77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_4284 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_4284  Outer membrane protein-like protein  100 
 
 		 480 aa  979    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2584  outer membrane efflux protein  53 
 
 		 466 aa  518  1.0000000000000001e-145  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0423133  decreased coverage  0.00978547 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1159  outer membrane efflux protein  55.43 
 
 		 465 aa  513  1e-144  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.78186 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3159  outer membrane efflux protein  31.6 
 
 		 445 aa  233  6e-60  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0462  outer membrane efflux protein  31.84 
 
 		 451 aa  227  3e-58  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2617  outer membrane efflux protein  28.06 
 
 		 479 aa  179  9e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.205144  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4012  outer membrane efflux protein  26.43 
 
 		 465 aa  132  2.0000000000000002e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0140035  decreased coverage  0.00198888 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1749  outer membrane efflux protein  24.68 
 
 		 458 aa  63.9  0.000000006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2819  outer membrane efflux protein  22.97 
 
 		 438 aa  61.6  0.00000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5061  TolC family type I secretion outer membrane protein  21.11 
 
 		 445 aa  60.8  0.00000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.447957 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0605  outer membrane efflux protein  21.04 
 
 		 470 aa  59.7  0.0000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3853  outer membrane efflux protein  20.73 
 
 		 447 aa  58.9  0.0000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3809  TolC family type I secretion outer membrane protein  22.55 
 
 		 457 aa  58.9  0.0000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0041623 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3908  type I secretion outer membrane protein, TolC family  22.41 
 
 		 473 aa  56.2  0.000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3985  TolC family type I secretion outer membrane protein  22.41 
 
 		 473 aa  56.2  0.000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3973  outer membrane efflux protein  23.35 
 
 		 513 aa  56.2  0.000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0704049 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2243  TolC family type I secretion outer membrane protein  23.38 
 
 		 455 aa  54.7  0.000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1723  outer membrane efflux protein  26.42 
 
 		 436 aa  55.1  0.000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3061  type I secretion outer membrane protein, TolC family  21.27 
 
 		 450 aa  54.7  0.000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4007  TolC family type I secretion outer membrane protein  22.76 
 
 		 472 aa  55.1  0.000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003403  agglutination protein  22.83 
 
 		 436 aa  54.7  0.000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000998881  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4004  acriflavin resistance protein  22.28 
 
 		 1470 aa  53.9  0.000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001579  agglutination protein  23.39 
 
 		 437 aa  53.9  0.000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.582339  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3937  outer membrane efflux protein  21.11 
 
 		 447 aa  53.5  0.000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00157367 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4101  TolC family type I secretion outer membrane protein  22.41 
 
 		 472 aa  53.5  0.000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0134  Type I secretion outer membrane protein, TolC  22.22 
 
 		 450 aa  53.1  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.675891  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02372  hypothetical protein  22.26 
 
 		 425 aa  53.1  0.00001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1804  TolC family type I secretion outer membrane protein  21.81 
 
 		 451 aa  52.4  0.00002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.894432  normal  0.601876 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0381  TolC family type I secretion outer membrane protein  21.38 
 
 		 471 aa  51.2  0.00004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4142  TolC family type I secretion outer membrane protein  20.71 
 
 		 472 aa  51.2  0.00004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00647616  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3645  TolC family type I secretion outer membrane protein  21.38 
 
 		 471 aa  51.2  0.00004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4320  agglutination protein  21.95 
 
 		 471 aa  51.2  0.00004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5161  type I secretion outer membrane protein, TolC family  22.73 
 
 		 488 aa  50.8  0.00005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.451764  normal  0.264948 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003406  agglutination protein  22.88 
 
 		 423 aa  50.8  0.00005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4696  TolC family type I secretion outer membrane protein  22.73 
 
 		 497 aa  50.8  0.00005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0379  TolC family type I secretion outer membrane protein  21.6 
 
 		 471 aa  50.4  0.00006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3594  TolC family type I secretion outer membrane protein  21.6 
 
 		 471 aa  50.8  0.00006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0433  type I secretion outer membrane protein, TolC family protein  19.35 
 
 		 469 aa  50.1  0.00009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.462048  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0962  outer membrane efflux protein  21.9 
 
