More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_2665 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012850  Rleg_2665  response regulator receiver protein  100 
 
 		 133 aa  269  9e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0531061  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2336  response regulator receiver protein  94.74 
 
 		 133 aa  255  2e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.103968  normal  0.760096 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1673  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.09 
 
 		 201 aa  117  6e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.619826  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2943  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.09 
 
 		 201 aa  117  6e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2528  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.73 
 
 		 201 aa  115  1.9999999999999998e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0341229 
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_4984  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.73 
 
 		 201 aa  115  1.9999999999999998e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0145131 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2873  two component LuxR family transcriptional regulator  44.96 
 
 		 216 aa  114  3.9999999999999997e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5323  transcriptional regulator two component heavy metal regulatory response ZniR  44.54 
 
 		 206 aa  114  5e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.844748 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1549  LuxR transcriptional regulator  45.45 
 
 		 201 aa  113  7.999999999999999e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.355184  normal  0.152747 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4715  two component LuxR family transcriptional regulator  45.3 
 
 		 196 aa  108  3e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3311  response regulator receiver protein  38.89 
 
 		 321 aa  107  4.0000000000000004e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.479786 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3553  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  46.46 
 
 		 348 aa  103  9e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.528491 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0589  response regulator receiver modulated serine phosphatase  45 
 
 		 371 aa  102  1e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.420228  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2022  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase  39.1 
 
 		 589 aa  98.2  3e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1562  histidine kinase  44.74 
 
 		 1296 aa  98.6  3e-20  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.655639  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5556  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  42.62 
 
 		 352 aa  97.1  6e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.487576  normal  0.0420739 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2980  histidine kinase  43.09 
 
 		 1311 aa  97.1  7e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.229379  normal  0.450681 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0792  histidine kinase  47.32 
 
 		 1378 aa  96.7  1e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.134077 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3862  histidine kinase  42.02 
 
 		 1384 aa  96.3  1e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1040  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  41.6 
 
 		 365 aa  94.7  4e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3764  multi-sensor hybrid histidine kinase  48.7 
 
 		 917 aa  94.4  5e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.432635  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1181  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.83 
 
 		 234 aa  93.6  7e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00335068 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1271  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  41.94 
 
 		 350 aa  93.6  8e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0761  two component transcriptional regulator  37.7 
 
 		 229 aa  92.8  1e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.179681 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1574  histidine kinase  39.5 
 
 		 1378 aa  92.4  2e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.455228  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0804  two component LuxR family transcriptional regulator  38.52 
 
 		 204 aa  92.4  2e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4445  two component transcriptional regulator  36.89 
 
 		 229 aa  92  2e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.14031 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0536  histidine kinase  41.94 
 
 		 1324 aa  91.7  3e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0692259  normal  0.421547 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1836  two component AraC family transcriptional regulator  41.53 
 
 		 1341 aa  91.7  3e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1037  response regulator receiver protein  37.21 
 
 		 247 aa  91.3  4e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3872  histidine kinase  42.11 
 
 		 1373 aa  90.9  5e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0459124  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6369  histidine kinase  40 
 
 		 1366 aa  90.5  7e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4560  histidine kinase  45.22 
 
 		 1313 aa  90.5  7e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.498007  normal  0.022289 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1997  two component transcriptional regulator  42.5 
 
 		 234 aa  89.7  1e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000742772  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5381  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.92 
 
 		 235 aa  89.4  1e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0242785  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0065  response regulator receiver domain-containing protein  37.12 
 
 		 196 aa  89  2e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.670969  normal  0.0252366 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0628  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  39.13 
 
 		 446 aa  88.6  2e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0805  two component transcriptional regulator  39.17 
 
 		 229 aa  89.4  2e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1014  two component transcriptional regulator  39.17 
 
 		 244 aa  88.6  3e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1098  PAS:GGDEF  41.51 
 
 		 705 aa  88.6  3e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4604  histidine kinase  42.86 
 
 		 663 aa  88.6  3e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1214  DNA-binding response regulator KdpE  36.29 
 
 		 237 aa  88.2  3e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000130813  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2180  DNA-binding response regulator  41.09 
 
 		 223 aa  88.2  3e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0299585  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1489  histidine kinase  40.32 
 
 		 1404 aa  88.6  3e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.639294  normal  0.537564 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5387  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.25 
 
 		 236 aa  88.6  3e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1891  DNA-binding response regulator  41.09 
 
 		 223 aa  87.8  4e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0503  two component transcriptional regulator  37.98 
 
 		 223 aa  87.8  4e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0499  two component transcriptional regulator  38.76 
 
 		 223 aa  87  7e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2726  ATP-binding region ATPase domain protein  37.9 
 
 		 1355 aa  87  7e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.119041  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6548  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  38.46 
 
