More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_2411 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008751  Dvul_2411  response regulator receiver protein  100 
 
 
138 aa  275  2e-73  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.133639  normal  0.234327 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2592  two component transcriptional regulator, Fis family  69.03 
 
 
128 aa  160  6e-39  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3714  response regulator receiver domain-containing protein  38.52 
 
 
131 aa  110  8.000000000000001e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2551  response regulator receiver protein  37.98 
 
 
322 aa  107  5e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2719  response regulator receiver protein  38.98 
 
 
142 aa  105  2e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.617775 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0575  response regulator receiver protein  36.75 
 
 
117 aa  104  4e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2257  response regulator receiver protein  36.75 
 
 
120 aa  100  6e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0870  response regulator receiver protein  35.9 
 
 
117 aa  98.2  3e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.226165  normal  0.635424 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0869  response regulator receiver protein  41.88 
 
 
119 aa  97.4  6e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.588002  normal  0.840358 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3713  response regulator receiver domain-containing protein  30.83 
 
 
153 aa  65.9  0.0000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2662  two component transcriptional regulator, winged helix family  31.71 
 
 
231 aa  65.5  0.0000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0031  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.36 
 
 
234 aa  65.5  0.0000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1220  response regulator receiver protein  32.26 
 
 
130 aa  63.9  0.0000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3985  response regulator receiver protein  31.2 
 
 
125 aa  63.9  0.0000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0339  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.06 
 
 
1390 aa  63.2  0.000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.726297  normal  0.77171 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0350  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.06 
 
 
1390 aa  63.2  0.000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0937102  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0360  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.06 
 
 
1390 aa  63.2  0.000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.592677 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1504  two component transcriptional regulator  31.3 
 
 
231 aa  62.4  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.263867  normal  0.57819 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3954  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.48 
 
 
1370 aa  62.4  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.364846  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1603  response regulator receiver protein  34.43 
 
 
198 aa  62.8  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.209727  normal  0.483504 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2360  response regulator receiver protein  35.83 
 
 
523 aa  62  0.000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0669  response regulator receiver protein  33.73 
 
 
123 aa  61.6  0.000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0882  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.09 
 
 
230 aa  61.2  0.000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.148935 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0393  two component transcriptional regulator, winged helix family  32.03 
 
 
227 aa  60.8  0.000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.202895 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3907  response regulator receiver protein  30 
 
 
125 aa  60.8  0.000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3737  two component transcriptional regulator  30.53 
 
 
231 aa  60.5  0.000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00273603 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5999  response regulator receiver protein  33.33 
 
 
280 aa  60.5  0.000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1066  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.65 
 
 
222 aa  60.1  0.00000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2806  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  34.19 
 
 
450 aa  60.1  0.00000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1201  response regulator receiver protein  32.74 
 
 
135 aa  60.1  0.00000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0883705  hitchhiker  0.00883957 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3000  response regulator receiver protein  29.17 
 
 
124 aa  59.3  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1245  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family protein  31.36 
 
 
472 aa  59.3  0.00000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.390474  normal  0.0307837 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4210  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.75 
 
 
1110 aa  58.5  0.00000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000219546 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4776  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.33 
 
 
1248 aa  58.2  0.00000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3844  response regulator receiver domain-containing protein  31.25 
 
 
124 aa  58.2  0.00000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3705  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase  28.57 
 
 
628 aa  58.2  0.00000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.567264  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3504  response regulator receiver protein  33.33 
 
 
127 aa  58.2  0.00000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1522  two component transcriptional regulator  36.13 
 
 
227 aa  58.2  0.00000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4285  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.11 
 
 
238 aa  58.2  0.00000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.83647  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2848  nitrogen regulation protein NtrX, putative  31.93 
 
 
455 aa  57.8  0.00000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.754871  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1916  two component transcriptional regulator  29.5 
 
 
228 aa  57.8  0.00000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.400732  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2468  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.76 
 
 
1049 aa  57.4  0.00000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.858637  normal  0.0946099 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2692  two component transcriptional regulator, winged helix family  32.5 
 
 
229 aa  57.4  0.00000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1931  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.58 
 
 
1385 aa  57.4  0.00000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2703  two component transcriptional regulator  35.54 
 
 
241 aa  57  0.00000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.790666  normal  0.110517 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1472  response regulator receiver protein  31.97 
 
 
122 aa  57  0.00000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.413604  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5929  two component AraC family transcriptional regulator  28.68 
 
 
277 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.473719  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2942  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  35.29 
 
 
702 aa  56.6  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.897088  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0493  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  28.57 
 
 
440 aa  56.2  0.0000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.274957  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1652  DNA-binding response regulator CreB  33.07 
 
 
232 aa  56.2  0.0000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1789  response regulator receiver protein  30.25 
 
 
128 aa  56.6  0.0000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1392  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase  28.81 
 
