More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_0575 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013173  Dbac_0575  response regulator receiver protein  100 
 
 		 117 aa  237  4e-62  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2257  response regulator receiver protein  71.79 
 
 		 120 aa  181  2.0000000000000003e-45  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0870  response regulator receiver protein  64.96 
 
 		 117 aa  169  7.999999999999999e-42  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.226165  normal  0.635424 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2719  response regulator receiver protein  62.93 
 
 		 142 aa  161  4.0000000000000004e-39  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.617775 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3714  response regulator receiver domain-containing protein  64.1 
 
 		 131 aa  158  2e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2551  response regulator receiver protein  61.21 
 
 		 322 aa  154  5.0000000000000005e-37  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0869  response regulator receiver protein  59.83 
 
 		 119 aa  132  9.999999999999999e-31  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.588002  normal  0.840358 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2592  two component transcriptional regulator, Fis family  41.74 
 
 		 128 aa  114  3e-25  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2411  response regulator receiver protein  36.75 
 
 		 138 aa  104  4e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.133639  normal  0.234327 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1526  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.84 
 
 		 975 aa  77.4  0.00000000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4991  response regulator receiver protein  34.75 
 
 		 121 aa  76.6  0.0000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.353726  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1722  histidine kinase  35.9 
 
 		 1361 aa  76.6  0.0000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.169999 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5041  response regulator receiver protein  34.75 
 
 		 121 aa  76.6  0.0000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4865  response regulator receiver protein  34.75 
 
 		 121 aa  76.6  0.0000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.321258  normal  0.0275279 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2495  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  35.9 
 
 		 1362 aa  76.6  0.0000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1632  response regulator receiver  36.07 
 
 		 123 aa  75.9  0.0000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3334  response regulator receiver protein  36.36 
 
 		 120 aa  75.1  0.0000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5033  type IV pilus response regulator PilH  33.9 
 
 		 121 aa  74.7  0.0000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0251  response regulator receiver protein  38.26 
 
 		 126 aa  74.7  0.0000000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.102048 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1850  response regulator receiver protein  39.82 
 
 		 126 aa  74.7  0.0000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.549411  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0489  response regulator receiver  33.9 
 
 		 121 aa  74.3  0.0000000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.646514  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3778  response regulator receiver domain-containing protein  38.46 
 
 		 124 aa  74.3  0.0000000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0509  twitching motility protein PilH  33.9 
 
 		 121 aa  73.9  0.0000000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05330  twitching motility protein PilH  33.9 
 
 		 121 aa  73.9  0.0000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3764  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.61 
 
 		 917 aa  73.9  0.0000000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.432635  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0404  response regulator receiver protein  33.05 
 
 		 121 aa  73.6  0.0000000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0473  response regulator receiver protein  32.2 
 
 		 121 aa  73.6  0.0000000000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.950452  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5307  response regulator receiver domain-containing protein  33.05 
 
 		 121 aa  73.2  0.000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0137607  normal  0.215998 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2399  response regulator receiver protein  33.63 
 
 		 121 aa  73.2  0.000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.732485 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3444  response regulator receiver protein  36.36 
 
 		 120 aa  72  0.000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1052  sensory transduction histidine kinase  36.84 
 
 		 1046 aa  72.4  0.000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3713  response regulator receiver domain-containing protein  30.23 
 
 		 153 aa  71.6  0.000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1243  response regulator receiver domain-containing protein  37.07 
 
 		 121 aa  71.2  0.000000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.253807 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5207  winged helix family two component transcriptional regulator  34.21 
 
 		 247 aa  71.2  0.000000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2784  response regulator receiver protein  33.06 
 
 		 125 aa  70.9  0.000000000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0945133  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0669  response regulator receiver protein  32.79 
 
 		 123 aa  70.9  0.000000000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1901  response regulator receiver protein  30.33 
 
 		 125 aa  70.5  0.000000000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1347  response regulator receiver protein  29.75 
 
 		 123 aa  70.5  0.000000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.57835  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2960  response regulator receiver  33.91 
 
 		 190 aa  70.1  0.000000000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0852903  normal  0.915615 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0213  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.78 
 
 		 974 aa  70.1  0.000000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0934932  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0135  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  34.21 
 
 		 858 aa  70.1  0.000000000009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.711395  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0790  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  35.09 
 
 		 466 aa  70.1  0.00000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1889  response regulator receiver protein  38.79 
 
 		 126 aa  70.1  0.00000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2773  response regulator receiver protein  35.34 
 
 		 120 aa  69.7  0.00000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2887  LuxR family two component transcriptional regulator  31.36 
 
 		 225 aa  69.3  0.00000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.526109  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0356  response regulator receiver protein  33.05 
 
 		 121 aa  69.7  0.00000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0780111  normal  0.957515 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1974  response regulator receiver protein  38.79 
 
 		 126 aa  70.1  0.00000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7418  response regulator receiver protein  28.93 
 
 		 126 aa  68.9  0.00000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.149776  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2649  response regulator receiver protein  32.23 
 
 		 122 aa  68.9  0.00000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.857048  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1989  response regulator receiver domain-containing protein  38.79 
 
