More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_4143 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009441  Fjoh_4143  ATPase central domain-containing protein  100 
 
 
243 aa  490  9.999999999999999e-139  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.802818  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2822  AAA ATPase central domain protein  63.25 
 
 
239 aa  305  6e-82  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0522  ATPase central domain-containing protein  38.27 
 
 
391 aa  144  1e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3321  AAA family ATPase  36.99 
 
 
326 aa  134  9.999999999999999e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.81305  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5696  AAA ATPase, central region  37.65 
 
 
389 aa  125  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.352624 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0086  ATPase  36.41 
 
 
335 aa  125  4.0000000000000003e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.244566  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3822  ATPase central domain-containing protein  34.38 
 
 
322 aa  125  5e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0247422 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4460  ATPase central domain-containing protein  30.24 
 
 
320 aa  125  8.000000000000001e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3738  ATPase central domain-containing protein  34.16 
 
 
387 aa  124  1e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1467  AAA ATPase, central region  29.84 
 
 
332 aa  124  2e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1490  ATPase central domain-containing protein  29.84 
 
 
332 aa  124  2e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1692  putative ATPase  36.26 
 
 
322 aa  122  7e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.593174 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5573  AAA ATPase, central region  32.19 
 
 
323 aa  122  8e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.292045  normal 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5976  ATPase central domain-containing protein  32.19 
 
 
323 aa  122  8e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3852  AAA ATPase central domain protein  35.38 
 
 
335 aa  121  9e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0097  ATPase central domain-containing protein  30.3 
 
 
338 aa  120  9.999999999999999e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.622643  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1081  AAA ATPase, central region  30.7 
 
 
360 aa  120  1.9999999999999998e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00636  ATPase, AAA family  36.36 
 
 
325 aa  117  9.999999999999999e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.113631  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2522  ATPase central domain-containing protein  29.44 
 
 
324 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2254  ATPase of the AAA+ class  36.36 
 
 
321 aa  117  1.9999999999999998e-25  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1971  ATPase central domain-containing protein  35.33 
 
 
390 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.68669  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0449  AAA ATPase, central region  38.31 
 
 
335 aa  116  3e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1642  AAA-family ATPase  33.33 
 
 
308 aa  116  3.9999999999999997e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.722719  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4254  AAA ATPase central domain protein  30.32 
 
 
332 aa  115  6e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.656455  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2442  ATPase central domain-containing protein  34.71 
 
 
388 aa  115  6e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3059  ATPase central domain-containing protein  33.7 
 
 
363 aa  115  6.9999999999999995e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.96383  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3794  AAA ATPase, central region  33.33 
 
 
369 aa  115  6.9999999999999995e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.437647  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2097  AAA ATPase central domain protein  33.93 
 
 
369 aa  115  7.999999999999999e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7319  ATPase central domain-containing protein  32.31 
 
 
355 aa  115  8.999999999999998e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.415671  normal  0.136646 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2857  ATPase central domain-containing protein  33.33 
 
 
328 aa  115  8.999999999999998e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0386  AAA ATPase central domain protein  35.56 
 
 
327 aa  114  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.156492 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4892  AAA ATPase central domain protein  33.33 
 
 
326 aa  113  3e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2677  ATPase central domain-containing protein  35.93 
 
 
328 aa  113  3e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.681731 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5901  AAA ATPase central domain protein  28.78 
 
 
352 aa  112  4.0000000000000004e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.777397 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2298  ATPase central domain-containing protein  37.42 
 
 
345 aa  112  5e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00265806 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5489  AAA ATPase central domain protein  31.98 
 
 
336 aa  112  6e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.243939  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4145  ATPase central domain-containing protein  36.71 
 
 
388 aa  111  1.0000000000000001e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0147452 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4276  ATPase central domain-containing protein  33.15 
 
 
327 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6418  AAA ATPase, central region  36.69 
 
 
405 aa  110  2.0000000000000002e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.255051  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2640  ATPase central domain-containing protein  36.36 
 
 
332 aa  110  2.0000000000000002e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.288063  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4417  ATPase central domain-containing protein  33.15 
 
 
327 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0291  AAA ATPase  34.44 
 
 
370 aa  109  3e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00325104  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2326  ATPase central domain-containing protein  36.36 
 
 
419 aa  109  4.0000000000000004e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2659  AAA ATPase central domain protein  26.61 
 
 
322 aa  109  5e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000788626  hitchhiker  0.00386241 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0961  ATPase central domain-containing protein  31.47 
 
 
336 aa  108  1e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10210  AAA+ family ATPase  30.81 
 
 
336 aa  107  2e-22  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.954892  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0747  AAA ATPase central domain protein  29.82 
 
 
335 aa  107  2e-22  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.425262  normal  0.978944 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1073  AAA ATPase central domain protein  32.42 
 
 
328 aa  107  2e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.984194  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3671  ATPase central domain-containing protein  30.61 
 
 
330 aa  106  3e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3503  AAA ATPase, central region  33.93 
 
