More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_3825 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_3825  response regulator receiver protein  100 
 
 		 127 aa  258  1e-68  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.44747  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3787  response regulator receiver protein  50 
 
 		 125 aa  97.8  4e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3884  response regulator receiver protein  35.2 
 
 		 134 aa  81.6  0.000000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.110956  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3201  response regulator receiver protein  35.77 
 
 		 150 aa  75.9  0.0000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4841  response regulator receiver protein  36.07 
 
 		 149 aa  72  0.000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1900  response regulator  36.29 
 
 		 148 aa  68.6  0.00000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.176755  normal  0.0491434 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3545  response regulator for Gln (sensor glnL) (nitrogen regulator I, NRI)  34.15 
 
 		 148 aa  68.6  0.00000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.000295304  normal  0.0892706 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2513  response regulator receiver protein  32.52 
 
 		 149 aa  65.1  0.0000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.321661  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2317  response regulator receiver protein  34.68 
 
 		 149 aa  63.5  0.000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3821  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 151 aa  61.6  0.000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.305029  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2652  response regulator receiver protein  35 
 
 		 242 aa  60.8  0.000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0337  response regulator receiver protein  36.51 
 
 		 126 aa  60.5  0.000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.081011  hitchhiker  0.000378914 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2328  response regulator receiver protein  33.61 
 
 		 157 aa  60.5  0.000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5179  response regulator receiver protein  30.58 
 
 		 292 aa  59.3  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.172349 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3183  response regulator receiver protein  39.52 
 
 		 147 aa  58.9  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2436  response regulator receiver protein  35.38 
 
 		 144 aa  58.9  0.00000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.287992  normal  0.438631 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1288  response regulator receiver domain-containing protein  32.31 
 
 		 137 aa  58.5  0.00000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0148  response regulator, CheY-like  28.33 
 
 		 145 aa  57.8  0.00000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3788  response regulator receiver protein  39.29 
 
 		 152 aa  57  0.00000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1357  response regulator receiver protein  34.13 
 
 		 148 aa  57  0.00000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.463554  normal  0.0634619 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2385  response regulator receiver domain-containing protein  32.28 
 
 		 137 aa  56.6  0.0000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.849023  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3486  response regulator receiver protein  31.5 
 
 		 149 aa  56.6  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1538  response regulator receiver protein  33.06 
 
 		 161 aa  55.5  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3776  response regulator receiver domain-containing protein  30 
 
 		 120 aa  55.8  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.143561 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2566  two component signal transduction response regulator  28.36 
 
 		 151 aa  55.8  0.0000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11533  Response regulator receiver domain protein (CheY)  36.29 
 
 		 137 aa  55.8  0.0000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  decreased coverage  0.00681929  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2877  response regulator receiver domain-containing protein  27.27 
 
 		 154 aa  55.5  0.0000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5055  response regulator receiver protein  34.88 
 
 		 124 aa  54.3  0.0000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000148317  normal  0.0527856 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3218  response regulator receiver domain-containing protein  30.6 
 
 		 150 aa  54.3  0.0000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000302211  hitchhiker  0.000261654 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0031  response regulator receiver protein  27.2 
 
 		 243 aa  54.7  0.0000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3567  response regulator receiver protein  32.56 
 
 		 148 aa  54.3  0.0000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3011  response regulator receiver protein  31.11 
 
 		 145 aa  54.3  0.0000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0415054  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3189  twitching motility protein  30.51 
 
 		 121 aa  54.7  0.0000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.612166  normal  0.249154 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3361  response regulator receiver protein  29.66 
 
 		 168 aa  54.3  0.0000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.937091  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4337  response regulator receiver protein  32.31 
 
 		 141 aa  53.9  0.0000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.350123  hitchhiker  0.000570677 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2528  response regulator receiver protein  30.77 
 
 		 145 aa  53.9  0.0000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3512  response regulator receiver domain-containing protein  26.36 
 
 		 150 aa  53.5  0.0000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.592796  normal  0.130265 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0507  response regulator receiver protein  34.48 
 
 		 299 aa  53.5  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01274  putative two-component response regulator  33.08 
 
 		 150 aa  53.1  0.000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4625  response regulator receiver protein  32 
 
 		 121 aa  53.1  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.635313  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3020  response regulator receiver protein  28 
 
 		 121 aa  52.4  0.000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.447611  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3574  two component transcriptional regulator, LuxR family  32.5 
 
 		 301 aa  52.4  0.000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0249095  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0054  response regulator of ato, ornithine decarboxylase antizyme (sensor ATOS)  28.03 
 
 		 141 aa  52.4  0.000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00225376 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3744  response regulator receiver protein  30.7 
 
 		 134 aa  52.4  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.139387  hitchhiker  0.00363561 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3577  response regulator receiver protein  28 
 
 		 121 aa  52  0.000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.400966  normal  0.141746 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2900  response regulator receiver protein  28 
 
 		 121 aa  52  0.000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.197839  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0902  response regulator receiver protein  28 
 
 		 121 aa  52.8  0.000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.844306 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1573  response regulator receiver protein  28.57 
 