 		 126 aa  68.6  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5134  response regulator receiver protein  33.61 
 
 		 122 aa  69.3  0.00000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0135031  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0010  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.75 
 
 		 511 aa  68.9  0.00000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5493  sporulation initiation phosphotransferase F  33.61 
 
 		 122 aa  68.6  0.00000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000162821  unclonable  2.17721e-26 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5466  stage 0 sporulation protein F  33.61 
 
 		 122 aa  68.6  0.00000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0750811  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5185  stage 0 sporulation protein F  33.61 
 
 		 122 aa  68.6  0.00000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0413406  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5020  stage 0 sporulation protein F  33.61 
 
 		 122 aa  68.6  0.00000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000180816  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5036  stage 0 sporulation protein F  33.61 
 
 		 122 aa  68.6  0.00000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000486089  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1749  two component response regulator  30.58 
 
 		 123 aa  68.2  0.00000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.417168  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1406  response regulator receiver protein  32.23 
 
 		 121 aa  68.6  0.00000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0894387  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5581  stage 0 sporulation protein F  33.61 
 
 		 122 aa  68.6  0.00000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0132264  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5514  sporulation initiation phosphotransferase F  33.61 
 
 		 122 aa  68.6  0.00000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000170867  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2903  response regulator receiver protein  30.51 
 
 		 120 aa  68.6  0.00000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.629195  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0009  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.75 
 
 		 509 aa  68.6  0.00000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.923259 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3633  response regulator receiver domain-containing protein  33.91 
 
 		 120 aa  68.6  0.00000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.480345  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5459  sporulation initiation phosphotransferase F  33.61 
 
 		 122 aa  68.6  0.00000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000856307  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4150  response regulator receiver protein  31.15 
 
 		 125 aa  68.6  0.00000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.583085 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1496  response regulator receiver protein  28.33 
 
 		 127 aa  68.6  0.00000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.270703 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4374  response regulator receiver protein  29.17 
 
 		 174 aa  68.6  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.45297 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5429  sporulation initiation phosphotransferase F  33.61 
 
 		 122 aa  68.6  0.00000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.26925e-31 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3956  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 128 aa  68.6  0.00000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.314568 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2718  response regulator receiver protein  34.09 
 
 		 133 aa  68.6  0.00000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.617775 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0058  response regulator receiver modulated PilZ sensor protein  35.83 
 
 		 226 aa  68.6  0.00000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000220235 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6680  response regulator receiver protein  28.93 
 
 		 126 aa  68.2  0.00000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1937  response regulator receiver protein  33.63 
 
 		 117 aa  68.2  0.00000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.29733  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3277  response regulator receiver protein  36.04 
 
 		 124 aa  67.8  0.00000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1169  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  37.93 
 
 		 308 aa  67.8  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1098  PAS:GGDEF  37.96 
 
 		 705 aa  67.8  0.00000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3628  two component LuxR family transcriptional regulator  30.51 
 
 		 225 aa  67.8  0.00000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.717242  normal  0.142765 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1110  response regulator receiver domain-containing protein  30.58 
 
 		 208 aa  67.8  0.00000000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00277439  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4462  response regulator receiver protein  33.61 
 
 		 122 aa  67.8  0.00000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.170049  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1139  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  37.93 
 
 		 308 aa  67.8  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0906  response regulator receiver protein  30.58 
 
 		 126 aa  67.8  0.00000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0687715  normal  0.223091 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0614  response regulator receiver protein  39.13 
 
 		 121 aa  67.8  0.00000000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0966  response regulator receiver  30.58 
 
 		 126 aa  67.8  0.00000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.734958  normal  0.0218415 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5113  response regulator receiver protein  32.79 
 
 		 121 aa  67.8  0.00000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4229  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  35.34 
 
 		 383 aa  67.4  0.00000000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.599633  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1866  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  33.62 
 
 		 326 aa  67  0.00000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3898  response regulator receiver  35.09 
 
 		 121 aa  67.4  0.00000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2563  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  32.48 
 
 		 935 aa  67  0.00000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.851477 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0925  response regulator receiver protein  28.93 
 
 		 123 aa  67.4  0.00000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2029  response regulator receiver protein  35.25 
 
 		 124 aa  67.4  0.00000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.371136 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3742  two component transcriptional regulator, winged helix family  32.48 
 
 		 263 aa  67  0.00000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2998  response regulator receiver protein  33.63 
 
 		 377 aa  67  0.00000000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3548  response regulator receiver protein  32.74 
 
 		 117 aa  67  0.00000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0400953 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0393  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.25 
 
 		 227 aa  67  0.00000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.202895 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0009  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 508 aa  67  0.00000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1498  two component transcriptional regulator  33.33 
 
 		 247 aa  66.6  0.0000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.220919  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4472  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 122 aa  66.6  0.0000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.685254  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4317  response regulator receiver domain-containing protein  33.33 
 
 		 122 aa  66.6  0.0000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.619141  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2412  response regulator receiver domain-containing protein  28.93 
 
 		 121 aa  66.6  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.148654 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>