 
348 aa  106  3e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.238924 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3109  putative ATPase  30.77 
 
 
366 aa  105  5e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.351146  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0190  ATPase central domain-containing protein  35.87 
 
 
425 aa  105  7e-22  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.384028  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3536  ATPase central domain-containing protein  29.95 
 
 
336 aa  104  1e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.22928 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2089  AAA ATPase  30.1 
 
 
336 aa  103  2e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.765117 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2215  AAA ATPase central domain protein  36.05 
 
 
451 aa  102  4e-21  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0998186  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1291  ATPase central domain-containing protein  34.32 
 
 
328 aa  102  4e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.262565  normal  0.0615786 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4803  ATPase central domain-containing protein  33.99 
 
 
328 aa  102  5e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3863  ATPase central domain-containing protein  34.52 
 
 
329 aa  102  6e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  unclonable  0.00000266484 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1585  AAA ATPase, central domain-containing protein  34.52 
 
 
329 aa  102  6e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4229  ATPase central domain-containing protein  30.86 
 
 
328 aa  101  1e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1955  AAA ATPase  35.5 
 
 
430 aa  100  1e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2108  AAA ATPase central domain protein  31.82 
 
 
367 aa  101  1e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.347982  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0735  AAA ATPase central domain protein  32.24 
 
 
459 aa  100  2e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1958  AAA ATPase central domain protein  33.83 
 
 
468 aa  100  2e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.268075 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0513  AAA ATPase, central region  33.13 
 
 
401 aa  99.4  4e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2775  ATPase central domain-containing protein  33.9 
 
 
325 aa  99.8  4e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.36839  normal  0.706454 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5327  ATPase central domain-containing protein  32.07 
 
 
327 aa  99  5e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.449619  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3431  AAA ATPase central domain protein  35.84 
 
 
477 aa  99  6e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1301  AAA ATPase central domain protein  33.33 
 
 
493 aa  98.6  7e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1017  hypothetical protein  35.09 
 
 
427 aa  95.9  6e-19  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2583  AAA ATPase central domain protein  33.67 
 
 
419 aa  94.4  1e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.450798 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0137  AAA ATPase central domain protein  31.73 
 
 
577 aa  94.7  1e-18  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3020  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  37.2 
 
 
709 aa  93.6  2e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2338  AAA ATPase, central region  32.67 
 
 
425 aa  94  2e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2089  ATPase central domain-containing protein  35.44 
 
 
428 aa  93.6  3e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2996  AAA ATPase, central region  34.3 
 
 
478 aa  93.2  3e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2258  AAA ATPase central domain protein  31.09 
 
 
680 aa  92  7e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.226213  hitchhiker  0.00277333 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1549  ATPase, AAA family protein  28.72 
 
 
570 aa  90.5  2e-17  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.974713  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0529  cell division cycle protein 48-like protein  34.32 
 
 
426 aa  90.5  2e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1833  AAA ATPase  26.72 
 
 
578 aa  90.9  2e-17  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.735306  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3168  ATPase central domain-containing protein  32.67 
 
 
434 aa  90.1  3e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0578626  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1774  cysteine synthase A  30.1 
 
 
580 aa  90.1  3e-17  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0393214  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3934  AAA ATPase central domain protein  31.96 
 
 
450 aa  89.4  5e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.158027  normal  0.185322 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0401  ATPase, AAA family protein  29.67 
 
 
570 aa  89.4  5e-17  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0165  putative ATPase protein  36.88 
 
 
772 aa  89  6e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0426  ATPase, AAA family protein  29.67 
 
 
570 aa  89  7e-17  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0486  ATPase central domain-containing protein  33.16 
 
 
424 aa  89  7e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1579  ATPase, AAA family protein  29.67 
 
 
570 aa  88.6  9e-17  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0659  AAA ATPase central domain protein  30.77 
 
 
442 aa  87.8  1e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0372478  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0362  ATPase central domain-containing protein  30.77 
 
 
448 aa  87.8  1e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND04040  ATPase, putative  32.72 
 
 
370 aa  87.8  2e-16  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4120  AAA ATPase central domain protein  35.51 
 
 
466 aa  87  2e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0052109  hitchhiker  0.000242019 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3136  AAA ATPase, central region  31.22 
 
 
478 aa  87  2e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1943  AAA ATPase central domain protein  32.32 
 
 
619 aa  86.7  3e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.00697304  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2559  AAA ATPase central domain protein  30.11 
 
 
450 aa  86.3  4e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.585202  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1669  AAA ATPase central domain protein  30.11 
 
 
450 aa  86.3  4e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1049  elongation factor P  34.15 
 
 
432 aa  86.3  4e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2106  AAA ATPase  30.19 
 
 
371 aa  86.3  4e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0500  AAA family ATPase  37.12 
 
 
351 aa  85.9  6e-16  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.0781793  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2330  AAA ATPase central domain protein  33.71 
 
 
458 aa  85.5  7e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>