17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_0462 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_0462  outer membrane efflux protein  100 
 
 		 451 aa  899    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3159  outer membrane efflux protein  57.4 
 
 		 445 aa  515  1.0000000000000001e-145  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2617  outer membrane efflux protein  39.91 
 
 		 479 aa  285  9e-76  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.205144  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1159  outer membrane efflux protein  33.48 
 
 		 465 aa  233  6e-60  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.78186 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4284  Outer membrane protein-like protein  31.84 
 
 		 480 aa  227  3e-58  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2584  outer membrane efflux protein  33.04 
 
 		 466 aa  225  1e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0423133  decreased coverage  0.00978547 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4012  outer membrane efflux protein  28.54 
 
 		 465 aa  153  5.9999999999999996e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0140035  decreased coverage  0.00198888 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1723  outer membrane efflux protein  23.26 
 
 		 436 aa  57.8  0.0000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3378  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  22.57 
 
 		 470 aa  48.5  0.0002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.469197 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000656  putative outer membrane protein  25.3 
 
 		 500 aa  47.4  0.0006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0284  outer membrane efflux family protein  24.37 
 
 		 518 aa  46.2  0.001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.552621  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2657  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  24.5 
 
 		 473 aa  44.7  0.003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0121184  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5197  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  23.01 
 
 		 492 aa  45.1  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0396933  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2024  RND efflux system outer membrane lipoprotein  20.7 
 
 		 525 aa  43.9  0.007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0689129  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3212  putative outer membrane protein  23.69 
 
 		 494 aa  43.5  0.007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1462  Type I secretion outer membrane protein, TolC  22.76 
 
 		 452 aa  43.5  0.007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1703  RND efflux system outer membrane lipoprotein NodT  26.94 
 
 		 486 aa  43.5  0.008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.416377  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>