60.5  0.00000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2845  putative chitinase  33.33 
 
 		 455 aa  60.1  0.00000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00670529  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2604  chitin binding protein  28.22 
 
 		 455 aa  59.7  0.0000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.314994  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2793  chitin binding protein  28.22 
 
 		 455 aa  59.7  0.0000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2598  chitin-binding domain-containing protein  35.4 
 
 		 455 aa  59.7  0.0000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0071458  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2487  putative chitinase  32.5 
 
 		 455 aa  59.7  0.0000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.676693 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0617  glycoside hydrolase family protein  42.22 
 
 		 1121 aa  58.9  0.0000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0413787  hitchhiker  0.00805779 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2466  fibronectin type III domain-containing protein  36.46 
 
 		 1887 aa  59.3  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.401987  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1627  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  38.1 
 
 		 998 aa  58.9  0.0000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.234171  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0497  chitinase B  33.33 
 
 		 674 aa  58.2  0.0000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2824  chitin binding protein, putative  31.48 
 
 		 455 aa  58.2  0.0000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00573769  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0276  chitin-binding protein  33.94 
 
 		 456 aa  58.2  0.0000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.281673  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3336  Glycosidase-like protein  39.81 
 
 		 997 aa  58.2  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.310456  normal  0.29304 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0883  PKD domain containing protein  24.07 
 
 		 461 aa  57.8  0.0000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  decreased coverage  0.00168906  normal  0.17524 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2792  cellulose-binding family II  38.54 
 
 		 681 aa  57.8  0.0000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3604  glycoside hydrolase family 48  43.02 
 
 		 973 aa  57.8  0.0000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5472  fibronectin type III domain-containing protein  33.87 
 
 		 787 aa  57.4  0.0000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000573168  decreased coverage  0.000436266 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2684  glycoside hydrolase family protein  36.45 
 
 		 658 aa  56.2  0.000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.954713  normal  0.0577257 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0360  glycoside hydrolase family 18  35.9 
 
 		 652 aa  56.6  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0498  chitinase B  32.35 
 
 		 674 aa  56.2  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1235  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  36.17 
 
 		 6885 aa  55.8  0.000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0366  glycoside hydrolase family protein  33.33 
 
 		 674 aa  56.2  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4874  chitinase B  35.85 
 
 		 674 aa  55.5  0.000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0934  putative secreted beta-mannosidase  34.34 
 
 		 523 aa  54.7  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0660492  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2169  chitin-binding domain-containing protein  29.63 
 
 		 455 aa  54.7  0.000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.102093  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1712  chitin-binding domain protein  34.55 
 
 		 458 aa  54.7  0.000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000111699 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3717  Carbohydrate-binding family V/XII  23.4 
 
 		 436 aa  54.7  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.609198  normal  0.0379459 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4408  hypothetical protein  21.49 
 
 		 338 aa  54.3  0.000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5622  fibronectin type III domain-containing protein  30.97 
 
 		 660 aa  54.3  0.000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0542  glycoside hydrolase family 18  36.73 
 
 		 703 aa  53.9  0.000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.218928  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>