More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_2257 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_2257  response regulator receiver protein  100 
 
 		 120 aa  245  2e-64  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0575  response regulator receiver protein  71.79 
 
 		 117 aa  181  2.0000000000000003e-45  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0870  response regulator receiver protein  64.96 
 
 		 117 aa  174  3e-43  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.226165  normal  0.635424 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2719  response regulator receiver protein  63.79 
 
 		 142 aa  167  7e-41  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.617775 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3714  response regulator receiver domain-containing protein  62.71 
 
 		 131 aa  165  2e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2551  response regulator receiver protein  62.07 
 
 		 322 aa  162  1.0000000000000001e-39  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0869  response regulator receiver protein  61.34 
 
 		 119 aa  146  8e-35  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.588002  normal  0.840358 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2592  two component transcriptional regulator, Fis family  46.15 
 
 		 128 aa  124  4.0000000000000003e-28  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2411  response regulator receiver protein  36.75 
 
 		 138 aa  100  6e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.133639  normal  0.234327 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3956  response regulator receiver protein  40.91 
 
 		 128 aa  82.4  0.000000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.314568 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1062  response regulator receiver protein  33.9 
 
 		 120 aa  80.5  0.000000000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.58489  hitchhiker  0.0000344775 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0221  response regulator receiver domain-containing protein  35.9 
 
 		 118 aa  79  0.00000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3713  response regulator receiver domain-containing protein  36.63 
 
 		 153 aa  77.8  0.00000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2002  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.06 
 
 		 306 aa  77  0.00000000000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1201  response regulator receiver protein  38.1 
 
 		 135 aa  77  0.00000000000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0883705  hitchhiker  0.00883957 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1526  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.54 
 
 		 975 aa  76.6  0.0000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0298  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  37.96 
 
 		 331 aa  75.9  0.0000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.7054  normal  0.177262 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0301  two component LuxR family transcriptional regulator  30 
 
 		 231 aa  75.9  0.0000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.54347  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2987  LuxR family two component transcriptional regulator  32.5 
 
 		 231 aa  75.5  0.0000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0213  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.61 
 
 		 974 aa  75.1  0.0000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0934932  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3039  response regulator receiver  33.88 
 
 		 121 aa  75.1  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.403093  normal  0.253409 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2563  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  36.97 
 
 		 935 aa  74.7  0.0000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.851477 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1052  sensory transduction histidine kinase  35.96 
 
 		 1046 aa  74.3  0.0000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2412  response regulator receiver domain-containing protein  33.06 
 
 		 121 aa  74.3  0.0000000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.148654 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3444  response regulator receiver protein  38.6 
 
 		 120 aa  74.3  0.0000000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3309  response regulator receiver domain-containing protein  33.06 
 
 		 121 aa  73.9  0.0000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0791773  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3542  response regulator receiver protein  33.06 
 
 		 121 aa  73.6  0.0000000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1504  two component transcriptional regulator  33.6 
 
 		 231 aa  73.6  0.0000000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.263867  normal  0.57819 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3907  response regulator receiver protein  39.09 
 
 		 125 aa  73.6  0.0000000000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6680  response regulator receiver protein  30.65 
 
 		 126 aa  73.2  0.000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1749  two component response regulator  30.89 
 
 		 123 aa  73.2  0.000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.417168  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3985  response regulator receiver protein  38.18 
 
 		 125 aa  72.8  0.000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1431  response regulator receiver  32.23 
 
 		 121 aa  72.8  0.000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0981  two component transcriptional regulator, LuxR family  30.83 
 
 		 221 aa  73.6  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.416641 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3334  response regulator receiver protein  37.72 
 
 		 120 aa  73.2  0.000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1347  response regulator receiver protein  30.89 
 
 		 123 aa  73.2  0.000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.57835  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0356  response regulator receiver protein  34.75 
 
 		 121 aa  73.2  0.000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0780111  normal  0.957515 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5134  response regulator receiver protein  36.07 
 
 		 122 aa  73.2  0.000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0135031  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5041  response regulator receiver protein  33.9 
 
 		 121 aa  72.8  0.000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3548  response regulator receiver protein  38.05 
 
 		 117 aa  72.8  0.000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0400953 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2308  response regulator receiver protein  32.2 
 
 		 123 aa  72.4  0.000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3844  response regulator receiver domain-containing protein  38.18 
 
 		 124 aa  72.4  0.000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7418  response regulator receiver protein  30.65 
 
 		 126 aa  72.8  0.000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.149776  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2443  response regulator receiver domain-containing protein  32.23 
 
 		 121 aa  72.8  0.000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.377248  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3499  transcriptional regulator LuxR family  31.67 
 
 		 312 aa  72.4  0.000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2309  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  37.96 
 
 		 434 aa  71.6  0.000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.484645  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1392  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase  37.93 
 
 		 584 aa  71.6  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.623748  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4747  putative response regulator in two-component regulatory system (CheY-like protein)  31.4 
 
 		 121 aa  71.6  0.000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0229347  normal  0.575549 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4627  two component transcriptional regulator, LuxR family  28.33 
 
 		 226 aa  71.6  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1850  response regulator receiver protein  38.53 
 
 		 126 aa  71.6  0.000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.549411  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1740  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.96 
 
