71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_3159 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_3159  outer membrane efflux protein  100 
 
 		 445 aa  907    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0462  outer membrane efflux protein  57.4 
 
 		 451 aa  515  1.0000000000000001e-145  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2617  outer membrane efflux protein  39.69 
 
 		 479 aa  296  4e-79  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.205144  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4284  Outer membrane protein-like protein  31.6 
 
 		 480 aa  233  5e-60  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1159  outer membrane efflux protein  32.2 
 
 		 465 aa  231  2e-59  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.78186 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2584  outer membrane efflux protein  30.82 
 
 		 466 aa  215  9.999999999999999e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0423133  decreased coverage  0.00978547 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4012  outer membrane efflux protein  28.95 
 
 		 465 aa  174  2.9999999999999996e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0140035  decreased coverage  0.00198888 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1362  outer membrane efflux family protein  23.71 
 
 		 558 aa  68.6  0.0000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3101  outer membrane efflux protein  28.34 
 
 		 465 aa  64.7  0.000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00986507  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2969  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  28.03 
 
 		 465 aa  62  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.678758  normal  0.17281 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2657  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  27.07 
 
 		 473 aa  59.7  0.0000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0121184  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2127  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  24.21 
 
 		 513 aa  57.4  0.0000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3923  outer membrane efflux protein  20.36 
 
 		 569 aa  57  0.0000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.19723 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2193  RND efflux system outer membrane lipoprotein  23.84 
 
 		 495 aa  57  0.0000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0126086  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1695  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  23.92 
 
 		 512 aa  55.1  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2139  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  21.37 
 
 		 517 aa  54.7  0.000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.971447 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4998  RND efflux system outer membrane lipoprotein  24.54 
 
 		 515 aa  54.3  0.000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.599541  normal  0.824643 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1723  outer membrane efflux protein  23.09 
 
 		 436 aa  53.5  0.000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44210  multidrug efflux pump outer membrane lipoprotein  22.13 
 
 		 506 aa  52  0.00002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.489954  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0096  outer membrane efflux protein  22.51 
 
 		 441 aa  51.2  0.00003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1415  RND efflux system outer membrane lipoprotein NodT  27.81 
 
 		 520 aa  51.6  0.00003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4486  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  27.73 
 
 		 512 aa  51.6  0.00003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000656  putative outer membrane protein  25.55 
 
 		 500 aa  51.2  0.00004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02621  outer membrane protein required for AvrXa21 activity C (raxC)  22.46 
 
 		 443 aa  51.2  0.00004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3899  RND efflux system outer membrane lipoprotein  24.17 
 
 		 495 aa  50.8  0.00005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.624231 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3628  RND efflux system outer membrane lipoprotein  24.17 
 
 		 495 aa  50.8  0.00005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.399788  normal  0.615306 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4467  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  24.17 
 
 		 495 aa  50.8  0.00005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.419427  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5852  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  25.67 
 
 		 523 aa  49.3  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.741914 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2799  outer membrane efflux protein  24.76 
 
 		 435 aa  49.3  0.0001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.0000000194078  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27410  putative outer membrane protein precursor  22.36 
 
 		 479 aa  48.5  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.721932  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2435  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  27.57 
 
 		 500 aa  48.5  0.0002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0164231 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0749  RND efflux system outer membrane lipoprotein  22.03 
 
 		 504 aa  48.5  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2024  RND efflux system outer membrane lipoprotein  23.69 
 
 		 525 aa  48.1  0.0003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0689129  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3427  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  26.51 
 
 		 470 aa  48.1  0.0003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3679  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family protein  23.05 
 
 		 467 aa  47.8  0.0004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2559  RND efflux system outer membrane lipoprotein  24.05 
 
 		 527 aa  47.4  0.0005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1099  RND efflux system outer membrane lipoprotein  25.29 
 
 		 460 aa  47.4  0.0005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2318  outer membrane protein  22.36 
 
 		 479 aa  47.4  0.0005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.510391  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0071  outer membrane efflux protein  22.78 
 
 		 441 aa  47.4  0.0006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3274  RND efflux system outer membrane lipoprotein  23.85 
 
 		 495 aa  46.6  0.0008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2179  RND efflux system outer membrane lipoprotein  25.74 
 
 		 462 aa  47  0.0008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.159854  normal  0.0708517 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0400  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  22.69 
 
 		 494 aa  45.8  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3427  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  25 
 
 		 471 aa  45.4  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0491334  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2335  RND efflux system outer membrane lipoprotein  25 
 
 		 471 aa  45.4  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1056  RND efflux system outer membrane lipoprotein  24.05 
 
 		 498 aa  45.1  0.002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.14613  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0996  RND efflux system outer membrane lipoprotein  24.05 
 
 		 498 aa  45.1  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0569  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  26.11 
 
 		 486 aa  45.4  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.20716  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1768  NodT family efflux transporter outer membrane lipoprotein  24.05 
 
 		 493 aa  45.1  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0170  RND efflux system outer membrane lipoprotein  24.05 
 
 		 498 aa  45.1  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0737823  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0511  RND efflux system outer membrane lipoprotein NodT  24.91 
 
 		 497 aa  44.7  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.310056  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3627  outer membrane efflux protein  24.92 
 
 		 461 aa  44.7  0.003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.433273  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3710  outer membrane efflux protein  25.45 
 
 		 419 aa  44.7  0.003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1502  RND efflux system outer membrane lipoprotein  24.05 
 
 		 514 aa  44.7  0.003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.370375  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1745  NodT family efflux transporter outer membrane lipoprotein  24.05 
 
 		 498 aa  45.1  0.003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.134149  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4468  RND efflux system outer membrane lipoprotein  22.32 
 
 		 503 aa  44.7  0.003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.151382  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2509  RND efflux system outer membrane lipoprotein  25 
 
 		 471 aa  45.1  0.003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.293505  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0753  RND efflux system outer membrane lipoprotein  21.47 
 
 		 504 aa  44.7  0.003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.13209  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1921  RND efflux system outer membrane lipoprotein  24.05 
 
 		 514 aa  44.3  0.004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.330678  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3093  outer membrane protein  24.37 
 
 		 503 aa  44.7  0.004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  7.56103e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3184  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  24.18 
 
 		 475 aa  44.3  0.004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0715  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  21.74 
 
 		 504 aa  44.3  0.004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.871689  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2633  outer membrane efflux protein  23.16 
 
 		 424 aa  44.3  0.004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3793  RND efflux system outer membrane lipoprotein  23.08 
 
 		 495 aa  44.3  0.004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.351966 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1001  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  27.27 
 
 		 492 aa  44.3  0.005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4966  RND efflux system outer membrane lipoprotein  21.24 
 
 		 466 aa  43.9  0.005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.953441  normal  0.0124942 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0066  outer membrane efflux protein  23 
 
 		 436 aa  43.9  0.005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2371  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  24.91 
 
 		 482 aa  43.5  0.007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.774787 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1300  RND efflux system outer membrane lipoprotein  28.24 
 
 		 468 aa  43.1  0.009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.634439  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3212  putative outer membrane protein  27.43 
 
 		 494 aa  43.1  0.009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3004  TolC family type I secretion outer membrane protein  24.19 
 
 		 464 aa  43.1  0.009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.599739 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1570  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  25 
 
 		 473 aa  43.1  0.01  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>