 		 464 aa  50.1  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.000000066626  normal  0.118679 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5239  type I secretion outer membrane protein, TolC family  23.42 
 
 		 488 aa  49.7  0.0001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02379  hypothetical protein  22.14 
 
 		 436 aa  49.7  0.0001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0783  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  21.89 
 
 		 493 aa  48.9  0.0002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.436637  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2441  outer membrane efflux protein  20.99 
 
 		 453 aa  48.9  0.0002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1884  outer membrane efflux protein  23.91 
 
 		 483 aa  48.5  0.0002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0365  TolC family type I secretion outer membrane protein  18.69 
 
 		 475 aa  48.5  0.0003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1054  outer membrane efflux protein  22.62 
 
 		 514 aa  48.5  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000452487  normal  0.217723 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3409  outer membrane efflux protein  24.68 
 
 		 419 aa  48.1  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000155286  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5970  Type I secretion outer membrane protein, TolC  19.48 
 
 		 442 aa  48.1  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1214  type I secretion outer membrane protein, TolC family  20.87 
 
 		 450 aa  47.8  0.0004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.227292  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4114  outer membrane efflux protein  23.86 
 
 		 519 aa  48.1  0.0004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.865486  normal  0.0282956 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0837  outer membrane efflux protein  21.45 
 
 		 462 aa  47.8  0.0004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3343  type I secretion outer membrane protein, TolC family  24.84 
 
 		 452 aa  47.8  0.0004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4025  TolC family type I secretion outer membrane protein  21.88 
 
 		 452 aa  47.4  0.0005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0350176 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4722  outer membrane efflux protein  22.37 
 
 		 514 aa  47.8  0.0005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0674524  decreased coverage  0.00195148 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5578  outer membrane efflux protein  22.37 
 
 		 514 aa  47.8  0.0005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0232692  hitchhiker  0.00628536 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3645  outer membrane efflux protein  22.37 
 
 		 514 aa  47.4  0.0006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.784148  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0474  TolC family type I secretion outer membrane protein  19.64 
 
 		 470 aa  47.4  0.0006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0171025  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3706  RND efflux system outer membrane lipoprotein  20 
 
 		 498 aa  46.2  0.001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0175295 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4902  outer membrane efflux protein  22.74 
 
 		 439 aa  46.6  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2193  RND efflux system outer membrane lipoprotein  23.81 
 
 		 495 aa  46.2  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0126086  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2145  outer membrane efflux protein  19.28 
 
 		 472 aa  46.2  0.001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0192834 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2340  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  21.14 
 
 		 502 aa  45.4  0.002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4519  TolC family type I secretion outer membrane protein  21.41 
 
 		 452 aa  45.4  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4579  outer membrane efflux protein  23.6 
 
 		 515 aa  45.8  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0188996  decreased coverage  0.000000771093 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3093  outer membrane protein  18.27 
 
 		 503 aa  45.1  0.003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  7.56103e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0400  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  21.04 
 
 		 494 aa  45.1  0.003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6495  type I secretion outer membrane protein, TolC family  24.36 
 
 		 518 aa  44.7  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3261  type I secretion outer membrane protein, TolC  19.33 
 
 		 469 aa  45.1  0.003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.537181 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1217  outer membrane efflux protein  23.15 
 
 		 438 aa  45.1  0.003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.87899  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4966  RND efflux system outer membrane lipoprotein  20.41 
 
 		 466 aa  44.7  0.004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.953441  normal  0.0124942 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1392  TolC family type I secretion outer membrane protein  20.85 
 
 		 452 aa  44.3  0.005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4230  outer membrane efflux protein  23.45 
 
 		 458 aa  44.3  0.005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0431504  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0582  outer membrane efflux protein  21.58 
 
 		 464 aa  44.3  0.005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3932  RND efflux system outer membrane lipoprotein  24.21 
 
 		 491 aa  43.9  0.006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3720  TolC family type I secretion outer membrane protein  23.91 
 
 		 421 aa  43.9  0.006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.667765  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3274  RND efflux system outer membrane lipoprotein  22.63 
 
 		 495 aa  43.5  0.008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5878  TolC family type I secretion outer membrane protein  24.18 
 
 		 463 aa  43.1  0.01  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.539647  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>