 		 225 aa  71.6  0.000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000204942  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3764  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.04 
 
 		 917 aa  71.6  0.000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.432635  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3000  response regulator receiver protein  33.06 
 
 		 124 aa  71.6  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5466  stage 0 sporulation protein F  35.25 
 
 		 122 aa  71.2  0.000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0750811  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5514  sporulation initiation phosphotransferase F  35.25 
 
 		 122 aa  71.2  0.000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000170867  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5185  stage 0 sporulation protein F  35.25 
 
 		 122 aa  71.2  0.000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0413406  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5020  stage 0 sporulation protein F  35.25 
 
 		 122 aa  71.2  0.000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000180816  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5036  stage 0 sporulation protein F  35.25 
 
 		 122 aa  71.2  0.000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000486089  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5459  sporulation initiation phosphotransferase F  35.25 
 
 		 122 aa  71.2  0.000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000856307  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5581  stage 0 sporulation protein F  35.25 
 
 		 122 aa  71.2  0.000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0132264  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3094  response regulator receiver protein  34.78 
 
 		 138 aa  71.2  0.000000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0651  response regulator receiver protein  36.21 
 
 		 124 aa  71.2  0.000000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.747314  normal  0.207901 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2397  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  37.96 
 
 		 434 aa  71.6  0.000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.593336  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3737  two component transcriptional regulator  34.19 
 
 		 231 aa  71.2  0.000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00273603 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0090  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.04 
 
 		 228 aa  71.2  0.000000000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5429  sporulation initiation phosphotransferase F  35.25 
 
 		 122 aa  71.2  0.000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.26925e-31 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0925  response regulator receiver protein  30.08 
 
 		 123 aa  71.2  0.000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5493  sporulation initiation phosphotransferase F  35.25 
 
 		 122 aa  71.2  0.000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000162821  unclonable  2.17721e-26 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0508  response regulator receiver domain-containing protein  35.04 
 
 		 121 aa  71.2  0.000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.481314  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3633  response regulator receiver domain-containing protein  34.51 
 
 		 120 aa  70.9  0.000000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.480345  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3898  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.4 
 
 		 1003 aa  70.9  0.000000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.504038  normal  0.0804481 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3195  response regulator receiver protein  34.78 
 
 		 138 aa  71.2  0.000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3248  response regulator receiver protein  33.9 
 
 		 121 aa  70.9  0.000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.500247 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4451  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  31.71 
 
 		 314 aa  71.2  0.000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.586345 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2238  response regulator receiver protein  40.52 
 
 		 140 aa  71.2  0.000000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0218186  hitchhiker  0.00000354209 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0804  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  31.71 
 
 		 314 aa  70.9  0.000000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.504991 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1937  response regulator receiver protein  37.17 
 
 		 117 aa  70.9  0.000000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.29733  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0702  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  37.04 
 
 		 331 aa  70.9  0.000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.140022  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2995  response regulator receiver domain-containing protein  35.96 
 
 		 135 aa  70.9  0.000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0221  GAF sensor hybrid histidine kinase  31.86 
 
 		 1651 aa  70.9  0.000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1381  response regulator receiver protein  30.08 
 
 		 123 aa  70.9  0.000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.427616 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1289  response regulator receiver protein  30.08 
 
 		 123 aa  70.9  0.000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0254052  hitchhiker  0.00394342 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1632  response regulator receiver  33.87 
 
 		 123 aa  70.5  0.000000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3857  response regulator receiver protein  36.36 
 
 		 122 aa  70.5  0.000000000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.161717  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0135  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  32.17 
 
 		 858 aa  70.5  0.000000000007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.711395  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2233  response regulator receiver protein  36.44 
 
 		 131 aa  70.5  0.000000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.250128  normal  0.471472 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3485  two component transcriptional regulator  35.54 
 
 		 236 aa  70.1  0.000000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0473  response regulator receiver protein  31.36 
 
 		 121 aa  70.1  0.000000000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.950452  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0819  LuxR family two component transcriptional regulator  33.33 
 
 		 227 aa  70.1  0.000000000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.633548  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4991  response regulator receiver protein  32.2 
 
 		 121 aa  69.7  0.00000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.353726  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1649  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  39.32 
 
 		 479 aa  69.7  0.00000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4086  response regulator receiver protein  39.32 
 
 		 123 aa  70.1  0.00000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0365078  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2562  response regulator receiver Signal transduction histidine kinase  37.61 
 
 		 437 aa  70.1  0.00000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2495  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  34.55 
 
 		 1362 aa  70.1  0.00000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4865  response regulator receiver protein  32.2 
 
 		 121 aa  69.7  0.00000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.321258  normal  0.0275279 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2977  response regulator receiver domain-containing protein  32.5 
 
 		 303 aa  70.1  0.00000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.13601 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1570  transcriptional regulator, XRE family  33.88 
 
 		 233 aa  69.7  0.00000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3680  two component transcriptional regulator, LuxR family  30.83 
 
 		 223 aa  69.7  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.233635 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2718  response regulator receiver protein  35.23 
 
 		 133 aa  69.7  0.00000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.617775 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2430  two component transcriptional regulator, LuxR family  30.83 
 
 		 223 aa  69.7  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>