 
584 aa  56.2  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.623748  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6071  two component AraC family transcriptional regulator  30.53 
 
 
271 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1724  response regulator receiver protein  30.25 
 
 
128 aa  56.6  0.0000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.999633  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2649  response regulator receiver protein  27.71 
 
 
122 aa  56.6  0.0000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.857048  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1631  two component transcriptional regulator, winged helix family  30.3 
 
 
275 aa  56.2  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1016  sensory box sensor histidine kinase/response regulator  28.97 
 
 
1258 aa  55.8  0.0000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1850  response regulator receiver protein  32.2 
 
 
126 aa  55.8  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.549411  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2420  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.75 
 
 
933 aa  55.5  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.42243  hitchhiker  0.0000359369 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7173  two component AraC family transcriptional regulator  28.57 
 
 
268 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.495812 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1597  adenylate/guanylate cyclase with GAF sensor(s)  32.26 
 
 
981 aa  55.5  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000711164  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0098  two component transcriptional regulator  30.53 
 
 
229 aa  55.5  0.0000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.761303  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0221  GAF sensor hybrid histidine kinase  31.86 
 
 
1651 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4929  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.62 
 
 
226 aa  55.5  0.0000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6198  two component AraC family transcriptional regulator  27.91 
 
 
277 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1745  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family protein  29.66 
 
 
468 aa  56.2  0.0000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0442  response regulator receiver protein  32.77 
 
 
126 aa  55.1  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0489543  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5339  two component transcriptional regulator, winged helix family  32.58 
 
 
222 aa  55.1  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0301  two component LuxR family transcriptional regulator  25.55 
 
 
231 aa  55.5  0.0000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.54347  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5566  GAF sensor hybrid histidine kinase  31.31 
 
 
1203 aa  55.1  0.0000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0247633 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3309  response regulator receiver domain-containing protein  31.4 
 
 
121 aa  55.1  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0791773  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3355  two component Fis family transcriptional regulator  29.66 
 
 
122 aa  55.5  0.0000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1497  two component transcriptional regulator  32.77 
 
 
263 aa  55.1  0.0000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0608  response regulator receiver protein  28.24 
 
 
398 aa  55.1  0.0000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.160271 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4175  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  32.17 
 
 
1083 aa  55.5  0.0000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0804  two component LuxR family transcriptional regulator  27.21 
 
 
204 aa  55.5  0.0000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0140  response regulator receiver protein  30.36 
 
 
371 aa  54.7  0.0000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3548  GAF sensor hybrid histidine kinase  28.8 
 
 
1942 aa  54.7  0.0000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1280  two component transcriptional regulator  33.33 
 
 
236 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.121052  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3309  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  32.5 
 
 
900 aa  54.7  0.0000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.269875  normal  0.342346 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2054  response regulator receiver protein  33.33 
 
 
140 aa  54.7  0.0000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0880044 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6551  two component transcriptional regulator  33.33 
 
 
236 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.501121  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2208  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.43 
 
 
823 aa  55.1  0.0000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.73393 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2840  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  29.13 
 
 
213 aa  54.7  0.0000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0401204  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2229  response regulator receiver domain-containing protein  37.5 
 
 
129 aa  54.3  0.0000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.737175  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2338  GAF sensor-containing adenylate/guanylate cyclase  28.21 
 
 
1180 aa  54.3  0.0000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0263037  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4152  response regulator receiver protein  29.82 
 
 
122 aa  54.3  0.0000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.237344 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2683  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.46 
 
 
1358 aa  53.9  0.0000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.117306 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1901  response regulator receiver protein  28 
 
 
125 aa  54.3  0.0000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2665  response regulator receiver protein  27.05 
 
 
133 aa  54.3  0.0000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0531061  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4423  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.46 
 
 
1361 aa  54.3  0.0000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.498632 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1722  response regulator receiver protein  30.09 
 
 
123 aa  53.9  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000956357 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4747  putative response regulator in two-component regulatory system (CheY-like protein)  30.23 
 
 
121 aa  53.9  0.0000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0229347  normal  0.575549 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2987  LuxR family two component transcriptional regulator  28.35 
 
 
231 aa  53.9  0.0000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0329  two component transcriptional regulator, winged helix family  30.71 
 
 
231 aa  53.9  0.0000007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7377  two component AraC family transcriptional regulator  27.91 
 
 
278 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0377301  normal  0.284562 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5059  two component transcriptional regulator, winged helix family  31.82 
 
 
222 aa  53.9  0.0000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.118223  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2377  response regulator receiver protein  28.93 
 
 
120 aa  53.9  0.0000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1243  response regulator receiver domain-containing protein  32.5 
 
 
121 aa  53.9  0.0000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.253807 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2143  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  32.1 
 
 
755 aa  53.9  0.0000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>