 		 121 aa  52  0.000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.146471 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4725  response regulator receiver protein  28.8 
 
 		 138 aa  52  0.000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0751  response regulator receiver protein  31.71 
 
 		 121 aa  52  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0722  response regulator receiver protein  31.71 
 
 		 121 aa  52  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4229  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  33.05 
 
 		 383 aa  52  0.000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.599633  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1524  response regulator receiver  26.72 
 
 		 135 aa  51.2  0.000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.847446  normal  0.544157 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0163  response regulator receiver domain-containing protein  30.95 
 
 		 137 aa  51.2  0.000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2257  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 120 aa  51.2  0.000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1842  response regulator receiver protein  24.39 
 
 		 122 aa  51.2  0.000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.808404  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3583  response regulator receiver protein  33.05 
 
 		 125 aa  51.2  0.000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1600  two component transcriptional regulator  32.46 
 
 		 224 aa  51.2  0.000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000237714  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2164  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 140 aa  50.8  0.000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5228  two component transcriptional regulator  28.79 
 
 		 229 aa  50.8  0.000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.661336  normal  0.450139 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5367  two component transcriptional regulator  28.79 
 
 		 229 aa  50.8  0.000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.400776 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0154  two component transcriptional regulator  28.79 
 
 		 229 aa  50.8  0.000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.596099 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3970  response regulator receiver protein  26.83 
 
 		 121 aa  50.8  0.000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0244969 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4408  two component transcriptional regulator  28.79 
 
 		 229 aa  50.8  0.000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0897949 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5320  winged helix family two component transcriptional regulator  28.79 
 
 		 242 aa  50.8  0.000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.023746 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2551  response regulator receiver domain-containing protein  30.4 
 
 		 121 aa  50.8  0.000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3018  response regulator receiver protein  31.17 
 
 		 123 aa  50.4  0.000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.454082 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0824  response regulator receiver protein  28.8 
 
 		 122 aa  50.8  0.000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0263767  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5237  response regulator receiver protein  29.27 
 
 		 136 aa  50.4  0.000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.46611  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6623  two component transcriptional regulator, LytTR family  32.26 
 
 		 258 aa  50.4  0.000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0991065  normal  0.080317 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3324  response regulator receiver protein  31.62 
 
 		 143 aa  49.7  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0104  response regulator, putative  27.64 
 
 		 129 aa  49.7  0.00001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8462  response regulator receiver protein  31.3 
 
 		 149 aa  49.7  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5032  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  27.27 
 
 		 229 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.330128 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3898  response regulator receiver  27.78 
 
 		 121 aa  50.1  0.00001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1791  response regulator receiver protein  33.77 
 
 		 131 aa  49.7  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02637  regulatory protein PilH family  27.87 
 
 		 128 aa  50.1  0.00001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04305  two-component system regulatory protein  30.6 
 
 		 146 aa  49.7  0.00001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3353  response regulator receiver protein  27.2 
 
 		 121 aa  50.1  0.00001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.392561  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2139  CheY-like chemotaxis protein, response regulator receiver  27.2 
 
 		 155 aa  49.7  0.00001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.109074  normal  0.326223 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3767  response regulator receiver protein  28.69 
 
 		 149 aa  49.7  0.00001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5477  phosphate regulon transcriptional regulatory protein PhoB  27.27 
 
 		 229 aa  49.7  0.00002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2540  response regulator receiver protein  29.13 
 
 		 150 aa  48.9  0.00002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1192  response regulator receiver domain-containing protein  27.21 
 
 		 147 aa  49.3  0.00002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0582118  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1560  response regulator receiver domain-containing protein  31.78 
 
 		 143 aa  49.3  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.126493 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1704  response regulator receiver  29.13 
 
 		 139 aa  49.3  0.00002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.635187  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5606  two component transcriptional regulator  28.03 
 
 		 229 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0776  response regulator receiver domain-containing protein  28 
 
 		 122 aa  48.9  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0195762  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1372  response regulator receiver domain-containing protein  28.8 
 
 		 121 aa  49.7  0.00002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0313107  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0591  two component LuxR family transcriptional regulator  28.7 
 
 		 301 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.477799  hitchhiker  0.00469436 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48520  phosphate regulon response regulator; PhoB  28.03 
 
 		 229 aa  48.9  0.00002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0667889  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1137  response regulator receiver domain-containing protein  27.2 
 
 		 121 aa  48.9  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.635456 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0912  response regulator receiver protein  27.27 
 
 		 118 aa  49.3  0.00002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.616011 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0828  response regulator receiver protein  28 
 
 		 122 aa  49.3  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000089442  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2451  response regulator receiver  28.89 
 
 		 148 aa  48.5  0.00003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.694561  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4420  response regulator receiver protein  28.46 
 
 		 149 aa  48.5  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.390394 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3740  response regulator receiver protein  34.12 
 
 		 166 aa  48.1  0.00003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1941  response regulator receiver domain-containing protein  28.83 
 
 		 156 aa  48.5  0.00003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5514  two component LuxR family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 305 aa  48.5  0.00003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.211273 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0314  histidine kinase  28.91 
 
 		 531 aa  48.5  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>