23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_1159 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_1159  outer membrane efflux protein  100 
 
 		 465 aa  954    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.78186 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2584  outer membrane efflux protein  61.72 
 
 		 466 aa  593  1e-168  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0423133  decreased coverage  0.00978547 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4284  Outer membrane protein-like protein  54.23 
 
 		 480 aa  517  1.0000000000000001e-145  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0462  outer membrane efflux protein  33.63 
 
 		 451 aa  234  3e-60  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3159  outer membrane efflux protein  32.2 
 
 		 445 aa  231  2e-59  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2617  outer membrane efflux protein  31.86 
 
 		 479 aa  207  5e-52  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.205144  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4012  outer membrane efflux protein  29.1 
 
 		 465 aa  162  1e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0140035  decreased coverage  0.00198888 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0828  metal ion efflux outer membrane protein family protein, putative  25 
 
 		 428 aa  53.9  0.000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.885444  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4902  outer membrane efflux protein  21.93 
 
 		 439 aa  52  0.00002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1723  outer membrane efflux protein  26.2 
 
 		 436 aa  50.1  0.00009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3931  multidrug efflux system outer membrane subunit  23.59 
 
 		 507 aa  48.5  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.436202 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1135  outer membrane protein TolC, putative  24.84 
 
 		 480 aa  47.8  0.0004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.196284  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0605  outer membrane efflux protein  21.69 
 
 		 470 aa  47.8  0.0004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1840  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  24.74 
 
 		 462 aa  46.2  0.001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.37883  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3985  TolC family type I secretion outer membrane protein  20.32 
 
 		 473 aa  45.4  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3908  type I secretion outer membrane protein, TolC family  20.32 
 
 		 473 aa  45.4  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2969  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  23.32 
 
 		 465 aa  45.8  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.678758  normal  0.17281 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0563  RND efflux system, outer membrane lipoprotein CmeC  22.18 
 
 		 482 aa  45.1  0.003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0291463  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4007  TolC family type I secretion outer membrane protein  20.54 
 
 		 472 aa  43.9  0.006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003406  agglutination protein  21.82 
 
 		 423 aa  43.9  0.006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001579  agglutination protein  20.85 
 
 		 437 aa  43.9  0.006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.582339  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3093  outer membrane protein  21.25 
 
 		 503 aa  43.5  0.008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  7.56103e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0105  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  24.05 
 
 		 457 aa  43.1  0.01  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.265235  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>