 		 397 aa  86.7  9e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.543575 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2828  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  37.5 
 
 		 410 aa  86.7  9e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4716  DNA-binding response regulator  37.98 
 
 		 223 aa  86.7  1e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4157  winged helix family two component transcriptional regulator  37.4 
 
 		 231 aa  85.9  1e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.507569  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0463  response regulator receiver modulated diguanylate phosphodiesterase  36.22 
 
 		 403 aa  86.7  1e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2464  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.98 
 
 		 229 aa  86.7  1e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1892  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.88 
 
 		 219 aa  86.7  1e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00404304  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0623  DNA-binding response regulator  37.98 
 
 		 223 aa  86.7  1e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4118  nitrogen metabolism transcriptional regulator, NtrC, Fis Family  40.68 
 
 		 469 aa  85.5  2e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0641  DNA-binding response regulator  37.98 
 
 		 223 aa  85.9  2e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0650  DNA-binding response regulator  38.76 
 
 		 223 aa  85.9  2e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4253  nitrogen regulation protein NR(I)  40.68 
 
 		 472 aa  85.5  2e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.177692  normal  0.167125 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0554  DNA-binding response regulator  37.98 
 
 		 223 aa  85.9  2e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1176  two component transcriptional regulator  37.5 
 
 		 229 aa  85.5  2e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.149936 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0496  response regulator  37.98 
 
 		 223 aa  85.9  2e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0498  response regulator  37.98 
 
 		 223 aa  85.9  2e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4344  nitrogen regulation protein NR(I)  40.68 
 
 		 469 aa  85.5  2e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0585  DNA-binding response regulator  37.98 
 
 		 223 aa  85.9  2e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1518  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  33.85 
 
 		 767 aa  85.9  2e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0706082  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5314  nitrogen regulation protein NR(I)  40.68 
 
 		 472 aa  85.5  2e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.111299  normal  0.738695 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1752  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.88 
 
 		 228 aa  85.5  2e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000101966  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2174  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  35.96 
 
 		 474 aa  85.5  2e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0711  DNA-binding response regulator  38.76 
 
 		 223 aa  85.9  2e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1711  two component transcriptional regulator  37.4 
 
 		 231 aa  85.9  2e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3612  response regulator receiver protein  37.07 
 
 		 128 aa  85.9  2e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03753  fused DNA-binding response regulator in two-component regulatory system with GlnL: response regulator/sigma54 interaction protein  40.68 
 
 		 469 aa  85.1  3e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2051  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  36.36 
 
 		 230 aa  85.1  3e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.191031  normal  0.53595 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4148  nitrogen regulation protein NR(I)  40.68 
 
 		 469 aa  85.1  3e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.221467 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4095  nitrogen regulation protein NR(I)  40.68 
 
 		 469 aa  85.1  3e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3308  response regulator receiver protein  34.65 
 
 		 130 aa  85.1  3e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.678314  normal  0.215079 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0136  two component transcriptional regulator  36 
 
 		 248 aa  85.1  3e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03702  hypothetical protein  40.68 
 
 		 469 aa  85.1  3e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4390  nitrogen regulation protein NR(I)  40.68 
 
 		 469 aa  85.1  3e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.127215  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3134  response regulator receiver protein  38.6 
 
 		 200 aa  84.7  4e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1332  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  38.79 
 
 		 306 aa  84.7  4e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0789  response regulator receiver protein  36.22 
 
 		 278 aa  84.3  4e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2951  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  38.79 
 
 		 306 aa  84.7  4e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1965  response regulatory protein, sigma 54 related  38.52 
 
 		 384 aa  84.3  4e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0275961  normal  0.129103 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3258  two component heavy metal response transcriptional regulator  39.5 
 
 		 238 aa  84.7  4e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00206307  normal  0.0675777 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0123  DNA-binding response regulator  33.33 
 
 		 223 aa  84.3  5e-16  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0090  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.29 
 
 		 228 aa  84.3  5e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2687  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  40.71 
 
 		 1013 aa  84.3  5e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.70216  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0436  response regulator receiver protein  39.25 
 
 		 370 aa  84.3  5e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2774  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.5 
 
 		 245 aa  84  6e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1735  histidine kinase  36.09 
 
 		 1343 aa  84  6e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.260049  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1351  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.16 
 
 		 225 aa  84.3  6e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00188361  unclonable  0.0000000206018 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0532  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  38.14 
 
 		 470 aa  84  6e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00706375  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1488  two component transcriptional regulator  36.67 
 
 		 228 aa  84  6e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00208742  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0308  two component transcriptional regulator  36.22 
 
 		 248 aa  84  7e-16  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.030574  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3651  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.85 
 
 		 228 aa  84  7e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0435949 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2852  histidine kinase  37.84 
 
 		 1342 aa  84  7e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.0012841  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>